More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A2411 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008835  BMA10229_0780  leucyl-tRNA synthetase  99.41 
 
 
1039 aa  1025    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2411  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 
734 aa  1460    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1209  putative leucyl-tRNA synthetase  99.73 
 
 
734 aa  1454    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1134  putative leucyl-tRNA synthetase  99.73 
 
 
734 aa  1454    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0780  leucyl-tRNA synthetase  32.42 
 
 
824 aa  451  1e-125  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0757  leucyl-tRNA synthetase  32.5 
 
 
824 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1522  leucyl-tRNA synthetase  31.59 
 
 
819 aa  446  1.0000000000000001e-124  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0698  leucyl-tRNA synthetase  35.11 
 
 
829 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0323791  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1804  leucyl-tRNA synthetase  34.99 
 
 
824 aa  434  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0751  leucyl-tRNA synthetase  33.64 
 
 
824 aa  434  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1237  leucyl-tRNA synthetase  32.34 
 
 
825 aa  431  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0537  leucyl-tRNA synthetase  30.78 
 
 
826 aa  423  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.993969  normal  0.956377 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1563  leucyl-tRNA synthetase  31.7 
 
 
810 aa  425  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.954503  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0256  leucyl-tRNA synthetase  30.37 
 
 
823 aa  423  1e-117  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2209  leucyl-tRNA synthetase  32.59 
 
 
824 aa  420  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2300  leucyl-tRNA synthetase  32.2 
 
 
824 aa  420  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.284228  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2515  leucyl-tRNA synthetase  32.94 
 
 
827 aa  422  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000585626  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1731  leucyl-tRNA synthetase  33.25 
 
 
823 aa  421  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.308382  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0344  leucyl-tRNA synthetase  30.26 
 
 
828 aa  417  9.999999999999999e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.361332  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1254  leucyl-tRNA synthetase  30.84 
 
 
817 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.702652  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1599  leucyl-tRNA synthetase  31.86 
 
 
824 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000190725  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2439  leucyl-tRNA synthetase  32.77 
 
 
829 aa  414  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0366  leucyl-tRNA synthetase  34.14 
 
 
906 aa  412  1e-113  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2145  leucyl-tRNA synthetase  34.87 
 
 
817 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.736456  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1425  leucyl-tRNA synthetase  32.99 
 
 
831 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.164097  normal  0.135581 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3090  leucyl-tRNA synthetase  32.6 
 
 
834 aa  409  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.373943 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0568  leucyl-tRNA synthetase  32.68 
 
 
829 aa  408  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2116  leucyl-tRNA synthetase  32.03 
 
 
825 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3665  leucyl-tRNA synthetase  33.46 
 
 
882 aa  405  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2665  leucyl-tRNA synthetase  33.12 
 
 
819 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.364748  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2915  leucyl-tRNA synthetase  31.67 
 
 
815 aa  402  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0766  leucyl-tRNA synthetase  32.55 
 
 
824 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13370  Leucyl-tRNA synthetase  30.18 
 
 
830 aa  396  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000131776  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1413  leucyl-tRNA synthetase  31.21 
 
 
851 aa  398  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000816015  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1744  leucyl-tRNA synthetase  32.64 
 
 
818 aa  396  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.123788  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1302  leucyl-tRNA synthetase  31.02 
 
 
823 aa  393  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1301  leucyl-tRNA synthetase  30.89 
 
 
823 aa  394  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2155  leucyl-tRNA synthetase  32.63 
 
 
817 aa  395  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1638  leucyl-tRNA synthetase  33.29 
 
 
889 aa  394  1e-108  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1920  leucyl-tRNA synthetase  32.54 
 
 
865 aa  392  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3631  leucyl-tRNA synthetase  32.29 
 
 
862 aa  389  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1506  leucyl-tRNA synthetase  31.69 
 
 
820 aa  387  1e-106  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.105078  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0479  leucyl-tRNA synthetase  31.2 
 
 
877 aa  388  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3134  leucyl-tRNA synthetase  30.46 
 
 
824 aa  386  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0619  leucyl-tRNA synthetase  33.55 
 
 
821 aa  388  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0673  leucyl-tRNA synthetase  31.82 
 
 
820 aa  387  1e-106  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.343272  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0459  leucyl-tRNA synthetase  33.55 
 
 
821 aa  388  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1623  leucyl-tRNA synthetase  31.61 
 
 
837 aa  383  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2882  leucyl-tRNA synthetase  30.06 
 
 
856 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0606181  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0057  leucyl-tRNA synthetase  31.96 
 
 
829 aa  382  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.300018  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4197  leucyl-tRNA synthetase  31.16 
 
