More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0436 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00611  leucyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 
860 aa  748    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.197817  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2984  leucyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 
860 aa  748    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00147705  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0370  leucyl-tRNA synthetase  45.33 
 
 
864 aa  761    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2209  leucyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 
824 aa  785    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4794  leucyl-tRNA synthetase  47.86 
 
 
868 aa  820    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.232287 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1861  leucyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 
829 aa  780    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.911399  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1191  leucyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 
859 aa  762    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.663748 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1453  leucyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 
887 aa  790    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.721273  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0060  leucyl-tRNA synthetase  47.3 
 
 
838 aa  852    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2744  leucyl-tRNA synthetase  47.62 
 
 
877 aa  769    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.775327 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2145  leucyl-tRNA synthetase  47.32 
 
 
817 aa  779    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.736456  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1722  leucyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 
863 aa  742    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1234  leucyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 
809 aa  642    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2582  leucyl-tRNA synthetase  45.2 
 
 
864 aa  753    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.60297 
 
 
-
 
NC_004310  BR1807  leucyl-tRNA synthetase  63.69 
 
 
877 aa  1165    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.807702  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1174  leucyl-tRNA synthetase  44.52 
 
 
859 aa  743    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4812  leucyl-tRNA synthetase  46.95 
 
 
868 aa  816    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09721  leucyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 
856 aa  714    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.90709  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1071  leucyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 
907 aa  697    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4197  leucyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 
859 aa  723    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2453  leucyl-tRNA synthetase  45.33 
 
 
864 aa  761    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.484774  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1302  leucyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 
823 aa  727    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1301  leucyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 
823 aa  729    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4352  leucyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 
868 aa  809    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.964178  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0576  leucyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 
921 aa  739    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.931447  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0544  leucyl-tRNA synthetase  47.07 
 
 
876 aa  792    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.697697  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2156  leucyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 
830 aa  640    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0321  leucyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 
862 aa  703    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.955307  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2834  leucyl-tRNA synthetase  47.97 
 
 
873 aa  773    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0282  leucyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 
829 aa  839    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2445  leucyl-tRNA synthetase  47.97 
 
 
857 aa  783    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00377193  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0091  leucyl-tRNA synthetase  80.86 
 
 
883 aa  1515    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.124322 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4936  leucyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 
872 aa  744    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3451  leucyl-tRNA synthetase  45.33 
 
 
913 aa  762    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2665  leucyl-tRNA synthetase  47.61 
 
 
819 aa  800    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.364748  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4957  leucyl-tRNA synthetase  47.23 
 
 
868 aa  797    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0840  leucyl-tRNA synthetase  55.51 
 
 
847 aa  963    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1413  leucyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 
851 aa  806    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000816015  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3740  leucyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 
864 aa  753    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0946299 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1106  leucyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 
884 aa  719    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629487  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1380  leucyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 
875 aa  716    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.922349  normal  0.216701 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2300  leucyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 
824 aa  776    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.284228  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2439  leucyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 
829 aa  746    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0479  leucyl-tRNA synthetase  46.09 
 
 
877 aa  809    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09711  leucyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 
864 aa  711    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.217305  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1572  leucyl-tRNA synthetase  38.99 
 
 
822 aa  636    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.940806  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0911  leucyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 
856 aa  700    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168509  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1920  leucyl-tRNA synthetase  44.05 
 
 
865 aa  719    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0511  leucyl-tRNA synthetase  47.23 
 
 
866 aa  807    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711035  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3631  leucyl-tRNA synthetase  57.84 
 
 
862 aa  1018    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0568  leucyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 
829 aa  734    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1211  leucyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 
882 aa  757    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1109  leucyl-tRNA synthetase  40.11 
 
 
809 aa  639    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0385  leucyl-tRNA synthetase  94.65 
 
 
874 aa  1706    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.039423  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3215  leucyl-tRNA synthetase  55.06 
 
 
848 aa  941    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0506  leucyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 
851 aa  757    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00566899  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0794  leucyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 
829 aa  828    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0411  leucyl-tRNA synthetase  52.02 
 
 
863 aa  916    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0758  leucyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 
892 aa  755    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3308  leucyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 
819 aa  726    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0417159 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0284  leucyl-tRNA synthetase  77.24 
 
 
882 aa  1436    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.366179  normal  0.453958 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2155  leucyl-tRNA synthetase  45.38 
 
 
817 aa  769    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4605  leucyl-tRNA synthetase  46.44 
 
 
886 aa  758    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.864694  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0576  leucyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 
863 aa  770    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0797  leucyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 
872 aa  727    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.749816  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0436  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 
878 aa  1814    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2344  leucyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 
856 aa  756    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.633045  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0098  leucyl-tRNA synthetase  82.23 
 
 
878 aa  1548    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0566  leucyl-tRNA synthetase  44.41 
 
 
934 aa  739    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.632616  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2973  leucyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 
873 aa  768    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0232  leucyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 
861 aa  651    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1328  leucyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 
856 aa  720    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3786  leucyl-tRNA synthetase  46.46 
 
 
888 aa  749    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0045  leucyl-tRNA synthetase  51.4 
 
 
857 aa  909    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.269909 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3020  leucyl-tRNA synthetase  52.71 
 
 
849 aa  920    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.336439  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0171  leucyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 
864 aa  756    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678775  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3917  leucyl-tRNA synthetase  46.05 
 
 
910 aa  748    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1566  leucyl-tRNA synthetase  46 
 
 
870 aa  790    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.408978  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3209  leucyl-tRNA synthetase  64.62 
 
 
871 aa  1179    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2744  leucyl-tRNA synthetase  46.37 
 
 
864 aa  790    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0104  leucyl-tRNA synthetase  60.7 
 
 
875 aa  1100    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1557  leucyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 
860 aa  727    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1704  leucyl-tRNA synthetase  47.91 
 
 
929 aa  649    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0997  leucyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 
859 aa  739    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.248445  normal  0.169991 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1062  leucyl-tRNA synthetase  44.18 
 
 
859 aa  738    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0109864 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0400  leucyl-tRNA synthetase  48.92 
 
 
864 aa  821    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.8894  normal  0.692139 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0705  leucyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 
872 aa  743    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.173652  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1599  leucyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 
824 aa  733    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000190725  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2957  leucyl-tRNA synthetase  57.34 
 
 
865 aa  1005    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0549  leucyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 
864 aa  756    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.924908  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12230  leucyl-tRNA synthetase  47.8 
 
 
873 aa  813    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.726587  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4548  leucyl-tRNA synthetase  45.43 
 
 
897 aa  760    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2247  leucyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 
843 aa  640    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0654  leucyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 
864 aa  756    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2084  leucyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 
829 aa  729    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.276133  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0432  leucyl-tRNA synthetase  48.63 
 
 
859 aa  848    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0302206  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1001  leucyl-tRNA synthetase  44.18 
 
 
859 aa  738    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.355839  normal  0.124376 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0771  leucyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 
832 aa  642    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.286234  normal  0.18971 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0731  leucyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 
811 aa  637    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.231189  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1731  leucyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 
823 aa  771    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.308382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>