109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_25613 on replicon NC_009369
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009369  OSTLU_25613  predicted protein  100 
 
 
761 aa  1558    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.290636  normal  0.0273936 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_89893  predicted protein  36.36 
 
 
635 aa  208  3e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_88951  predicted protein  36.36 
 
 
1411 aa  207  5e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0952307  normal  0.0640471 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_50201  predicted protein  36 
 
 
1043 aa  205  2e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00844273 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32991  predicted protein  28.36 
 
 
918 aa  89  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0660064  normal  0.166301 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87084  predicted protein  33.03 
 
 
997 aa  83.6  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.019106  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  32.67 
 
 
971 aa  75.5  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  25.98 
 
 
761 aa  75.1  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  24.71 
 
 
868 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  24.92 
 
 
891 aa  72.8  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  24.79 
 
 
891 aa  72.8  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  31.53 
 
 
869 aa  72.4  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  26.93 
 
 
840 aa  71.6  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  26.16 
 
 
785 aa  68.9  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  22.71 
 
 
868 aa  67.4  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  24.85 
 
 
762 aa  67  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3169  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  41.44 
 
 
852 aa  66.6  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.0000002594 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  39.47 
 
 
950 aa  67.4  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  28.28 
 
 
835 aa  67  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  29.85 
 
 
873 aa  66.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  27.14 
 
 
788 aa  66.2  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  24.63 
 
 
781 aa  66.2  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  29.5 
 
 
785 aa  66.2  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  23.53 
 
 
758 aa  65.9  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  21.53 
 
 
869 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  30.35 
 
 
907 aa  64.7  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  25.7 
 
 
762 aa  64.7  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  23.3 
 
 
865 aa  63.9  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  20.29 
 
 
868 aa  63.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  22.35 
 
 
868 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  23.96 
 
 
868 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  27.75 
 
 
799 aa  63.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  44.74 
 
 
794 aa  61.2  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1574  pyruvate,water dikinase  30.1 
 
 
366 aa  61.6  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  26.09 
 
 
760 aa  61.6  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  22.42 
 
 
869 aa  61.2  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1951  phosphoenolpyruvate synthase  21.53 
 
 
871 aa  60.8  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  25.99 
 
 
825 aa  60.5  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  19.71 
 
 
868 aa  60.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  19.71 
 
 
868 aa  60.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2857  phosphoenolpyruvate synthase  26.5 
 
 
892 aa  60.5  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1883  phosphoenolpyruvate synthase  27.97 
 
 
778 aa  60.1  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  24.15 
 
 
887 aa  60.8  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  25.84 
 
 
761 aa  59.7  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  23.45 
 
 
824 aa  58.9  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  26.87 
 
 
902 aa  58.9  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  25.51 
 
 
870 aa  58.5  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0620  phosphoenolpyruvate synthase  24.02 
 
 
842 aa  58.5  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  22.09 
 
 
758 aa  58.2  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  42.11 
 
 
779 aa  57.8  0.0000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5551  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  42.67 
 
 
826 aa  57  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0952263  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  22.94 
 
 
754 aa  57.4  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  22.49 
 
 
868 aa  57.4  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  43.42 
 
 
867 aa  57.4  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  24.38 
 
 
758 aa  55.8  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  23.76 
 
 
758 aa  55.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  25.6 
 
 
764 aa  55.5  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  28 
 
 
903 aa  55.5  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  28.87 
 
 
782 aa  55.1  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  41.1 
 
 
906 aa  54.7  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  22.32 
 
 
757 aa  54.3  0.000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2689  phosphoenolpyruvate synthase  26.77 
 
 
871 aa  53.9  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.769187 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1886  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  29.76 
 
 
1037 aa  53.9  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  21.89 
 
 
890 aa  52.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3294  phosphoenolpyruvate synthase  28.77 
 
 
837 aa  52.8  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  24.87 
 
 
758 aa  52.4  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  36.11 
 
 
821 aa  52.4  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2632  pyruvate, water dikinase  35.06 
 
 
886 aa  52  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514233  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  22.09 
 
 
758 aa  51.6  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  25.38 
 
 
866 aa  51.2  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  22.41 
 
 
809 aa  50.8  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  25.22 
 
 
809 aa  50.8  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  28.14 
 
 
769 aa  50.8  0.00009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  22.92 
 
 
874 aa  50.8  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2757  phosphoenolpyruvate synthase  29.86 
 
 
825 aa  50.4  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112987 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  27.46 
 
 
810 aa  50.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4547  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  27.32 
 
 
386 aa  50.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.529657  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  24.51 
 
 
810 aa  50.4  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4240  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  34.21 
 
 
302 aa  50.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  24.24 
 
 
887 aa  50.1  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2081  phosphoenolpyruvate synthase  27.65 
 
 
821 aa  50.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.217364 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  24.37 
 
 
758 aa  49.7  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1605  putative phosphoenolpyruvate synthase (pyruvate, water dikinase) (PEP synthase)  24.93 
 
 
364 aa  50.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23280  phosphoenolpyruvate synthase  26.84 
 
 
790 aa  49.7  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1949  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  25 
 
 
868 aa  49.7  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3073  phosphoenolpyruvate synthase  26.47 
 
 
806 aa  49.3  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2549  phosphoenolpyruvate synthase  25.28 
 
 
789 aa  49.3  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00670387  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3844  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  23.83 
 
 
889 aa  48.5  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193358  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4143  phosphoenolpyruvate synthase  27 
 
 
885 aa  48.5  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.917793  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1355  pyruvate, water dikinase  24.23 
 
 
870 aa  47.8  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.590002  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3011  phosphoenolpyruvate synthase  23.65 
 
 
726 aa  47.8  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000544209  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0510  pyruvate, water dikinase  25.13 
 
 
334 aa  47.8  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.749276  normal  0.163777 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1010  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  23.35 
 
 
725 aa  47.8  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0583662 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2869  phosphoenolpyruvate synthase  27.07 
 
 
810 aa  47.8  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1890  phosphoenolpyruvate synthase  25.35 
 
 
815 aa  47  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15516  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1185  pyruvate, water dikinase  34.62 
 
 
275 aa  47  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  24.75 
 
 
812 aa  47.4  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3009  phosphoenolpyruvate synthase  26.26 
 
 
885 aa  47.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.963609  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2649  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  28.03 
 
 
884 aa  47.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0604  pyruvate,water dikinase  26.21 
 
 
828 aa  46.6  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.722423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>