More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1322 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010117  COXBURSA331_A0673  leucyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 		 820 aa  688    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.343272  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2145  leucyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 		 817 aa  687    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.736456  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09941  leucyl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 862 aa  675    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.880556  normal  0.45126 
 
 
-
 
NC_002936  DET0194  leucyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 		 813 aa  775    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.159225  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2209  leucyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 		 824 aa  761    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4794  leucyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 		 868 aa  678    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.232287 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2339  leucyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 		 858 aa  677    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000153257  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1318  leucyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 		 804 aa  706    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1453  leucyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 887 aa  640    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.721273  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0256  leucyl-tRNA synthetase  46.94 
 
 		 823 aa  797    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4197  leucyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 		 859 aa  716    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4882  leucyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 		 802 aa  667    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1121  leucyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 873 aa  664    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2498  leucyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 		 847 aa  639    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.637168  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2057  leucyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 		 833 aa  649    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00764641  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0757  leucyl-tRNA synthetase  47.43 
 
 		 824 aa  778    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0074  leucyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 821 aa  658    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4812  leucyl-tRNA synthetase  43.83 
 
 		 868 aa  664    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4637  leucyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 802 aa  666    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4472  leucyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 		 802 aa  667    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.947334  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4490  leucyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 802 aa  666    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0780  leucyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 		 824 aa  797    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1302  leucyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 823 aa  667    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1301  leucyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 		 823 aa  667    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4352  leucyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 		 868 aa  669    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.964178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2915  leucyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 		 815 aa  665    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0544  leucyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 		 876 aa  638    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.697697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2156  leucyl-tRNA synthetase  46.74 
 
 		 830 aa  723    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0321  leucyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 862 aa  675    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.955307  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3415  leucyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 		 802 aa  665    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2445  leucyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 		 857 aa  668    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00377193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1861  leucyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 		 829 aa  738    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.911399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4936  leucyl-tRNA synthetase  44.97 
 
 		 872 aa  735    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0077  leucyl-tRNA synthetase  44.57 
 
 		 904 aa  682    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.622899  hitchhiker  0.0000864885 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2665  leucyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 819 aa  674    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.364748  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4957  leucyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 868 aa  681    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0840  leucyl-tRNA synthetase  43.11 
 
 		 847 aa  635    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1413  leucyl-tRNA synthetase  45.93 
 
 		 851 aa  739    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000816015  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4847  leucyl-tRNA synthetase  43.62 
 
 		 868 aa  681    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0344  leucyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 		 828 aa  800    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.361332  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1106  leucyl-tRNA synthetase  45.72 
 
 		 884 aa  711    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629487  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09701  leucyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 856 aa  664    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1380  leucyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 		 875 aa  720    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.922349  normal  0.216701 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2300  leucyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 		 824 aa  750    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.284228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2439  leucyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 829 aa  711    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0479  leucyl-tRNA synthetase  43.02 
 
 		 877 aa  671    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4991  leucyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 802 aa  666    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1237  leucyl-tRNA synthetase  45.56 
 
 		 825 aa  762    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0911  leucyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 		 856 aa  657    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168509  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1920  leucyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 		 865 aa  741    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4108  leucyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 		 861 aa  652    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.978301  normal  0.593628 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3631  leucyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 		 862 aa  667    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0568  leucyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 829 aa  787    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1280  leucyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 		 870 aa  642    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2727  leucyl-tRNA synthetase  46.66 
 
 		 858 aa  703    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.354364  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0159  leucyl-tRNA synthetase  49.45 
 
 		 813 aa  782    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3215  leucyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 		 848 aa  687    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09711  leucyl-tRNA synthetase  38.95 
 
 		 864 aa  652    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.217305  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3786  leucyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 906 aa  686    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.731933 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1446  leucyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 		 894 aa  649    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.943186 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3134  leucyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 		 824 aa  725    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1506  leucyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 		 820 aa  689    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.105078  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2155  leucyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 817 aa  661    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1865  leucyl-tRNA synthetase  50.66 
 
 		 826 aa  782    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.107054  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0576  leucyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 863 aa  637    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1884  leucyl-tRNA synthetase  47.96 
 
 		 848 aa  728    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.439942  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15061  leucyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 		 878 aa  719    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.136372 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1813  leucyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 		 805 aa  668    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.682245  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2719  leucyl-tRNA synthetase  45.97 
 
 		 838 aa  694    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4570  leucyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 		 802 aa  673    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1328  leucyl-tRNA synthetase  46.13 
 
 		 856 aa  706    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0567  leucyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 		 819 aa  679    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0791746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2438  leucyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 		 865 aa  697    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000200562  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1295  leucyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 806 aa  663    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000279205  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4669  leucyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 		 906 aa  678    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3202  leucyl-tRNA synthetase  49.21 
 
 		 817 aa  758    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09721  leucyl-tRNA synthetase  39.98 
 
 		 856 aa  670    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.90709  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4419  leucyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 814 aa  731    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0657  leucyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 		 816 aa  688    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0645  leucyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 		 816 aa  702    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1704  leucyl-tRNA synthetase  49.34 
 
 		 929 aa  668    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0255  leucyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 		 816 aa  707    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00083346  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2515  leucyl-tRNA synthetase  47.61 
 
 		 827 aa  771    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000585626  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0400  leucyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 		 864 aa  655    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.8894  normal  0.692139 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3443  leucyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 		 855 aa  694    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.175272 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1599  leucyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 		 824 aa  786    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000190725  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2957  leucyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 865 aa  674    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0710  leucyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 		 821 aa  647    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.699276  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12230  leucyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 		 873 aa  664    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.726587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1848  leucyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 		 805 aa  668    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.164346  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0627  leucyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 868 aa  675    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.339775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08751  leucyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 872 aa  673    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.115344  hitchhiker  0.00155899 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0268  leucyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 833 aa  647    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2247  leucyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 		 843 aa  714    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4535  leucyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 		 904 aa  675    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2084  leucyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 		 829 aa  723    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.276133  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0432  leucyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 859 aa  679    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0302206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2050  leucyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 		 864 aa  637    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.722431  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0771  leucyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 		 832 aa  712    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.286234  normal  0.18971 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1522  leucyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 		 819 aa  771    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>