More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1197 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_1705  leucyl-tRNA synthetase  51.16 
 
 		 904 aa  873    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2209  leucyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 824 aa  645    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13370  Leucyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 830 aa  645    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000131776  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1861  leucyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 829 aa  645    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.911399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3665  leucyl-tRNA synthetase  52.92 
 
 		 882 aa  948    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0766  leucyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 		 824 aa  648    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0901  leucyl-tRNA synthetase  59.47 
 
 		 919 aa  1112    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.102143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3295  leucyl-tRNA synthetase  62.23 
 
 		 971 aa  1206    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.668741  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2515  leucyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 827 aa  645    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000585626  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2145  leucyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 		 817 aa  635    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.736456  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1522  leucyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 		 819 aa  654    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0780  leucyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 		 824 aa  673    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0698  leucyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 829 aa  640    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0323791  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2300  leucyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 		 824 aa  638    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.284228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3134  leucyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 824 aa  650    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0568  leucyl-tRNA synthetase  44.64 
 
 		 829 aa  676    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4328  leucyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 827 aa  660    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000117584  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1638  leucyl-tRNA synthetase  53.8 
 
 		 889 aa  954    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0256  leucyl-tRNA synthetase  42.88 
 
 		 823 aa  660    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0537  leucyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 826 aa  669    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.993969  normal  0.956377 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0366  leucyl-tRNA synthetase  52.11 
 
 		 906 aa  944    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3306  leucyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 828 aa  646    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000102477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0682  leucyl-tRNA synthetase  49 
 
 		 930 aa  913    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.63979  normal  0.105643 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0751  leucyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 824 aa  642    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1254  leucyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 		 817 aa  679    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.702652  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1599  leucyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 824 aa  651    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000190725  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1237  leucyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 825 aa  645    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1197  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 934 aa  1887    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2920  leucyl-tRNA synthetase  59.1 
 
 		 898 aa  1055    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.931028  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0057  leucyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 		 829 aa  636    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.300018  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0757  leucyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 824 aa  664    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1731  leucyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 823 aa  654    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.308382  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1804  leucyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 		 824 aa  692    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0344  leucyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 828 aa  634  1e-180  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.361332  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1623  leucyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 837 aa  635  1e-180  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0736  leucyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 865 aa  634  1e-180  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2665  leucyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 		 819 aa  629  1e-179  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.364748  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1413  leucyl-tRNA synthetase  39.85 
 
 		 851 aa  632  1e-179  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000816015  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1425  leucyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 831 aa  632  1e-179  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.164097  normal  0.135581 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2915  leucyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 		 815 aa  632  1e-179  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3308  leucyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 819 aa  631  1e-179  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0417159 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3090  leucyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 834 aa  630  1e-179  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.373943 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1328  leucyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 		 856 aa  631  1e-179  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1563  leucyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 		 810 aa  629  1e-179  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.954503  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2439  leucyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 829 aa  626  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3236  leucyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 		 856 aa  627  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2882  leucyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 		 856 aa  629  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0606181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1865  leucyl-tRNA synthetase  45.13 
 
 		 826 aa  624  1e-177  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.107054  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2279  leucyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 817 aa  625  1e-177  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1506  leucyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 		 820 aa  621  1e-176  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.105078  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0673  leucyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 820 aa  620  1e-176  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.343272  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0194  leucyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 813 aa  619  1e-175  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.159225  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_182  leucyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 813 aa  617  1e-175  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00206077  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2116  leucyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 		 825 aa  618  1e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2084  leucyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 829 aa  617  1e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.276133  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1860  leucyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 		 854 aa  612  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2438  leucyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 		 865 aa  609  1e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000200562  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0159  leucyl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 813 aa  611  1e-173  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1302  leucyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 		 823 aa  610  1e-173  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1301  leucyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 823 aa  607  9.999999999999999e-173  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2863  leucyl-tRNA synthetase  38.58 
 
 		 859 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4936  leucyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 872 aa  607  9.999999999999999e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3447  leucyl-tRNA synthetase  38.47 
 
 		 874 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121594 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0997  leucyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 		 859 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.248445  normal  0.169991 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2957  leucyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 		 865 aa  606  9.999999999999999e-173  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2582  leucyl-tRNA synthetase  38.86 
 
 		 864 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.60297 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3269  leucyl-tRNA synthetase  38.58 
 
 		 874 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3311  leucyl-tRNA synthetase  38.47 
 
 		 874 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134968  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0479  leucyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 		 877 aa  605  1.0000000000000001e-171  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1920  leucyl-tRNA synthetase  40.02 
 
 		 865 aa  604  1.0000000000000001e-171  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1098  leucyl-tRNA synthetase  38.73 
 
 		 859 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000277445 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3702  leucyl-tRNA synthetase  39.42 
 
 		 859 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.031134  hitchhiker  0.000000516313 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3031  leucyl-tRNA synthetase  40.02 
 
 		 858 aa  605  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.10606  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4197  leucyl-tRNA synthetase  40.26 
 
 		 859 aa  603  1.0000000000000001e-171  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1062  leucyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 		 859 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0109864 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0400  leucyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 864 aa  602  1.0000000000000001e-171  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.8894  normal  0.692139 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0705  leucyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 		 872 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.173652  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0432  leucyl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 859 aa  603  1.0000000000000001e-171  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0302206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1001  leucyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 859 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.355839  normal  0.124376 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1174  leucyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 859 aa  602  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3631  leucyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 862 aa  601  1e-170  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2744  leucyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 864 aa  600  1e-170  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0797  leucyl-tRNA synthetase  39.15 
 
 		 872 aa  601  1e-170  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.749816  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0619  leucyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 821 aa  600  1e-170  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0459  leucyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 821 aa  600  1e-170  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0321  leucyl-tRNA synthetase  38.62 
 
 		 862 aa  596  1e-169  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.955307  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0433  leucyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 859 aa  597  1e-169  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0323197 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4108  leucyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 861 aa  597  1e-169  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.978301  normal  0.593628 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3202  leucyl-tRNA synthetase  44 
 
 		 817 aa  598  1e-169  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09941  leucyl-tRNA synthetase  38.23 
 
 		 862 aa  595  1e-168  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.880556  normal  0.45126 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3143  leucyl-tRNA synthetase  39.69 
 
 		 868 aa  593  1e-168  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0606298  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1744  leucyl-tRNA synthetase  41.35 
 
 		 818 aa  595  1e-168  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.123788  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0244  leucyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 		 607 aa  590  1e-167  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2155  leucyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 		 817 aa  590  1e-167  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1280  leucyl-tRNA synthetase  38.9 
 
 		 870 aa  592  1e-167  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00611  leucyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 		 860 aa  586  1e-166  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.197817  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1322  leucyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 815 aa  586  1e-166  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1380  leucyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 		 875 aa  588  1e-166  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.922349  normal  0.216701 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06780  leucyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 		 852 aa  586  1e-166  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15061  leucyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 878 aa  588  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.136372 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>