More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1091 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_04124  valyl-tRNA synthetase  57.81 
 
 
951 aa  1132    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3739  valyl-tRNA synthetase  57.92 
 
 
951 aa  1133    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0430  valyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 
880 aa  778    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.029099  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2045  valyl-tRNA synthetase  51.07 
 
 
887 aa  886    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0977  valyl-tRNA synthetase  60.19 
 
 
948 aa  1207    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1364  valyl-tRNA synthetase  43.82 
 
 
909 aa  781    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1228  valyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 
876 aa  764    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0887446  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2097  valyl-tRNA synthetase  66.45 
 
 
921 aa  1286    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.694852  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2236  valyl-tRNA synthetase  54.05 
 
 
968 aa  1030    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 
881 aa  827    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0738  valyl-tRNA synthetase  56.35 
 
 
973 aa  1147    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0445  valyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 
883 aa  758    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.262089  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0948  valyl-tRNA synthetase  48.22 
 
 
910 aa  845    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3424  valyl-tRNA synthetase  58.65 
 
 
958 aa  1189    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1268  valyl-tRNA synthetase  60.71 
 
 
948 aa  1208    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4355  valyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 
881 aa  827    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4191  valyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 
881 aa  827    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4202  valyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 
881 aa  826    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0927  valyl-tRNA synthetase  55.74 
 
 
955 aa  1066    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0785  valyl-tRNA synthetase  59.7 
 
 
921 aa  1183    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0756  valyl-tRNA synthetase  59.59 
 
 
921 aa  1182    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1086  valyl-tRNA synthetase  60.82 
 
 
948 aa  1215    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1850  valyl-tRNA synthetase  53.58 
 
 
984 aa  1071    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.546477  normal  0.957317 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3085  valyl-tRNA synthetase  56.99 
 
 
943 aa  1100    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.405108 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1281  valyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 
933 aa  794    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.202707  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0863  valyl-tRNA synthetase  55.25 
 
 
955 aa  1027    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0577  valyl-tRNA synthetase  57.45 
 
 
912 aa  1107    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.113426  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1436  valyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 
952 aa  871    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.571959  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2982  valyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 
1002 aa  827    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1846  valyl-tRNA synthetase  55.95 
 
 
955 aa  1067    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.344373  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1091  valyl-tRNA synthetase  100 
 
 
929 aa  1924    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0986  valyl-tRNA synthetase  60.61 
 
 
948 aa  1213    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2315  valyl-tRNA synthetase  49.46 
 
 
885 aa  920    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169749  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4585  valyl-tRNA synthetase  56.6 
 
 
955 aa  1080    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.826772 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0386  valyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 
901 aa  746    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.673451 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2213  valyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 
925 aa  814    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.198562  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0388  valyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 
902 aa  730    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.427268  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2558  valyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 
914 aa  825    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0956  valyl-tRNA synthetase  51.44 
 
 
887 aa  914    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2839  valyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 
883 aa  858    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1503  valyl-tRNA synthetase  65.48 
 
 
924 aa  1294    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000330515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4690  valyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 
881 aa  827    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0737  valyl-tRNA synthetase  40.51 
 
 
875 aa  730    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1775  valyl-tRNA synthetase  39.73 
 
 
918 aa  736    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.651419  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0587  valyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 
909 aa  884    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0235992  normal  0.435222 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0742  valyl-tRNA synthetase  57.75 
 
 
926 aa  1110    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279651  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1796  valyl-tRNA synthetase  53 
 
 
879 aa  953    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  49.36 
 
 
880 aa  887    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2633  valyl-tRNA synthetase  56.16 
 
 
955 aa  1071    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2390  valyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 
1052 aa  813    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.122959  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2892  valyl-tRNA synthetase  47.78 
 
 
972 aa  854    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2846  valyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 
904 aa  803    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.292827  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3477  valyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 
1029 aa  728    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0964875  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2376  valyl-tRNA synthetase  52.83 
 
 
990 aa  1031    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.171381  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1369  valyl-tRNA synthetase  63.9 
 
 
922 aa  1273    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2570  valyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 
952 aa  870    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.252314  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0091  valyl-tRNA synthetase  58.81 
 
 
943 aa  1134    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3721  valyl-tRNA synthetase  54.65 
 
 
973 aa  1042    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0971795  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1335  valyl-tRNA synthetase  57.98 
 
 
959 aa  1105    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.754534  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2867  valyl-tRNA synthetase  57.42 
 
 
968 aa  1165    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2579  valyl-tRNA synthetase  48.04 
 
 
968 aa  855    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0215604 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2922  valyl-tRNA synthetase  59.9 
 
 
947 aa  1182    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.611801  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1828  valyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 
954 aa  855    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.242328  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2138  valyl-tRNA synthetase  53.63 
 
 
984 aa  1063    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.571055  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2630  valyl-tRNA synthetase  55.05 
 
 
955 aa  1035    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00324916  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0285  valyl-tRNA synthetase  53.35 
 
 
957 aa  1041    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.147472  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0132  valyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 
929 aa  807    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0431753 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1951  valyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 
925 aa  739    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1706  valyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 
1031 aa  749    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.987588 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0932  valyl-tRNA synthetase  44.59 
 
 
931 aa  776    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.919072  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0959  valyl-tRNA synthetase  56.5 
 
 
955 aa  1071    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3558  valyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 
883 aa  714    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.462597  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3564  valyl-tRNA synthetase  61.85 
 
 
921 aa  1264    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1571  valyl-tRNA synthetase  47.74 
 
 
926 aa  899    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2175  valyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 
880 aa  784    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1886  valyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 
880 aa  778    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1259  valyl-tRNA synthetase  56.22 
 
 
948 aa  1123    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3441  valyl-tRNA synthetase  45.43 
 
 
911 aa  836    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1130  valyl-tRNA synthetase  58.33 
 
 
958 aa  1188    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00231601  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1201  valyl-tRNA synthetase  58.33 
 
 
958 aa  1187    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.418789  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0555  valyl-tRNA synthetase  67.57 
 
 
917 aa  1313    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00036551 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0916  valyl-tRNA synthetase  57.63 
 
 
968 aa  1175    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.276486  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1649  valyl-tRNA synthetase  46.33 
 
 
883 aa  815    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1928  valyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 
893 aa  912    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1321  valyl-tRNA synthetase  56.5 
 
 
955 aa  1069    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14440  valyl-tRNA synthetase  58.62 
 
 
950 aa  1178    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2479  valyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 
880 aa  746    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225877  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1392  valyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 
902 aa  744    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0390871  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1219  valyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 
879 aa  754    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0322  valyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 
894 aa  739    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0513  valyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 
883 aa  754    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1441  valyl-tRNA synthetase  56.5 
 
 
955 aa  1071    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.215769  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0192  valyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 
892 aa  852    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.209132  normal  0.584595 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1474  valyl-tRNA synthetase  64.7 
 
 
929 aa  1234    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0304029  normal  0.195737 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1131  valyl-tRNA synthetase  58.33 
 
 
958 aa  1187    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00349082  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0741  valyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 
888 aa  723    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0469934  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1580  valyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 
886 aa  913    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2029  valyl-tRNA synthetase  41.93 
 
 
904 aa  736    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.162788  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0790  valyl-tRNA synthetase  59.48 
 
 
953 aa  1202    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3631  valyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 
883 aa  714    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0657894 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>