45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3826 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3826  PAAR repeat-containing protein  100 
 
 		 99 aa  196  7e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1650  hypothetical protein  48.42 
 
 		 94 aa  94.7  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1664  PAAR repeat-containing protein  52.87 
 
 		 96 aa  80.5  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121011 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2816  PAAR repeat-containing protein  54.32 
 
 		 96 aa  79.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000030  hypothetical protein  52.17 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4114  PAAR repeat-containing protein  56.79 
 
 		 96 aa  77  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.916002  hitchhiker  0.00152888 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2358  PAAR repeat-containing protein  52.44 
 
 		 96 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2461  hypothetical protein  51.81 
 
 		 99 aa  73.9  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3928  PAAR repeat-containing protein  53.01 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00719724  normal  0.0225395 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0368  PAAR repeat-containing protein  50 
 
 		 100 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3002  PAAR  48.81 
 
 		 99 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0675  PAAR repeat-containing protein  48.81 
 
 		 99 aa  70.9  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5249  PAAR repeat-containing protein  53.09 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000530651 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3156  PAAR repeat-containing protein  51.85 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1168  putative type VI secretion protein VasV-1, PAAR domain protein  43.37 
 
 		 98 aa  62  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173375  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3584  PAAR repeat-containing protein  50 
 
 		 84 aa  60.1  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1081  hypothetical protein  44.83 
 
 		 102 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.738335 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3019  hypothetical protein  41.24 
 
 		 84 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.746993 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2373  PAAR repeat-containing protein  49.38 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0352022 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2854  hypothetical protein  38.95 
 
 		 85 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.561027  normal  0.0963885 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4045  hypothetical protein  39.18 
 
 		 88 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2610  hypothetical protein  35.05 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408788  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3115  PAAR repeat-containing protein  34.02 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3238  PAAR repeat-containing protein  34.02 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.198697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6127  PAAR repeat-containing protein  35.05 
 
 		 84 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0581987  normal  0.43186 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2253  PAAR repeat-containing protein  38.78 
 
 		 105 aa  50.8  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175584  hitchhiker  0.000480373 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0699  PAAR repeat-containing protein  39.13 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6138  PAAR repeat-containing protein  34.02 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617294 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05511  paar motif family  49.02 
 
 		 86 aa  43.9  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0211513  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  36.23 
 
 		 1541 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  36.23 
 
 		 1381 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2190  PAAR  37.93 
 
 		 88 aa  42.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  36.23 
 
 		 1541 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  36.23 
 
 		 1541 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  36.23 
 
 		 1541 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  36.23 
 
 		 1541 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0051  YD repeat protein  37.5 
 
 		 1437 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  36.23 
 
 		 1541 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  34.92 
 
 		 1517 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0985  hypothetical protein  41.67 
 
 		 98 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0761318  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1039  PAAR  50 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0895  hypothetical protein  50 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.457574 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0685  PAAR  36.26 
 
 		 379 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2255  hypothetical protein  36.11 
 
 		 89 aa  40.8  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  33.33 
 
 		 1422 aa  40  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>