40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4775 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4775  PAAR repeat-containing protein  100 
 
 		 105 aa  213  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000030  hypothetical protein  38.83 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2461  hypothetical protein  40.74 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2358  PAAR repeat-containing protein  39.81 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1081  hypothetical protein  39.25 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.738335 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4114  PAAR repeat-containing protein  40 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.916002  hitchhiker  0.00152888 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3002  PAAR  38.89 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1664  PAAR repeat-containing protein  39.45 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121011 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6243  hypothetical protein  40.95 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.574956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0675  PAAR repeat-containing protein  38.89 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  43.75 
 
 		 1379 aa  50.4  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2816  PAAR repeat-containing protein  38.53 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3928  PAAR repeat-containing protein  38.83 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00719724  normal  0.0225395 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5249  PAAR repeat-containing protein  38.53 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000530651 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1168  putative type VI secretion protein VasV-1, PAAR domain protein  38.3 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173375  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1867  hypothetical protein  37.89 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  41.67 
 
 		 1446 aa  47.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  34.95 
 
 		 1421 aa  47  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0335  phosphomethylpyrimidine kinase  42.5 
 
 		 466 aa  44.7  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3017  PAAR repeat-containing protein  37.8 
 
 		 444 aa  44.3  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.501568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1762  S-type Pyocin domain protein  42.68 
 
 		 592 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.842268  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3156  PAAR repeat-containing protein  40.28 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1487  hypothetical protein  42.86 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2512  PAAR repeat-containing protein  40.71 
 
 		 461 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1375  hypothetical protein  42.86 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3257  phospholipase  41.12 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1933  hypothetical protein  42.86 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.437676  normal  0.622076 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  39.51 
 
 		 1409 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  35.8 
 
 		 1423 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3584  PAAR repeat-containing protein  40.91 
 
 		 84 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1578  Rhs family protein  34.67 
 
 		 1556 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.883586  normal  0.184607 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  34.57 
 
 		 1475 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3079  YD repeat-containing protein  53.85 
 
 		 1505 aa  40.8  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  34.57 
 
 		 1457 aa  40.8  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  33.65 
 
 		 1419 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0647  RHS Repeat family protein  53.85 
 
 		 1616 aa  40.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1157  PAAR repeat-containing protein  39.25 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.811725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0368  PAAR repeat-containing protein  34.51 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0985  hypothetical protein  33.33 
 
 		 98 aa  40  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0761318  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  38.27 
 
 		 855 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>