More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1638 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1098  leucyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 
859 aa  672    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000277445 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0366  leucyl-tRNA synthetase  58.86 
 
 
906 aa  1066    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0194  leucyl-tRNA synthetase  42.84 
 
 
813 aa  643    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.159225  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2209  leucyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 
824 aa  729    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4794  leucyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 
868 aa  658    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.232287 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2915  leucyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 
815 aa  690    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2920  leucyl-tRNA synthetase  51.76 
 
 
898 aa  890    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.931028  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09000  leucyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 
870 aa  638    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3311  leucyl-tRNA synthetase  43.43 
 
 
874 aa  672    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134968  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1842  leucyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 
860 aa  642    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3479  leucyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 
863 aa  649    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000160913 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3143  leucyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 
868 aa  650    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0606298  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01850  leucyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 
861 aa  649    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0480687 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0256  leucyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 
823 aa  699    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1174  leucyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 
859 aa  679    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4812  leucyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 
868 aa  641    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3447  leucyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 
874 aa  673    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121594 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1638  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 
889 aa  1805    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4419  leucyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 
814 aa  647    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2145  leucyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 
817 aa  709    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.736456  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1302  leucyl-tRNA synthetase  45 
 
 
823 aa  672    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1301  leucyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 
823 aa  672    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4352  leucyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 
868 aa  644    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.964178  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1202  leucyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 
875 aa  643    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.262227  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0780  leucyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 
824 aa  705    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2156  leucyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 
830 aa  646    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0057  leucyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 
829 aa  693    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.300018  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2438  leucyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 
865 aa  655    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000200562  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2744  leucyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 
864 aa  658    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1254  leucyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 
817 aa  733    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.702652  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0537  leucyl-tRNA synthetase  47.36 
 
 
826 aa  711    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.993969  normal  0.956377 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4936  leucyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 
872 aa  671    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1022  leucyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 
868 aa  641    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2665  leucyl-tRNA synthetase  46.49 
 
 
819 aa  695    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.364748  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1860  leucyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 
854 aa  673    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06780  leucyl-tRNA synthetase  44.32 
 
 
852 aa  665    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1413  leucyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 
851 aa  707    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000816015  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0627  leucyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 
868 aa  655    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.339775  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3090  leucyl-tRNA synthetase  46.98 
 
 
834 aa  707    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.373943 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3015  leucyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 
860 aa  641    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.652989  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2300  leucyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 
824 aa  719    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.284228  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2439  leucyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 
829 aa  698    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0479  leucyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 
877 aa  681    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0344  leucyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 
828 aa  682    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.361332  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2926  leucyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 
860 aa  642    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.454668  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0757  leucyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 
824 aa  697    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1920  leucyl-tRNA synthetase  45.98 
 
 
865 aa  691    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3702  leucyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 
859 aa  655    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.031134  hitchhiker  0.000000516313 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3631  leucyl-tRNA synthetase  44.75 
 
 
862 aa  652    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0568  leucyl-tRNA synthetase  48.29 
 
 
829 aa  753    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1237  leucyl-tRNA synthetase  45.87 
 
 
825 aa  717    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0619  leucyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 
821 aa  661    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0459  leucyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 
821 aa  661    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4197  leucyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 
859 aa  656    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3134  leucyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 
824 aa  720    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1563  leucyl-tRNA synthetase  46.31 
 
 
810 aa  721    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.954503  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15061  leucyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 
878 aa  636    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.136372 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2582  leucyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 
864 aa  681    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.60297 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3308  leucyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 
819 aa  658    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0417159 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0673  leucyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 
820 aa  660    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.343272  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2155  leucyl-tRNA synthetase  43.62 
 
 
817 aa  648    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3269  leucyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 
874 aa  672    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4847  leucyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 
868 aa  663    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0797  leucyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 
872 aa  662    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.749816  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01222  leucyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 
862 aa  641    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1522  leucyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 
819 aa  716    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3236  leucyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 
856 aa  676    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1207  leucyl-tRNA synthetase  43.02 
 
 
860 aa  654    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.338789  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1623  leucyl-tRNA synthetase  45.96 
 
 
837 aa  689    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1865  leucyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 
826 aa  670    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.107054  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1328  leucyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 
856 aa  680    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2116  leucyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 
825 aa  715    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2863  leucyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 
859 aa  677    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2515  leucyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 
827 aa  703    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000585626  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2279  leucyl-tRNA synthetase  47.3 
 
 
817 aa  691    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3202  leucyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 
817 aa  694    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0766  leucyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 
824 aa  711    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13370  Leucyl-tRNA synthetase  46.19 
 
 
830 aa  711    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000131776  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4108  leucyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 
861 aa  637    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.978301  normal  0.593628 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0645  leucyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 
816 aa  642    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4328  leucyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 
827 aa  723    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000117584  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1704  leucyl-tRNA synthetase  47.58 
 
 
929 aa  636    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0997  leucyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 
859 aa  682    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.248445  normal  0.169991 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1062  leucyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 
859 aa  684    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0109864 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0400  leucyl-tRNA synthetase  45.86 
 
 
864 aa  671    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.8894  normal  0.692139 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0705  leucyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 
872 aa  660    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.173652  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1599  leucyl-tRNA synthetase  45.94 
 
 
824 aa  697    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000190725  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2957  leucyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 
865 aa  640    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1506  leucyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 
820 aa  661    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.105078  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3031  leucyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 
858 aa  680    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.10606  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1861  leucyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 
829 aa  707    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.911399  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2882  leucyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 
856 aa  678    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0606181  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3786  leucyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 
906 aa  646    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.731933 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2084  leucyl-tRNA synthetase  46.66 
 
 
829 aa  684    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.276133  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0432  leucyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 
859 aa  652    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0302206  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1001  leucyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 
859 aa  685    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.355839  normal  0.124376 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0751  leucyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 
824 aa  718    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0159  leucyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 
813 aa  638    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1731  leucyl-tRNA synthetase  47.74 
 
 
823 aa  738    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.308382  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2929  leucyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 
863 aa  644    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.010661 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>