99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1832 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1832  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  231  3e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.643007 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2789  PAAR  68.6 
 
 		 105 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0285082  normal  0.643653 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3229  PAAR repeat-containing protein  62.77 
 
 		 125 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.784559  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2823  PAAR  60.22 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.248108  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  43.04 
 
 		 855 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2512  PAAR repeat-containing protein  43.9 
 
 		 461 aa  58.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3775  helix-turn-helix, AraC type  40.23 
 
 		 540 aa  57.8  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1762  S-type Pyocin domain protein  43.21 
 
 		 592 aa  57.8  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.842268  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  35.92 
 
 		 1229 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  34.26 
 
 		 1140 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2824  PAAR repeat-containing protein  41.46 
 
 		 456 aa  53.5  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  42.31 
 
 		 1446 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  31.43 
 
 		 1494 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0335  phosphomethylpyrimidine kinase  36.08 
 
 		 466 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  31.43 
 
 		 1487 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  31.43 
 
 		 1494 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3237  PAAR repeat-containing protein  41.46 
 
 		 456 aa  51.6  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  35.35 
 
 		 1386 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  39.51 
 
 		 1410 aa  50.8  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13390  hypothetical protein  47.06 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.694836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2758  PAAR repeat-containing protein  41.33 
 
 		 406 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.011226  normal  0.594441 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  37.97 
 
 		 1379 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0167  PAAR motif-containing protein  35.87 
 
 		 434 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01140  hypothetical protein  35.87 
 
 		 439 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.337487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1375  hypothetical protein  41.43 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1487  hypothetical protein  41.43 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3189  PAAR  47.89 
 
 		 179 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000563624  normal  0.0101045 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3257  phospholipase  35.35 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1933  hypothetical protein  41.43 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.437676  normal  0.622076 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  34.57 
 
 		 1421 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5592  PAAR  44.62 
 
 		 469 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  40.85 
 
 		 1422 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  29.52 
 
 		 1495 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4045  hypothetical protein  46.81 
 
 		 88 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1157  PAAR repeat-containing protein  37.97 
 
 		 100 aa  47  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.811725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2694  YD repeat protein  32.93 
 
 		 1428 aa  47  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00194911  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1400 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  33.33 
 
 		 1385 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  40 
 
 		 1419 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  37.5 
 
 		 1411 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000030  hypothetical protein  46.97 
 
 		 96 aa  47  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4114  PAAR repeat-containing protein  40.24 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.916002  hitchhiker  0.00152888 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0093  hypothetical protein  43.08 
 
 		 481 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4969  PAAR  37.1 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1609  YD repeat protein  35.62 
 
 		 1447 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0641  hypothetical protein  38.81 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.73895  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2358  PAAR repeat-containing protein  38.75 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3019  hypothetical protein  39.39 
 
 		 84 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.746993 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5430  hypothetical protein  42.65 
 
 		 174 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2551  PAAR repeat-containing protein  41.82 
 
 		 89 aa  45.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0699  PAAR repeat-containing protein  40.28 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1293  PAAR  44.12 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.455231 
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  30.77 
 
 		 1517 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3017  PAAR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 444 aa  44.3  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.501568  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4633  hypothetical protein  42.65 
 
 		 177 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.53967  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1680  PAAR repeat-containing protein  41.82 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  37.31 
 
 		 1527 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3426  hypothetical protein  41.33 
 
 		 386 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.967185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  39.19 
 
 		 1418 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  39.19 
 
 		 1402 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  39.19 
 
 		 1390 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  33.8 
 
 		 1423 aa  44.3  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0945  hypothetical protein  43.42 
 
 		 176 aa  43.9  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00120455  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  38.96 
 
 		 1409 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  34.25 
 
 		 1475 aa  43.5  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1081  hypothetical protein  39.19 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.738335 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0895  hypothetical protein  44.44 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.457574 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1039  PAAR  44.44 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0059  PAAR repeat-containing protein  35.06 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  34.25 
 
 		 1457 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2662  PAAR repeat-containing protein  38.27 
 
 		 323 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3606  PAAR repeat-containing protein  42.11 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3584  PAAR repeat-containing protein  38.24 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  30.85 
 
 		 1359 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_002978  WD0281  hypothetical protein  39.06 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3156  PAAR repeat-containing protein  43.75 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6683  PAAR repeat-containing protein  41.1 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4551  PAAR repeat-containing protein  44.62 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3115  PAAR repeat-containing protein  36.99 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0483  PAAR repeat-containing protein  38.03 
 
 		 597 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3817  PAAR  42.25 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153298  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3238  PAAR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.198697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53640  hypothetical protein  44.12 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0232155  hitchhiker  0.000303708 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2610  hypothetical protein  36.99 
 
 		 85 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408788  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05511  paar motif family  36.84 
 
 		 86 aa  41.6  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0211513  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0368  PAAR repeat-containing protein  36.25 
 
 		 100 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0051  YD repeat protein  48.98 
 
 		 1437 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2560  PAAR repeat-containing protein  35.21 
 
 		 174 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.801514  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3018  PAAR repeat-containing protein  41.1 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.820198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0585  YD repeat-containing protein  43.75 
 
 		 1600 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5249  PAAR repeat-containing protein  52.38 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000530651 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  36.62 
 
 		 1604 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  39.02 
 
 		 1530 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1867  hypothetical protein  41.03 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0034  hypothetical protein  40 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.543283  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2854  hypothetical protein  36.92 
 
 		 85 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.561027  normal  0.0963885 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0056  PAAR repeat-containing protein  32.86 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3079  YD repeat-containing protein  38.78 
 
 		 1505 aa  40.4  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0647  RHS Repeat family protein  38.78 
 
 		 1616 aa  40  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>