66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0368 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0368  PAAR repeat-containing protein  100 
 
 		 100 aa  191  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3928  PAAR repeat-containing protein  80.61 
 
 		 100 aa  152  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00719724  normal  0.0225395 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3002  PAAR  79 
 
 		 99 aa  152  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0675  PAAR repeat-containing protein  77 
 
 		 99 aa  149  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2461  hypothetical protein  78 
 
 		 99 aa  149  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5249  PAAR repeat-containing protein  72 
 
 		 96 aa  134  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000530651 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4114  PAAR repeat-containing protein  71 
 
 		 96 aa  130  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.916002  hitchhiker  0.00152888 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1168  putative type VI secretion protein VasV-1, PAAR domain protein  70 
 
 		 98 aa  129  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173375  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3156  PAAR repeat-containing protein  64.95 
 
 		 96 aa  116  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1664  PAAR repeat-containing protein  66 
 
 		 96 aa  116  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121011 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2816  PAAR repeat-containing protein  66 
 
 		 96 aa  115  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2373  PAAR repeat-containing protein  62 
 
 		 96 aa  105  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0352022 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2358  PAAR repeat-containing protein  61 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3584  PAAR repeat-containing protein  67.06 
 
 		 84 aa  100  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000030  hypothetical protein  54 
 
 		 96 aa  91.7  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1081  hypothetical protein  55.34 
 
 		 102 aa  84  6e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.738335 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0699  PAAR repeat-containing protein  50.51 
 
 		 113 aa  80.1  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3826  PAAR repeat-containing protein  50 
 
 		 99 aa  72.4  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2253  PAAR repeat-containing protein  46.67 
 
 		 105 aa  67.4  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175584  hitchhiker  0.000480373 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2551  PAAR repeat-containing protein  47.52 
 
 		 89 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1680  PAAR repeat-containing protein  46.53 
 
 		 89 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1650  hypothetical protein  41.18 
 
 		 94 aa  60.5  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3608  PAAR  41.51 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000736395 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0335  phosphomethylpyrimidine kinase  42.27 
 
 		 466 aa  58.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1043  hypothetical protein  44.34 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3775  helix-turn-helix, AraC type  40.82 
 
 		 540 aa  57  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0985  hypothetical protein  49.3 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0761318  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1907  PAAR repeat-containing protein  47.66 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0142709  hitchhiker  0.000734481 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0093  hypothetical protein  39.8 
 
 		 481 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5383  PAAR repeat-containing protein  43.93 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4551  PAAR repeat-containing protein  41.41 
 
 		 185 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1762  S-type Pyocin domain protein  39.29 
 
 		 592 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.842268  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5592  PAAR  37.11 
 
 		 469 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4633  hypothetical protein  41.24 
 
 		 177 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.53967  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1039  PAAR  45.1 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0895  hypothetical protein  45.1 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.457574 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0240  PAAR repeat-containing protein  46.77 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53640  hypothetical protein  41 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0232155  hitchhiker  0.000303708 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3189  PAAR  41.75 
 
 		 179 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000563624  normal  0.0101045 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5430  hypothetical protein  38 
 
 		 174 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3115  PAAR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  37.18 
 
 		 1457 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  37.18 
 
 		 1475 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  40.28 
 
 		 1422 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  40.91 
 
 		 1379 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2610  hypothetical protein  35.71 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408788  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0685  PAAR  34.02 
 
 		 379 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3238  PAAR repeat-containing protein  34.69 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.198697  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  43.08 
 
 		 855 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3817  PAAR  38.14 
 
 		 181 aa  43.9  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153298  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3756  hypothetical protein  34.02 
 
 		 386 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.136459  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  47.62 
 
 		 1446 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0768  hypothetical protein  42.25 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  35.53 
 
 		 1423 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1578  Rhs family protein  36.08 
 
 		 1556 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.883586  normal  0.184607 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  34.94 
 
 		 1386 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2512  PAAR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 461 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0051  YD repeat protein  43.75 
 
 		 1437 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2824  PAAR repeat-containing protein  39.29 
 
 		 456 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05511  paar motif family  42.86 
 
 		 86 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0211513  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1609  YD repeat protein  48.78 
 
 		 1447 aa  41.6  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1832  hypothetical protein  36.25 
 
 		 118 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.643007 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  36.47 
 
 		 1229 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1115  protein RhsA  60 
 
 		 1388 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3237  PAAR repeat-containing protein  37.17 
 
 		 456 aa  40.4  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4775  PAAR repeat-containing protein  34.51 
 
 		 105 aa  40.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110358  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>