 
859 aa  382  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1865  leucyl-tRNA synthetase  33.25 
 
 
826 aa  381  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.107054  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3454  leucyl-tRNA synthetase  30.16 
 
 
814 aa  382  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3209  leucyl-tRNA synthetase  31.37 
 
 
871 aa  382  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2957  leucyl-tRNA synthetase  32.35 
 
 
865 aa  381  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3236  leucyl-tRNA synthetase  29.94 
 
 
856 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2438  leucyl-tRNA synthetase  30.84 
 
 
865 aa  378  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000200562  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4936  leucyl-tRNA synthetase  29.78 
 
 
872 aa  379  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1446  leucyl-tRNA synthetase  32.39 
 
 
894 aa  378  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.943186 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3031  leucyl-tRNA synthetase  30.93 
 
 
858 aa  379  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.10606  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1328  leucyl-tRNA synthetase  31.6 
 
 
856 aa  376  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0645  leucyl-tRNA synthetase  30.78 
 
 
816 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0194  leucyl-tRNA synthetase  30.14 
 
 
813 aa  373  1e-102  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.159225  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0159  leucyl-tRNA synthetase  30.14 
 
 
813 aa  374  1e-102  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2727  leucyl-tRNA synthetase  33.89 
 
 
858 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.354364  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3143  leucyl-tRNA synthetase  30.01 
 
 
868 aa  375  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0606298  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3308  leucyl-tRNA synthetase  30.8 
 
 
819 aa  375  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0417159 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0400  leucyl-tRNA synthetase  32.3 
 
 
864 aa  375  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.8894  normal  0.692139 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3306  leucyl-tRNA synthetase  30.67 
 
 
828 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000102477  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1858  leucyl-tRNA synthetase  32.12 
 
 
875 aa  372  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.663108 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4794  leucyl-tRNA synthetase  31.16 
 
 
868 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.232287 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2929  leucyl-tRNA synthetase  30.36 
 
 
863 aa  372  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.010661 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1860  leucyl-tRNA synthetase  29.98 
 
 
854 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_182  leucyl-tRNA synthetase  30.14 
 
 
813 aa  370  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00206077  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4352  leucyl-tRNA synthetase  30.34 
 
 
868 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.964178  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4847  leucyl-tRNA synthetase  30.91 
 
 
868 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4669  leucyl-tRNA synthetase  31.16 
 
 
906 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4108  leucyl-tRNA synthetase  32.43 
 
 
861 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.978301  normal  0.593628 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0255  leucyl-tRNA synthetase  30.68 
 
 
816 aa  370  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00083346  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1095  leucyl-tRNA synthetase  30.6 
 
 
877 aa  371  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.768167  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3447  leucyl-tRNA synthetase  30.47 
 
 
874 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121594 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3479  leucyl-tRNA synthetase  29.95 
 
 
863 aa  369  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000160913 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3702  leucyl-tRNA synthetase  30.6 
 
 
859 aa  372  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.031134  hitchhiker  0.000000516313 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1098  leucyl-tRNA synthetase  30.35 
 
 
859 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000277445 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1722  leucyl-tRNA synthetase  30.06 
 
 
863 aa  366  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2582  leucyl-tRNA synthetase  30.41 
 
 
864 aa  369  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.60297 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1174  leucyl-tRNA synthetase  29.73 
 
 
859 aa  367  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4812  leucyl-tRNA synthetase  30.12 
 
 
868 aa  369  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3311  leucyl-tRNA synthetase  30.22 
 
 
874 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134968  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0901  leucyl-tRNA synthetase  32.99 
 
 
919 aa  369  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.102143  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1579  leucyl-tRNA synthetase  31.96 
 
 
901 aa  369  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.301651  normal  0.048228 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3269  leucyl-tRNA synthetase  30.35 
 
 
874 aa  369  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1538  tRNA synthetase class I (M)  33.92 
 
 
727 aa  366  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.978388 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0997  leucyl-tRNA synthetase  29.4 
 
 
859 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.248445  normal  0.169991 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1062  leucyl-tRNA synthetase  29.4 
 
 
859 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0109864 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2911  leucyl-tRNA synthetase  33.89 
 
 
832 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.084861  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2819  leucyl-tRNA synthetase  33.81 
 
 
832 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1001  leucyl-tRNA synthetase  29.4 
 
 
859 aa  367  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.355839  normal  0.124376 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0627  leucyl-tRNA synthetase  30.15 
 
 
868 aa  366  1e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.339775  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2863  leucyl-tRNA synthetase  29.85 
 
 
859 aa  365  1e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>