70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1664 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1664  PAAR repeat-containing protein  100 
 
 		 96 aa  180  7e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121011 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2816  PAAR repeat-containing protein  96.88 
 
 		 96 aa  174  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5249  PAAR repeat-containing protein  73.96 
 
 		 96 aa  132  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000530651 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4114  PAAR repeat-containing protein  71.88 
 
 		 96 aa  131  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.916002  hitchhiker  0.00152888 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3156  PAAR repeat-containing protein  69.89 
 
 		 96 aa  124  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2461  hypothetical protein  70.71 
 
 		 99 aa  124  5e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3928  PAAR repeat-containing protein  71.13 
 
 		 100 aa  120  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00719724  normal  0.0225395 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0368  PAAR repeat-containing protein  66 
 
 		 100 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2373  PAAR repeat-containing protein  66.67 
 
 		 96 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0352022 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3002  PAAR  64.65 
 
 		 99 aa  115  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0675  PAAR repeat-containing protein  64.65 
 
 		 99 aa  113  6.9999999999999995e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1168  putative type VI secretion protein VasV-1, PAAR domain protein  63.64 
 
 		 98 aa  110  9e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173375  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3584  PAAR repeat-containing protein  70.13 
 
 		 84 aa  101  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000030  hypothetical protein  55.32 
 
 		 96 aa  92  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2358  PAAR repeat-containing protein  59.57 
 
 		 96 aa  91.3  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1081  hypothetical protein  54.9 
 
 		 102 aa  86.3  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.738335 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2253  PAAR repeat-containing protein  56.44 
 
 		 105 aa  85.5  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175584  hitchhiker  0.000480373 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0699  PAAR repeat-containing protein  56.38 
 
 		 113 aa  85.1  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3826  PAAR repeat-containing protein  52.87 
 
 		 99 aa  80.5  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1680  PAAR repeat-containing protein  54.65 
 
 		 89 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5383  PAAR repeat-containing protein  52.43 
 
 		 93 aa  70.1  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2551  PAAR repeat-containing protein  55.81 
 
 		 89 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1907  PAAR repeat-containing protein  51.46 
 
 		 93 aa  68.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0142709  hitchhiker  0.000734481 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3608  PAAR  49.02 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000736395 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1043  hypothetical protein  48.04 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1650  hypothetical protein  39.08 
 
 		 94 aa  60.1  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0985  hypothetical protein  55.88 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0761318  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0335  phosphomethylpyrimidine kinase  43.01 
 
 		 466 aa  53.9  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4551  PAAR repeat-containing protein  44.21 
 
 		 185 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1578  Rhs family protein  46.39 
 
 		 1556 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.883586  normal  0.184607 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4775  PAAR repeat-containing protein  39.45 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  43.48 
 
 		 1379 aa  51.6  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1039  PAAR  43.18 
 
 		 89 aa  51.2  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3775  helix-turn-helix, AraC type  40.43 
 
 		 540 aa  51.2  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0895  hypothetical protein  43.18 
 
 		 89 aa  51.2  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.457574 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53640  hypothetical protein  43.01 
 
 		 172 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0232155  hitchhiker  0.000303708 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3019  hypothetical protein  39.77 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.746993 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0240  PAAR repeat-containing protein  40.86 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1867  hypothetical protein  35.37 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  43.28 
 
 		 1229 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2610  hypothetical protein  35.23 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408788  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3238  PAAR repeat-containing protein  34.09 
 
 		 85 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.198697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6243  hypothetical protein  40 
 
 		 124 aa  47  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.574956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3115  PAAR repeat-containing protein  34.09 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  42.03 
 
 		 855 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2946  PAAR repeat-containing protein  40.4 
 
 		 103 aa  45.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2854  hypothetical protein  35.23 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.561027  normal  0.0963885 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4633  hypothetical protein  36.56 
 
 		 177 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.53967  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5592  PAAR  37.63 
 
 		 469 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3426  hypothetical protein  38.37 
 
 		 386 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.967185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0685  PAAR  34.78 
 
 		 379 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3756  hypothetical protein  34.78 
 
 		 386 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.136459  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1762  S-type Pyocin domain protein  38.89 
 
 		 592 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.842268  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  41.56 
 
 		 1140 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4045  hypothetical protein  37.5 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  40.79 
 
 		 1386 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1487  hypothetical protein  39.58 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1933  hypothetical protein  39.58 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.437676  normal  0.622076 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0925  PAAR repeat-containing protein  52.24 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1375  hypothetical protein  39.58 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2758  PAAR repeat-containing protein  41.1 
 
 		 406 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.011226  normal  0.594441 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0093  hypothetical protein  37.89 
 
 		 481 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  35.71 
 
 		 1422 aa  41.6  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  40.91 
 
 		 1446 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  35.96 
 
 		 1421 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3189  PAAR  37.89 
 
 		 179 aa  40.8  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000563624  normal  0.0101045 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  38.71 
 
 		 1381 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6127  PAAR repeat-containing protein  35.23 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0581987  normal  0.43186 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3817  PAAR  35.79 
 
 		 181 aa  40.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153298  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3806  PAAR  38.95 
 
 		 165 aa  40.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159045 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>