More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0866 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04124  valyl-tRNA synthetase  37.81 
 
 		 951 aa  636    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0407  valyl-tRNA synthetase  41 
 
 		 880 aa  704    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0922688  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0430  valyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 		 880 aa  701    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.029099  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2045  valyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 		 887 aa  771    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0923  valyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 		 959 aa  657    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1364  valyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 		 909 aa  719    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1228  valyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 876 aa  670    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0887446  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2097  valyl-tRNA synthetase  38.36 
 
 		 921 aa  680    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.694852  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0654  valyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 		 908 aa  639    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000423927  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 881 aa  700    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1799  valyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 		 886 aa  765    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.398016  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0866  valyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 870 aa  1792    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0445  valyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 883 aa  661    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.262089  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3493  valyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 		 872 aa  649    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.180306 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3424  valyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 		 958 aa  657    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3530  valyl-tRNA synthetase  38.15 
 
 		 943 aa  673    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.723438  normal  0.0830498 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4355  valyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 881 aa  698    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4191  valyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 		 881 aa  699    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4202  valyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 881 aa  699    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3112  valyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 		 958 aa  666    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0139343  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0785  valyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 921 aa  692    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0756  valyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 		 921 aa  694    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1086  valyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 		 948 aa  640    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1850  valyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 		 984 aa  652    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.546477  normal  0.957317 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3085  valyl-tRNA synthetase  38.58 
 
 		 943 aa  674    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.405108 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1281  valyl-tRNA synthetase  40.02 
 
 		 933 aa  674    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.202707  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3169  valyl-tRNA synthetase  36.69 
 
 		 979 aa  637    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.235624 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0577  valyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 		 912 aa  675    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.113426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1436  valyl-tRNA synthetase  37.77 
 
 		 952 aa  640    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.571959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2982  valyl-tRNA synthetase  40.36 
 
 		 1002 aa  643    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2742  valyl-tRNA synthetase  37.75 
 
 		 958 aa  667    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.829752  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1091  valyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 		 929 aa  682    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0986  valyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 		 948 aa  645    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2315  valyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 		 885 aa  790    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169749  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1137  putative valyl-tRNA synthetase  36.84 
 
 		 941 aa  645    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.835272  normal  0.0253174 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0386  valyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 		 901 aa  640    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.673451 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2213  valyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 		 925 aa  662    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.198562  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0388  valyl-tRNA synthetase  37.77 
 
 		 902 aa  637    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.427268  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2558  valyl-tRNA synthetase  39.68 
 
 		 914 aa  660    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0956  valyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 887 aa  775    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2839  valyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 		 883 aa  726    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1503  valyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 924 aa  707    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000330515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4690  valyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 881 aa  698    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0737  valyl-tRNA synthetase  61.62 
 
 		 875 aa  1147    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1775  valyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 918 aa  639    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.651419  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0587  valyl-tRNA synthetase  39.69 
 
 		 909 aa  673    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0235992  normal  0.435222 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0742  valyl-tRNA synthetase  39.14 
 
 		 926 aa  659    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279651  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1796  valyl-tRNA synthetase  40.36 
 
 		 879 aa  691    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 		 880 aa  714    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3650  valyl-tRNA synthetase  38.07 
 
 		 951 aa  651    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.227036 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2390  valyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 		 1052 aa  688    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.122959  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42662  predicted protein  37.91 
 
 		 924 aa  640    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0687  valyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 		 908 aa  639    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000177332  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1369  valyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 		 922 aa  682    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2570  valyl-tRNA synthetase  39.15 
 
 		 952 aa  657    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.252314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0091  valyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 		 943 aa  730    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3721  valyl-tRNA synthetase  36.61 
 
 		 973 aa  638    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0971795  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1335  valyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 		 959 aa  649    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.754534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2867  valyl-tRNA synthetase  37.41 
 
 		 968 aa  664    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2579  valyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 		 968 aa  636    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0215604 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0796  valyl-tRNA synthetase  99.2 
 
 		 870 aa  1781    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.933031  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1828  valyl-tRNA synthetase  37.34 
 
 		 954 aa  642    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.242328  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2138  valyl-tRNA synthetase  38.03 
 
 		 984 aa  660    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.571055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2896  valyl-tRNA synthetase  37.57 
 
 		 976 aa  654    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.588712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0132  valyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 929 aa  692    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0431753 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18731  valyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 		 918 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0684  valyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 917 aa  684    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.980667  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3564  valyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 		 921 aa  691    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1571  valyl-tRNA synthetase  39.85 
 
 		 926 aa  677    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2175  valyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 880 aa  694    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1886  valyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 880 aa  697    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1259  valyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 		 948 aa  660    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2554  valyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 		 879 aa  725    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0681361  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1130  valyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 		 958 aa  657    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00231601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1201  valyl-tRNA synthetase  37.38 
 
 		 958 aa  661    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.418789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0555  valyl-tRNA synthetase  38.53 
 
 		 917 aa  702    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00036551 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0916  valyl-tRNA synthetase  37.31 
 
 		 968 aa  665    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.276486  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1649  valyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 		 883 aa  739    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1928  valyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 893 aa  701    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29141  valyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 		 947 aa  662    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14440  valyl-tRNA synthetase  38.39 
 
 		 950 aa  676    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2479  valyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 880 aa  670    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225877  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1392  valyl-tRNA synthetase  39.13 
 
 		 902 aa  661    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0390871  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1219  valyl-tRNA synthetase  40.58 
 
 		 879 aa  645    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0322  valyl-tRNA synthetase  38.91 
 
 		 894 aa  655    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0513  valyl-tRNA synthetase  40.22 
 
 		 883 aa  662    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18731  valyl-tRNA synthetase  39.82 
 
 		 918 aa  635    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.122386  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0192  valyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 892 aa  751    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.209132  normal  0.584595 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1474  valyl-tRNA synthetase  39.59 
 
 		 929 aa  683    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0304029  normal  0.195737 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1131  valyl-tRNA synthetase  37.38 
 
 		 958 aa  662    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00349082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0741  valyl-tRNA synthetase  39.93 
 
 		 888 aa  648    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0469934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0966  valyl-tRNA synthetase  68.36 
 
 		 873 aa  1263    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1580  valyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 		 886 aa  776    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1783  valyl-tRNA synthetase  37.86 
 
 		 891 aa  642    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.15043  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0790  valyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 		 953 aa  687    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21531  valyl-tRNA synthetase  40.02 
 
 		 933 aa  673    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0606355  normal  0.859244 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0393  valyl-tRNA synthetase  38.01 
 
 		 952 aa  649    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0324  valyl-tRNA synthetase  45.55 
 
 		 884 aa  756    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0384006  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0959  valyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 		 950 aa  664    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2238  valyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 		 884 aa  719    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.180056  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>