More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0074 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00611  leucyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 		 860 aa  724    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.197817  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2984  leucyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 		 860 aa  722    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00147705  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0194  leucyl-tRNA synthetase  42.84 
 
 		 813 aa  662    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.159225  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2209  leucyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 		 824 aa  847    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4794  leucyl-tRNA synthetase  46.23 
 
 		 868 aa  767    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.232287 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2339  leucyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 858 aa  647    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000153257  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2744  leucyl-tRNA synthetase  45.6 
 
 		 864 aa  744    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1453  leucyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 		 887 aa  729    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.721273  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0060  leucyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 		 838 aa  687    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2744  leucyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 		 877 aa  677    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.775327 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1191  leucyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 		 859 aa  715    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.663748 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1722  leucyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 		 863 aa  713    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1234  leucyl-tRNA synthetase  71.5 
 
 		 809 aa  1206    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1807  leucyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 		 877 aa  688    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.807702  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1174  leucyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 		 859 aa  745    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4812  leucyl-tRNA synthetase  46.01 
 
 		 868 aa  759    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3786  leucyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 888 aa  683    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1861  leucyl-tRNA synthetase  49.05 
 
 		 829 aa  829    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.911399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4548  leucyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 897 aa  689    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2453  leucyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 864 aa  683    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.484774  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1302  leucyl-tRNA synthetase  47.32 
 
 		 823 aa  758    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1301  leucyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 		 823 aa  758    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4352  leucyl-tRNA synthetase  45.6 
 
 		 868 aa  767    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.964178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0576  leucyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 		 921 aa  715    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.931447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0544  leucyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 		 876 aa  731    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.697697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2156  leucyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 830 aa  669    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0321  leucyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 		 862 aa  639    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.955307  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2834  leucyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 873 aa  680    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0282  leucyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 829 aa  648    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2445  leucyl-tRNA synthetase  44.43 
 
 		 857 aa  719    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00377193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0091  leucyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 883 aa  669    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.124322 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4936  leucyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 		 872 aa  729    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3451  leucyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 913 aa  689    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2665  leucyl-tRNA synthetase  48.09 
 
 		 819 aa  796    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.364748  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4957  leucyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 		 868 aa  738    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0840  leucyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 		 847 aa  719    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1413  leucyl-tRNA synthetase  47.11 
 
 		 851 aa  786    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000816015  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3740  leucyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 864 aa  673    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0946299 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1106  leucyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 884 aa  664    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629487  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1380  leucyl-tRNA synthetase  43.43 
 
 		 875 aa  675    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.922349  normal  0.216701 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2300  leucyl-tRNA synthetase  50.71 
 
 		 824 aa  848    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.284228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2439  leucyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 		 829 aa  823    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0479  leucyl-tRNA synthetase  46.28 
 
 		 877 aa  768    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3917  leucyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 910 aa  680    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1572  leucyl-tRNA synthetase  64.02 
 
 		 822 aa  1104    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.940806  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4197  leucyl-tRNA synthetase  46.64 
 
 		 859 aa  737    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1920  leucyl-tRNA synthetase  44.9 
 
 		 865 aa  729    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0511  leucyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 866 aa  756    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711035  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3631  leucyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 862 aa  672    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0568  leucyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 		 829 aa  777    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1211  leucyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 		 882 aa  680    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2727  leucyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 858 aa  703    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.354364  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0385  leucyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 874 aa  683    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.039423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3215  leucyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 		 848 aa  692    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0506  leucyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 		 851 aa  656    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00566899  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0794  leucyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 829 aa  644    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0411  leucyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 		 863 aa  689    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0758  leucyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 892 aa  698    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3308  leucyl-tRNA synthetase  48.38 
 
 		 819 aa  758    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0417159 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0284  leucyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 		 882 aa  676    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.366179  normal  0.453958 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2155  leucyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 		 817 aa  789    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4605  leucyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 886 aa  681    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.864694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0576  leucyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 		 863 aa  694    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0797  leucyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 872 aa  720    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.749816  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0436  leucyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 		 878 aa  681    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2344  leucyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 		 856 aa  723    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.633045  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0098  leucyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 878 aa  668    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0566  leucyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 		 934 aa  719    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.632616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2973  leucyl-tRNA synthetase  42.84 
 
 		 873 aa  686    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0232  leucyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 		 861 aa  702    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1328  leucyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 		 856 aa  704    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0567  leucyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 		 819 aa  650    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0791746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0045  leucyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 		 857 aa  721    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.269909 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3020  leucyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 		 849 aa  665    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.336439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0171  leucyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 864 aa  676    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678775  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3202  leucyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 817 aa  636    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1566  leucyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 		 870 aa  741    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.408978  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3209  leucyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 871 aa  678    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0657  leucyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 816 aa  637    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0645  leucyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 816 aa  651    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1557  leucyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 		 860 aa  735    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1704  leucyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 929 aa  654    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0997  leucyl-tRNA synthetase  45.04 
 
 		 859 aa  746    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.248445  normal  0.169991 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1062  leucyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 		 859 aa  748    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0109864 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0400  leucyl-tRNA synthetase  46.29 
 
 		 864 aa  760    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.8894  normal  0.692139 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0705  leucyl-tRNA synthetase  44.46 
 
 		 872 aa  728    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.173652  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1599  leucyl-tRNA synthetase  48.86 
 
 		 824 aa  768    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000190725  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2957  leucyl-tRNA synthetase  44.7 
 
 		 865 aa  709    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0549  leucyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 		 864 aa  680    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.924908  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12230  leucyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 873 aa  758    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.726587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2247  leucyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 843 aa  670    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0654  leucyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 864 aa  676    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2084  leucyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 		 829 aa  785    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.276133  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0432  leucyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 		 859 aa  750    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0302206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1001  leucyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 		 859 aa  748    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.355839  normal  0.124376 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0771  leucyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 		 832 aa  641    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.286234  normal  0.18971 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0731  leucyl-tRNA synthetase  74.14 
 
 		 811 aa  1272    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.231189  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1731  leucyl-tRNA synthetase  50.48 
 
 		 823 aa  840    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.308382  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2765  leucyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 		 844 aa  687    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0104  leucyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 875 aa  700    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>