54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3756 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3756  hypothetical protein  100 
 
 		 386 aa  797    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.136459  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0685  PAAR  75.32 
 
 		 379 aa  596  1e-169  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2589  hypothetical protein  28.07 
 
 		 352 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2991  PAAR domain-containing protein  28.07 
 
 		 352 aa  102  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000680915 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0797  PAAR domain-containing protein  27.54 
 
 		 352 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0093  hypothetical protein  50 
 
 		 481 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4551  PAAR repeat-containing protein  51.22 
 
 		 185 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5592  PAAR  46.34 
 
 		 469 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53640  hypothetical protein  46.81 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0232155  hitchhiker  0.000303708 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3189  PAAR  42.86 
 
 		 179 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000563624  normal  0.0101045 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5430  hypothetical protein  43.9 
 
 		 174 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3817  PAAR  43.96 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153298  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3806  PAAR  44.9 
 
 		 165 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159045 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3851  hypothetical protein  26.88 
 
 		 333 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.652858  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4633  hypothetical protein  42.86 
 
 		 177 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.53967  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13390  hypothetical protein  41.46 
 
 		 131 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.694836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0943  hypothetical protein  54.9 
 
 		 87 aa  63.5  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00127142  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1878  hypothetical protein  54.9 
 
 		 87 aa  63.5  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0199793  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3827  PAAR repeat-containing protein  54.9 
 
 		 87 aa  63.5  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86819  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4045  hypothetical protein  46.75 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1156  hypothetical protein  27.89 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.11476  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3019  hypothetical protein  44.74 
 
 		 84 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.746993 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2610  hypothetical protein  41.89 
 
 		 85 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408788  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2512  PAAR repeat-containing protein  41 
 
 		 461 aa  57.8  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3238  PAAR repeat-containing protein  39.47 
 
 		 85 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.198697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3115  PAAR repeat-containing protein  39.47 
 
 		 85 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2301  PAAR repeat-containing protein  57.14 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360683  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6138  PAAR repeat-containing protein  42.86 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617294 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2854  hypothetical protein  40.54 
 
 		 85 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.561027  normal  0.0963885 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4128  PAAR  46.27 
 
 		 164 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6127  PAAR repeat-containing protein  40.79 
 
 		 84 aa  53.1  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0581987  normal  0.43186 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0699  PAAR repeat-containing protein  36.46 
 
 		 113 aa  52.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4550  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.84 
 
 		 1040 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3002  PAAR  33.68 
 
 		 99 aa  49.7  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5249  PAAR repeat-containing protein  35.79 
 
 		 96 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000530651 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000030  hypothetical protein  39.33 
 
 		 96 aa  49.3  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3257  phospholipase  37.76 
 
 		 101 aa  48.1  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3928  PAAR repeat-containing protein  35.87 
 
 		 100 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00719724  normal  0.0225395 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4114  PAAR repeat-containing protein  39.13 
 
 		 96 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.916002  hitchhiker  0.00152888 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3794  hypothetical protein  43.48 
 
 		 137 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00747922  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0675  PAAR repeat-containing protein  36.84 
 
 		 99 aa  47.4  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1762  S-type Pyocin domain protein  36.11 
 
 		 592 aa  47.4  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.842268  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2358  PAAR repeat-containing protein  39.13 
 
 		 96 aa  47  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2824  PAAR repeat-containing protein  36.11 
 
 		 456 aa  47  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3237  PAAR repeat-containing protein  36.7 
 
 		 456 aa  47  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1168  putative type VI secretion protein VasV-1, PAAR domain protein  35.11 
 
 		 98 aa  46.6  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173375  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2461  hypothetical protein  33.68 
 
 		 99 aa  46.2  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1081  hypothetical protein  36.73 
 
 		 102 aa  45.1  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.738335 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3252  PAAR repeat-containing protein  46 
 
 		 86 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.447164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2373  PAAR repeat-containing protein  38.04 
 
 		 96 aa  44.7  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0352022 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1043  hypothetical protein  43.33 
 
 		 92 aa  44.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0368  PAAR repeat-containing protein  34.02 
 
 		 100 aa  43.9  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3156  PAAR repeat-containing protein  35.16 
 
 		 96 aa  43.5  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1650  hypothetical protein  36.59 
 
 		 94 aa  42.7  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>