More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1705 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_2582  leucyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 
864 aa  667    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.60297 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00611  leucyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 
860 aa  644    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.197817  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2984  leucyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 
860 aa  644    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00147705  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0766  leucyl-tRNA synthetase  48.45 
 
 
824 aa  714    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2209  leucyl-tRNA synthetase  48.06 
 
 
824 aa  703    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4794  leucyl-tRNA synthetase  43.02 
 
 
868 aa  652    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.232287 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1638  leucyl-tRNA synthetase  59.39 
 
 
889 aa  1048    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4197  leucyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 
859 aa  640    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1202  leucyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 
875 aa  652    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.262227  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1237  leucyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 
825 aa  688    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1522  leucyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 
819 aa  679    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0751  leucyl-tRNA synthetase  48.32 
 
 
824 aa  714    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3031  leucyl-tRNA synthetase  44.57 
 
 
858 aa  655    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.10606  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2744  leucyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 
864 aa  640    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2279  leucyl-tRNA synthetase  48.09 
 
 
817 aa  698    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1174  leucyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 
859 aa  656    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4812  leucyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 
868 aa  637    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2145  leucyl-tRNA synthetase  48.95 
 
 
817 aa  698    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.736456  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0751  leucyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 
860 aa  649    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0459  leucyl-tRNA synthetase  47.31 
 
 
821 aa  657    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2438  leucyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 
865 aa  657    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000200562  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1302  leucyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 
823 aa  662    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1301  leucyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 
823 aa  664    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4352  leucyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 
868 aa  642    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.964178  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3479  leucyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 
863 aa  645    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000160913 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0764  leucyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 
860 aa  650    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.544549  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0668  leucyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 
860 aa  645    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00449058  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13370  Leucyl-tRNA synthetase  48.94 
 
 
830 aa  703    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000131776  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4108  leucyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 
861 aa  636    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.978301  normal  0.593628 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1861  leucyl-tRNA synthetase  50.06 
 
 
829 aa  728    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.911399  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1860  leucyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 
854 aa  651    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0731  leucyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 
860 aa  644    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0463588  normal  0.765619 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4936  leucyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 
872 aa  656    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3311  leucyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 
874 aa  662    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134968  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2665  leucyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 
819 aa  692    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.364748  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0691  leucyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 
860 aa  650    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.229457  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0366  leucyl-tRNA synthetase  76.84 
 
 
906 aa  1419    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1413  leucyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 
851 aa  704    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000816015  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1098  leucyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 
859 aa  662    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000277445 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4328  leucyl-tRNA synthetase  47.45 
 
 
827 aa  701    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000117584  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3003  leucyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 
860 aa  645    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.27573  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2300  leucyl-tRNA synthetase  47.21 
 
 
824 aa  699    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.284228  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2439  leucyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 
829 aa  697    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0479  leucyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 
877 aa  664    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3134  leucyl-tRNA synthetase  47.81 
 
 
824 aa  715    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0619  leucyl-tRNA synthetase  47.31 
 
 
821 aa  657    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0627  leucyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 
868 aa  650    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.339775  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1920  leucyl-tRNA synthetase  45.62 
 
 
865 aa  667    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0808  leucyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 
860 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0673  leucyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 
820 aa  649    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.343272  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0568  leucyl-tRNA synthetase  47.48 
 
 
829 aa  685    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4669  leucyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 
906 aa  652    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0694  leucyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 
860 aa  645    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28668  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1121  leucyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 
873 aa  639    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3236  leucyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 
856 aa  659    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3143  leucyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 
868 aa  657    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0606298  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2116  leucyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 
825 aa  692    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2929  leucyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 
863 aa  651    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.010661 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01222  leucyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 
862 aa  654    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3308  leucyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 
819 aa  666    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0417159 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00600  hypothetical protein  43.57 
 
 
860 aa  644    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203251  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2155  leucyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 
817 aa  671    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0537  leucyl-tRNA synthetase  47.74 
 
 
826 aa  729    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.993969  normal  0.956377 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3090  leucyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 
834 aa  713    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.373943 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0797  leucyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 
872 aa  645    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.749816  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0780  leucyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 
824 aa  686    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1623  leucyl-tRNA synthetase  47.11 
 
 
837 aa  697    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3702  leucyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 
859 aa  654    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.031134  hitchhiker  0.000000516313 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1280  leucyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 
870 aa  635    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1563  leucyl-tRNA synthetase  45.69 
 
 
810 aa  685    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.954503  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0256  leucyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 
823 aa  680    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1328  leucyl-tRNA synthetase  47.31 
 
 
856 aa  693    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4847  leucyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 
868 aa  653    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2958  leucyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 
860 aa  637    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3786  leucyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 
906 aa  636    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.731933 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1865  leucyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 
826 aa  646    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.107054  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3202  leucyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 
817 aa  644    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0705  leucyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 
860 aa  650    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3209  leucyl-tRNA synthetase  42.87 
 
 
871 aa  640    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2915  leucyl-tRNA synthetase  45.78 
 
 
815 aa  675    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0609  leucyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 
860 aa  644    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.212281  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1557  leucyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 
860 aa  638    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1254  leucyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 
817 aa  706    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.702652  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0997  leucyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 
859 aa  663    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.248445  normal  0.169991 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1062  leucyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 
859 aa  661    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0109864 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0400  leucyl-tRNA synthetase  45.93 
 
 
864 aa  678    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.8894  normal  0.692139 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0705  leucyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 
872 aa  639    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.173652  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1599  leucyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 
824 aa  681    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000190725  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3447  leucyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 
874 aa  664    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121594 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0344  leucyl-tRNA synthetase  44.97 
 
 
828 aa  687    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.361332  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12230  leucyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 
873 aa  635    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.726587  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0757  leucyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 
824 aa  682    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0662  leucyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 
860 aa  644    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0168621  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2084  leucyl-tRNA synthetase  45.96 
 
 
829 aa  678    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.276133  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0432  leucyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 
859 aa  654    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0302206  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1001  leucyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 
859 aa  662    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.355839  normal  0.124376 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1506  leucyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 
820 aa  651    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.105078  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2515  leucyl-tRNA synthetase  46.54 
 
 
827 aa  680    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000585626  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1731  leucyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 
823 aa  729    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.308382  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2863  leucyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 
859 aa  657    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>