More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0901 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0057  leucyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 		 829 aa  640    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.300018  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2920  leucyl-tRNA synthetase  59.31 
 
 		 898 aa  1034    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.931028  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2209  leucyl-tRNA synthetase  44.64 
 
 		 824 aa  662    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4328  leucyl-tRNA synthetase  45.37 
 
 		 827 aa  677    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000117584  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1197  leucyl-tRNA synthetase  59.36 
 
 		 934 aa  1111    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0344  leucyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 		 828 aa  661    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.361332  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0751  leucyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 824 aa  645    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1860  leucyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 		 854 aa  650    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1563  leucyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 810 aa  643    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.954503  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1804  leucyl-tRNA synthetase  46.63 
 
 		 824 aa  683    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1638  leucyl-tRNA synthetase  52.1 
 
 		 889 aa  902    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2515  leucyl-tRNA synthetase  44.57 
 
 		 827 aa  665    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000585626  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3134  leucyl-tRNA synthetase  44.92 
 
 		 824 aa  662    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0757  leucyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 		 824 aa  654    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1302  leucyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 823 aa  643    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1301  leucyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 823 aa  639    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2116  leucyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 		 825 aa  635    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0321  leucyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 		 862 aa  650    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.955307  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0780  leucyl-tRNA synthetase  44 
 
 		 824 aa  660    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2279  leucyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 		 817 aa  637    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3665  leucyl-tRNA synthetase  52.16 
 
 		 882 aa  903    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4936  leucyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 872 aa  644    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1506  leucyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 		 820 aa  638    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.105078  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2665  leucyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 		 819 aa  638    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.364748  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3031  leucyl-tRNA synthetase  43.72 
 
 		 858 aa  636    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.10606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1413  leucyl-tRNA synthetase  43.34 
 
 		 851 aa  639    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000816015  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2300  leucyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 		 824 aa  655    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.284228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2439  leucyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 		 829 aa  639    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13370  Leucyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 		 830 aa  664    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000131776  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1920  leucyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 		 865 aa  637    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1522  leucyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 819 aa  669    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3306  leucyl-tRNA synthetase  45.78 
 
 		 828 aa  666    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000102477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0568  leucyl-tRNA synthetase  46.61 
 
 		 829 aa  678    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1254  leucyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 		 817 aa  673    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.702652  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2882  leucyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 856 aa  645    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0606181  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0766  leucyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 		 824 aa  649    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0433  leucyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 		 859 aa  637    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0323197 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1861  leucyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 		 829 aa  653    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.911399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0537  leucyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 		 826 aa  691    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.993969  normal  0.956377 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1705  leucyl-tRNA synthetase  51.13 
 
 		 904 aa  840    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0256  leucyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 823 aa  659    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09941  leucyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 		 862 aa  650    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.880556  normal  0.45126 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2145  leucyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 817 aa  650    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.736456  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0673  leucyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 		 820 aa  637    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.343272  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3236  leucyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 856 aa  643    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1328  leucyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 		 856 aa  670    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0682  leucyl-tRNA synthetase  50.72 
 
 		 930 aa  909    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.63979  normal  0.105643 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0698  leucyl-tRNA synthetase  45.1 
 
 		 829 aa  665    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0323791  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0901  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 919 aa  1869    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.102143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1599  leucyl-tRNA synthetase  42.84 
 
 		 824 aa  645    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000190725  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3295  leucyl-tRNA synthetase  59.11 
 
 		 971 aa  1080    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.668741  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1731  leucyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 823 aa  652    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.308382  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1237  leucyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 825 aa  665    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0366  leucyl-tRNA synthetase  48.95 
 
 		 906 aa  858    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1425  leucyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 		 831 aa  651    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.164097  normal  0.135581 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1865  leucyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 		 826 aa  634  1e-180  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.107054  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1106  leucyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 		 884 aa  634  1e-180  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629487  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3090  leucyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 		 834 aa  633  1e-180  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.373943 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09721  leucyl-tRNA synthetase  39.97 
 
 		 856 aa  635  1e-180  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.90709  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0736  leucyl-tRNA synthetase  41 
 
 		 865 aa  632  1e-180  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15061  leucyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 		 878 aa  633  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.136372 
 
 
-
 
NC_002936  DET0194  leucyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 		 813 aa  630  1e-179  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.159225  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1380  leucyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 		 875 aa  629  1e-179  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.922349  normal  0.216701 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2132  leucyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 		 863 aa  629  1e-179  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.142112 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_182  leucyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 		 813 aa  628  1e-178  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00206077  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01850  leucyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 861 aa  627  1e-178  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0480687 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0479  leucyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 877 aa  624  1e-177  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1623  leucyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 837 aa  622  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4197  leucyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 859 aa  623  1e-177  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2915  leucyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 		 815 aa  622  1e-176  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09711  leucyl-tRNA synthetase  38.3 
 
 		 864 aa  620  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.217305  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1744  leucyl-tRNA synthetase  44.3 
 
 		 818 aa  620  1e-176  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.123788  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09701  leucyl-tRNA synthetase  38.35 
 
 		 856 aa  618  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2438  leucyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 		 865 aa  617  1e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000200562  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3308  leucyl-tRNA synthetase  41.64 
 
 		 819 aa  616  1e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0417159 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1704  leucyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 		 929 aa  616  1e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2084  leucyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 829 aa  619  1e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.276133  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2156  leucyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 830 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0911  leucyl-tRNA synthetase  39.1 
 
 		 856 aa  613  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168509  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0159  leucyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 813 aa  615  9.999999999999999e-175  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0619  leucyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 		 821 aa  609  1e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0459  leucyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 		 821 aa  609  1e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0400  leucyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 		 864 aa  609  1e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.8894  normal  0.692139 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0645  leucyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 816 aa  605  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2829  leucyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 		 819 aa  602  1.0000000000000001e-171  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0432  leucyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 		 859 aa  604  1.0000000000000001e-171  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0302206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08751  leucyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 		 872 aa  601  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.115344  hitchhiker  0.00155899 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06780  leucyl-tRNA synthetase  42 
 
 		 852 aa  602  1e-170  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4419  leucyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 		 814 aa  600  1e-170  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2155  leucyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 		 817 aa  598  1e-169  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0833  leucyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 857 aa  596  1e-169  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000149617  hitchhiker  0.00000103499 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3202  leucyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 817 aa  596  1e-169  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0244  leucyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 		 607 aa  597  1e-169  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2957  leucyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 		 865 aa  596  1e-169  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1322  leucyl-tRNA synthetase  44.05 
 
 		 815 aa  596  1e-169  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1280  leucyl-tRNA synthetase  41.17 
 
 		 870 aa  592  1e-168  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0627  leucyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 		 868 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.339775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4108  leucyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 861 aa  594  1e-168  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.978301  normal  0.593628 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2744  leucyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 		 864 aa  595  1e-168  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7138  leucyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 828 aa  594  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.480251 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>