More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6497 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_04124  valyl-tRNA synthetase  47.21 
 
 
951 aa  847    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3739  valyl-tRNA synthetase  47 
 
 
951 aa  845    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0430  valyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 
880 aa  739    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.029099  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2045  valyl-tRNA synthetase  54 
 
 
887 aa  866    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0977  valyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 
948 aa  899    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1364  valyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 
909 aa  719    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1228  valyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 
876 aa  766    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0887446  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2097  valyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 
921 aa  889    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.694852  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2236  valyl-tRNA synthetase  46.24 
 
 
968 aa  788    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  46.31 
 
 
881 aa  800    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0738  valyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 
973 aa  853    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0445  valyl-tRNA synthetase  42.84 
 
 
883 aa  732    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.262089  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0948  valyl-tRNA synthetase  62.33 
 
 
910 aa  1095    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3424  valyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 
958 aa  865    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1268  valyl-tRNA synthetase  50.05 
 
 
948 aa  911    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4355  valyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 
881 aa  798    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4191  valyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 
881 aa  798    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4202  valyl-tRNA synthetase  46.31 
 
 
881 aa  799    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0927  valyl-tRNA synthetase  45.93 
 
 
955 aa  808    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0785  valyl-tRNA synthetase  46.94 
 
 
921 aa  876    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0756  valyl-tRNA synthetase  47.05 
 
 
921 aa  877    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1086  valyl-tRNA synthetase  49.95 
 
 
948 aa  910    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1850  valyl-tRNA synthetase  44.64 
 
 
984 aa  814    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.546477  normal  0.957317 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3085  valyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 
943 aa  796    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.405108 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1281  valyl-tRNA synthetase  44.41 
 
 
933 aa  773    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.202707  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0863  valyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 
955 aa  798    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0577  valyl-tRNA synthetase  48.61 
 
 
912 aa  849    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.113426  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1436  valyl-tRNA synthetase  62.79 
 
 
952 aa  1186    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.571959  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2982  valyl-tRNA synthetase  47.07 
 
 
1002 aa  779    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1846  valyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 
955 aa  808    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.344373  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1091  valyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 
929 aa  855    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0986  valyl-tRNA synthetase  49.53 
 
 
948 aa  904    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2315  valyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 
885 aa  885    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169749  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4585  valyl-tRNA synthetase  46.29 
 
 
955 aa  820    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.826772 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0386  valyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 
901 aa  690    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.673451 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2213  valyl-tRNA synthetase  47.05 
 
 
925 aa  770    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.198562  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0388  valyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 
902 aa  696    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.427268  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2558  valyl-tRNA synthetase  47.43 
 
 
914 aa  750    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0956  valyl-tRNA synthetase  54.39 
 
 
887 aa  882    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2839  valyl-tRNA synthetase  47.85 
 
 
883 aa  817    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1503  valyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 
924 aa  879    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000330515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4690  valyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 
881 aa  798    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0737  valyl-tRNA synthetase  39.61 
 
 
875 aa  692    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1775  valyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 
918 aa  754    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.651419  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0587  valyl-tRNA synthetase  47.41 
 
 
909 aa  818    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0235992  normal  0.435222 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0742  valyl-tRNA synthetase  49.05 
 
 
926 aa  858    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279651  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1796  valyl-tRNA synthetase  59.98 
 
 
879 aa  1072    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  47.8 
 
 
880 aa  806    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2633  valyl-tRNA synthetase  46.37 
 
 
955 aa  817    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2390  valyl-tRNA synthetase  51.35 
 
 
1052 aa  828    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.122959  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2892  valyl-tRNA synthetase  63.82 
 
 
972 aa  1186    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2846  valyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 
904 aa  911    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.292827  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3477  valyl-tRNA synthetase  49.47 
 
 
1029 aa  936    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0964875  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2376  valyl-tRNA synthetase  44.52 
 
 
990 aa  802    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.171381  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1369  valyl-tRNA synthetase  47.35 
 
 
922 aa  860    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2570  valyl-tRNA synthetase  63.73 
 
 
952 aa  1194    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.252314  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0091  valyl-tRNA synthetase  47.04 
 
 
943 aa  853    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3721  valyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 
973 aa  791    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0971795  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1335  valyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 
959 aa  826    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.754534  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2867  valyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 
968 aa  858    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2579  valyl-tRNA synthetase  64.05 
 
 
968 aa  1200    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0215604 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2922  valyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 
947 aa  857    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.611801  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1828  valyl-tRNA synthetase  63.25 
 
 
954 aa  1211    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.242328  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2138  valyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 
984 aa  811    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.571055  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2630  valyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 
955 aa  805    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00324916  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0285  valyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 
957 aa  786    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.147472  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0132  valyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 
929 aa  763    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0431753 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1951  valyl-tRNA synthetase  44.96 
 
 
925 aa  719    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1706  valyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 
1031 aa  932    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.987588 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0932  valyl-tRNA synthetase  51.47 
 
 
931 aa  884    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.919072  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0959  valyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 
955 aa  813    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3558  valyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 
883 aa  736    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.462597  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3564  valyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 
921 aa  865    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1571  valyl-tRNA synthetase  60 
 
 
926 aa  1108    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2175  valyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 
880 aa  773    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1886  valyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 
880 aa  776    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1259  valyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 
948 aa  870    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3441  valyl-tRNA synthetase  45.94 
 
 
911 aa  808    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1130  valyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 
958 aa  867    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00231601  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1201  valyl-tRNA synthetase  47.65 
 
 
958 aa  870    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.418789  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0555  valyl-tRNA synthetase  49.21 
 
 
917 aa  891    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00036551 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0916  valyl-tRNA synthetase  46.46 
 
 
968 aa  861    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.276486  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1649  valyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 
883 aa  751    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1928  valyl-tRNA synthetase  59.8 
 
 
893 aa  1097    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1321  valyl-tRNA synthetase  46.24 
 
 
955 aa  813    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14440  valyl-tRNA synthetase  49.37 
 
 
950 aa  897    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2479  valyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 
880 aa  733    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225877  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1392  valyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 
902 aa  721    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0390871  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1219  valyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 
879 aa  736    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0322  valyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 
894 aa  736    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0513  valyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 
883 aa  729    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1441  valyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 
955 aa  813    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.215769  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0192  valyl-tRNA synthetase  50.22 
 
 
892 aa  867    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.209132  normal  0.584595 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1474  valyl-tRNA synthetase  49.47 
 
 
929 aa  898    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0304029  normal  0.195737 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1131  valyl-tRNA synthetase  47.65 
 
 
958 aa  871    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00349082  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0741  valyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 
888 aa  738    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0469934  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1580  valyl-tRNA synthetase  52.22 
 
 
886 aa  885    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2029  valyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 
904 aa  712    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.162788  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2331  valyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 
1030 aa  829    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.748917  normal  0.908682 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0790  valyl-tRNA synthetase  48.18 
 
 
953 aa  896    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>