More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3295 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_13370  Leucyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 
830 aa  642    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000131776  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3665  leucyl-tRNA synthetase  49.18 
 
 
882 aa  890    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0757  leucyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 
824 aa  643    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1522  leucyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 
819 aa  636    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1638  leucyl-tRNA synthetase  50.26 
 
 
889 aa  906    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0366  leucyl-tRNA synthetase  48.02 
 
 
906 aa  881    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1705  leucyl-tRNA synthetase  48.22 
 
 
904 aa  824    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1197  leucyl-tRNA synthetase  62.62 
 
 
934 aa  1189    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2920  leucyl-tRNA synthetase  57.28 
 
 
898 aa  1001    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.931028  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0901  leucyl-tRNA synthetase  58.76 
 
 
919 aa  1081    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.102143  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4328  leucyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 
827 aa  636    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000117584  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1804  leucyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 
824 aa  637    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3295  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 
971 aa  1963    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.668741  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0537  leucyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 
826 aa  653    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.993969  normal  0.956377 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0780  leucyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 
824 aa  650    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0698  leucyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 
829 aa  640    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0323791  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0682  leucyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 
930 aa  881    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.63979  normal  0.105643 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1328  leucyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 
856 aa  633  1e-180  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2209  leucyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 
824 aa  629  1e-179  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1861  leucyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 
829 aa  630  1e-179  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.911399  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3090  leucyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 
834 aa  631  1e-179  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.373943 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3306  leucyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
828 aa  631  1e-179  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000102477  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1237  leucyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 
825 aa  629  1e-178  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0568  leucyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 
829 aa  625  1e-178  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1254  leucyl-tRNA synthetase  40.27 
 
 
817 aa  627  1e-178  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.702652  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2300  leucyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 
824 aa  623  1e-177  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.284228  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0256  leucyl-tRNA synthetase  40.02 
 
 
823 aa  624  1e-177  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1865  leucyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 
826 aa  623  1e-177  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.107054  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1599  leucyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 
824 aa  623  1e-177  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000190725  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3134  leucyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 
824 aa  625  1e-177  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0766  leucyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 
824 aa  619  1e-176  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2515  leucyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 
827 aa  621  1e-176  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000585626  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2116  leucyl-tRNA synthetase  40.31 
 
 
825 aa  619  1e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2882  leucyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 
856 aa  616  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0606181  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2439  leucyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 
829 aa  619  1e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0344  leucyl-tRNA synthetase  39.93 
 
 
828 aa  619  1e-175  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.361332  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0751  leucyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 
824 aa  618  1e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1731  leucyl-tRNA synthetase  40.15 
 
 
823 aa  618  1e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.308382  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2145  leucyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 
817 aa  613  9.999999999999999e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.736456  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0057  leucyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 
829 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.300018  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3236  leucyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 
856 aa  614  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1413  leucyl-tRNA synthetase  39.61 
 
 
851 aa  615  9.999999999999999e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000816015  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1563  leucyl-tRNA synthetase  39.4 
 
 
810 aa  615  9.999999999999999e-175  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.954503  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1506  leucyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 
820 aa  609  1e-173  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.105078  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0673  leucyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 
820 aa  608  9.999999999999999e-173  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.343272  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1860  leucyl-tRNA synthetase  39.4 
 
 
854 aa  608  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1106  leucyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 
884 aa  608  9.999999999999999e-173  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629487  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1425  leucyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 
831 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.164097  normal  0.135581 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1623  leucyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 
837 aa  600  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2279  leucyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 
817 aa  601  1e-170  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15061  leucyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 
878 aa  598  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.136372 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1380  leucyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 
875 aa  598  1e-169  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.922349  normal  0.216701 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3031  leucyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 
858 aa  598  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.10606  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2084  leucyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 
829 aa  598  1e-169  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.276133  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4936  leucyl-tRNA synthetase  38.88 
 
