More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0682 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2882  leucyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 856 aa  658    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0606181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4328  leucyl-tRNA synthetase  48.02 
 
 		 827 aa  728    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000117584  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2279  leucyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 		 817 aa  710    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2209  leucyl-tRNA synthetase  47.48 
 
 		 824 aa  718    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4794  leucyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 		 868 aa  654    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.232287 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2920  leucyl-tRNA synthetase  48.63 
 
 		 898 aa  856    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.931028  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2116  leucyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 		 825 aa  711    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0780  leucyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 		 824 aa  710    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4197  leucyl-tRNA synthetase  38.05 
 
 		 859 aa  638    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4847  leucyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 		 868 aa  658    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1202  leucyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 		 875 aa  643    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.262227  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1506  leucyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 		 820 aa  682    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.105078  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1237  leucyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 		 825 aa  707    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1207  leucyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 860 aa  642    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.338789  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1174  leucyl-tRNA synthetase  41.66 
 
 		 859 aa  657    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4812  leucyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 868 aa  653    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09721  leucyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 856 aa  637    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.90709  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2145  leucyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 		 817 aa  700    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.736456  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0433  leucyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 		 859 aa  668    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0323197 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0619  leucyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 821 aa  657    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1302  leucyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 		 823 aa  677    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1301  leucyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 		 823 aa  676    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4352  leucyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 		 868 aa  646    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.964178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3786  leucyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 		 906 aa  661    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.731933 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3479  leucyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 863 aa  644    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000160913 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2719  leucyl-tRNA synthetase  45.96 
 
 		 838 aa  640    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1860  leucyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 		 854 aa  654    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1254  leucyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 		 817 aa  715    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.702652  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0682  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 930 aa  1890    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.63979  normal  0.105643 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3306  leucyl-tRNA synthetase  45.37 
 
 		 828 aa  684    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000102477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1638  leucyl-tRNA synthetase  59.08 
 
 		 889 aa  1055    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4936  leucyl-tRNA synthetase  40.13 
 
 		 872 aa  650    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0751  leucyl-tRNA synthetase  45.75 
 
 		 824 aa  718    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2665  leucyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 		 819 aa  691    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.364748  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4957  leucyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 868 aa  659    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0256  leucyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 823 aa  704    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1413  leucyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 		 851 aa  701    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000816015  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3447  leucyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 874 aa  656    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121594 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1106  leucyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 		 884 aa  639    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629487  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1563  leucyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 		 810 aa  682    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.954503  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2300  leucyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 		 824 aa  714    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.284228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2439  leucyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 		 829 aa  705    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0479  leucyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 877 aa  682    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2915  leucyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 		 815 aa  691    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3090  leucyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 		 834 aa  694    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.373943 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1865  leucyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 		 826 aa  645    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.107054  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1920  leucyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 865 aa  666    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0366  leucyl-tRNA synthetase  61.92 
 
 		 906 aa  1158    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09000  leucyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 870 aa  650    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0568  leucyl-tRNA synthetase  46.74 
 
 		 829 aa  721    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0459  leucyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 821 aa  657    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0901  leucyl-tRNA synthetase  50.72 
 
 		 919 aa  895    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.102143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0757  leucyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 		 824 aa  700    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01222  leucyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 862 aa  639    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2863  leucyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 		 859 aa  649    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1861  leucyl-tRNA synthetase  46.56 
 
 		 829 aa  705    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.911399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2744  leucyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 864 aa  662    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15061  leucyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 		 878 aa  639    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.136372 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3308  leucyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 819 aa  662    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0417159 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3143  leucyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 868 aa  654    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0606298  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2155  leucyl-tRNA synthetase  46.02 
 
 		 817 aa  665    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3134  leucyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 		 824 aa  729    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1623  leucyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 		 837 aa  686    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0797  leucyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 		 872 aa  660    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.749816  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0537  leucyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 		 826 aa  709    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.993969  normal  0.956377 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2438  leucyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 865 aa  664    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000200562  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1098  leucyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 		 859 aa  655    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000277445 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2515  leucyl-tRNA synthetase  46.26 
 
 		 827 aa  693    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000585626  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0766  leucyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 		 824 aa  723    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1121  leucyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 		 873 aa  638    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1328  leucyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 		 856 aa  679    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4669  leucyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 		 906 aa  655    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0627  leucyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 868 aa  646    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.339775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3311  leucyl-tRNA synthetase  42 
 
 		 874 aa  659    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134968  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3031  leucyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 		 858 aa  652    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.10606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3202  leucyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 817 aa  649    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3702  leucyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 859 aa  652    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.031134  hitchhiker  0.000000516313 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3236  leucyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 856 aa  655    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0344  leucyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 828 aa  688    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.361332  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01850  leucyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 		 861 aa  670    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0480687 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1557  leucyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 860 aa  637    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1425  leucyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 		 831 aa  687    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.164097  normal  0.135581 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0997  leucyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 859 aa  657    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.248445  normal  0.169991 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1062  leucyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 859 aa  658    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0109864 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0400  leucyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 		 864 aa  682    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.8894  normal  0.692139 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0705  leucyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 		 872 aa  655    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.173652  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1599  leucyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 824 aa  666    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000190725  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0833  leucyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 		 857 aa  643    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000149617  hitchhiker  0.00000103499 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0673  leucyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 		 820 aa  681    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.343272  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12230  leucyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 		 873 aa  641    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.726587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06780  leucyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 852 aa  656    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13370  Leucyl-tRNA synthetase  47.04 
 
 		 830 aa  718    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000131776  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2084  leucyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 		 829 aa  681    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.276133  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1804  leucyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 		 824 aa  718    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1001  leucyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 		 859 aa  660    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.355839  normal  0.124376 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1522  leucyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 819 aa  702    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3269  leucyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 		 874 aa  656    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1731  leucyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 		 823 aa  726    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.308382  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2929  leucyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 863 aa  651    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.010661 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0057  leucyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 		 829 aa  694    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.300018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>