131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000030 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000030  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  183  9e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2358  PAAR repeat-containing protein  69.79 
 
 
96 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3156  PAAR repeat-containing protein  63.54 
 
 
96 aa  113  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4114  PAAR repeat-containing protein  61.7 
 
 
96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.916002  hitchhiker  0.00152888 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5249  PAAR repeat-containing protein  61.7 
 
 
96 aa  105  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000530651 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3928  PAAR repeat-containing protein  59 
 
 
100 aa  104  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00719724  normal  0.0225395 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1168  putative type VI secretion protein VasV-1, PAAR domain protein  58.33 
 
 
98 aa  102  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173375  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2373  PAAR repeat-containing protein  57.45 
 
 
96 aa  99.8  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0352022 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0675  PAAR repeat-containing protein  56.7 
 
 
99 aa  94  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2461  hypothetical protein  54.64 
 
 
99 aa  92.8  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1664  PAAR repeat-containing protein  55.32 
 
 
96 aa  92  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.121011 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3002  PAAR  53.61 
 
 
99 aa  92  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0368  PAAR repeat-containing protein  54 
 
 
100 aa  91.7  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2816  PAAR repeat-containing protein  54.26 
 
 
96 aa  89.7  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3584  PAAR repeat-containing protein  64.56 
 
 
84 aa  89.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0699  PAAR repeat-containing protein  48.96 
 
 
113 aa  86.7  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0335  phosphomethylpyrimidine kinase  52.13 
 
 
466 aa  79  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3826  PAAR repeat-containing protein  52.17 
 
 
99 aa  77.8  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1081  hypothetical protein  48.48 
 
 
102 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.738335 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3775  helix-turn-helix, AraC type  49.46 
 
 
540 aa  69.3  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2512  PAAR repeat-containing protein  49.37 
 
 
461 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53640  hypothetical protein  47.37 
 
 
172 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0232155  hitchhiker  0.000303708 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1650  hypothetical protein  42.7 
 
 
94 aa  62.8  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1762  S-type Pyocin domain protein  43.88 
 
 
592 aa  61.6  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.842268  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5430  hypothetical protein  44.79 
 
 
174 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0985  hypothetical protein  54.41 
 
 
98 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0761318  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  37 
 
 
1422 aa  60.8  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0240  PAAR repeat-containing protein  48.57 
 
 
113 aa  60.5  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0093  hypothetical protein  46.94 
 
 
481 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  48 
 
 
855 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2253  PAAR repeat-containing protein  40.59 
 
 
105 aa  58.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175584  hitchhiker  0.000480373 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  45.33 
 
 
1229 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2758  PAAR repeat-containing protein  44.68 
 
 
406 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.011226  normal  0.594441 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5592  PAAR  41.67 
 
 
469 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2184  PAAR repeat-containing protein  52.94 
 
 
88 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.062242  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  41.46 
 
 
1446 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4775  PAAR repeat-containing protein  38.83 
 
 
105 aa  55.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110358  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4551  PAAR repeat-containing protein  44.79 
 
 
185 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3448  PAAR repeat-containing protein  50.77 
 
 
88 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.86089  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05511  paar motif family  37.5 
 
 
86 aa  55.1  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0211513  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  37.04 
 
 
1381 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2824  PAAR repeat-containing protein  44.3 
 
 
456 aa  53.9  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3019  hypothetical protein  40.22 
 
 
84 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.746993 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  37.04 
 
 
1541 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  37.04 
 
 
1541 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  37.04 
 
 
1541 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  37.04 
 
 
1541 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  37.04 
 
 
1541 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13390  hypothetical protein  44.79 
 
 
131 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.694836  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  37.04 
 
 
1541 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  42.68 
 
 
1421 aa  52.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3608  PAAR  47.22 
 
 
92 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000736395 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3115  PAAR repeat-containing protein  36.96 
 
 
85 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3238  PAAR repeat-containing protein  36.96 
 
 
85 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.198697  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2610  hypothetical protein  36.96 
 
 
85 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408788  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3806  PAAR  42.71 
 
 
165 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.159045 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  42.47 
 
 
1475 aa  51.6  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0034  hypothetical protein  49.33 
 
 
94 aa  52  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.543283  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3426  hypothetical protein  39.36 
 
 
386 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.967185  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3237  PAAR repeat-containing protein  41.77 
 
 
456 aa  51.6  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  42.47 
 
 
1457 aa  51.2  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1907  PAAR repeat-containing protein  45.21 
 
 
93 aa  51.2  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0142709  hitchhiker  0.000734481 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  42.47 
 
 
1423 aa  50.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4633  hypothetical protein  42.71 
 
 
177 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.53967  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0685  PAAR  40.45 
 
 
379 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1157  PAAR repeat-containing protein  45.83 
 
 
100 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.811725  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3756  hypothetical protein  39.33 
 
 
386 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.136459  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  35.8 
 
 
1553 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3817  PAAR  42.71 
 
 
181 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153298  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  37.33 
 
 
1379 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6127  PAAR repeat-containing protein  39.13 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0581987  normal  0.43186 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6138  PAAR repeat-containing protein  38.37 
 
 
94 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.617294 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2551  PAAR repeat-containing protein  50.75 
 
 
89 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  38.03 
 
 
1517 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1867  hypothetical protein  48 
 
 
107 aa  47.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3017  PAAR repeat-containing protein  39.36 
 
 
444 aa  47.4  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.501568  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1043  hypothetical protein  45.83 
 
 
92 aa  47.4  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1680  PAAR repeat-containing protein  50.75 
 
 
89 aa  47.4  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4045  hypothetical protein  38.89 
 
 
88 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  45.59 
 
 
1140 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1832  hypothetical protein  46.97 
 
 
118 aa  47  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.643007 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1578  Rhs family protein  41.49 
 
 
1556 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.883586  normal  0.184607 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03898  paar motif family  42.42 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.356089  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3606  PAAR repeat-containing protein  46.67 
 
 
96 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0945  hypothetical protein  50 
 
 
176 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00120455  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4969  PAAR  34.92 
 
 
102 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3189  PAAR  37.5 
 
 
179 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000563624  normal  0.0101045 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  37.5 
 
 
1494 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  37.5 
 
 
1494 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  38.36 
 
 
1527 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  37.5 
 
 
1487 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3018  PAAR repeat-containing protein  39.8 
 
 
88 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.820198  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  36.25 
 
 
1359 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2373  hypothetical protein  44.83 
 
 
94 aa  44.7  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5383  PAAR repeat-containing protein  43.84 
 
 
93 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  40.24 
 
 
1386 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6683  PAAR repeat-containing protein  44.59 
 
 
88 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0011  PAAR repeat-containing protein  37.68 
 
 
83 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2662  PAAR repeat-containing protein  45.33 
 
 
323 aa  43.9  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1609  YD repeat protein  39.73 
 
 
1447 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>