 
872 aa  594  1e-168  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1920  leucyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 
865 aa  594  1e-168  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0736  leucyl-tRNA synthetase  37.56 
 
 
865 aa  595  1e-168  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2915  leucyl-tRNA synthetase  39.28 
 
 
815 aa  589  1e-167  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2438  leucyl-tRNA synthetase  39.77 
 
 
865 aa  591  1e-167  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000200562  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1022  leucyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 
868 aa  588  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1280  leucyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 
870 aa  588  1e-166  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2665  leucyl-tRNA synthetase  39.98 
 
 
819 aa  589  1e-166  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.364748  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4197  leucyl-tRNA synthetase  38.08 
 
 
859 aa  588  1e-166  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1302  leucyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 
823 aa  583  1.0000000000000001e-165  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09941  leucyl-tRNA synthetase  36.66 
 
 
862 aa  585  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.880556  normal  0.45126 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3631  leucyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 
862 aa  585  1.0000000000000001e-165  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3215  leucyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 
848 aa  583  1.0000000000000001e-165  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2829  leucyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 
819 aa  585  1.0000000000000001e-165  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4108  leucyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 
861 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.978301  normal  0.593628 
 
 
-
 
NC_002936  DET0194  leucyl-tRNA synthetase  37.82 
 
 
813 aa  581  1e-164  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.159225  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1301  leucyl-tRNA synthetase  38.64 
 
 
823 aa  582  1e-164  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0321  leucyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 
862 aa  581  1e-164  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.955307  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_182  leucyl-tRNA synthetase  37.85 
 
 
813 aa  581  1e-164  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00206077  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0159  leucyl-tRNA synthetase  38.15 
 
 
813 aa  581  1e-164  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2957  leucyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 
865 aa  581  1e-164  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0619  leucyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 
821 aa  578  1.0000000000000001e-163  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0833  leucyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 
857 aa  578  1.0000000000000001e-163  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000149617  hitchhiker  0.00000103499 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3308  leucyl-tRNA synthetase  39.93 
 
 
819 aa  578  1.0000000000000001e-163  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0417159 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1744  leucyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 
818 aa  577  1.0000000000000001e-163  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.123788  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3202  leucyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 
817 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0459  leucyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 
821 aa  578  1.0000000000000001e-163  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2247  leucyl-tRNA synthetase  40.36 
 
 
843 aa  577  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08751  leucyl-tRNA synthetase  37.39 
 
 
872 aa  578  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.115344  hitchhiker  0.00155899 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2582  leucyl-tRNA synthetase  38.23 
 
 
864 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.60297 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4847  leucyl-tRNA synthetase  38.06 
 
 
868 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4794  leucyl-tRNA synthetase  38.06 
 
 
868 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.232287 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4669  leucyl-tRNA synthetase  38.06 
 
 
906 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2155  leucyl-tRNA synthetase  38.86 
 
 
817 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2744  leucyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 
864 aa  573  1.0000000000000001e-162  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1704  leucyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 
929 aa  572  1.0000000000000001e-162  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0432  leucyl-tRNA synthetase  38.2 
 
 
859 aa  574  1.0000000000000001e-162  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0302206  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1001  leucyl-tRNA synthetase  38.06 
 
 
859 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.355839  normal  0.124376 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09000  leucyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 
870 aa  573  1.0000000000000001e-162  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1404  leucyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 
871 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.546208  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1174  leucyl-tRNA synthetase  37.9 
 
 
859 aa  569  1e-161  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0284  leucyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 
882 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.366179  normal  0.453958 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0627  leucyl-tRNA synthetase  37.59 
 
 
868 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.339775  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4419  leucyl-tRNA synthetase  38.01 
 
 
814 aa  571  1e-161  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0997  leucyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 
859 aa  569  1e-161  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.248445  normal  0.169991 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1062  leucyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 
859 aa  572  1e-161  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0109864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>