66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2816 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2816  PAAR repeat-containing protein  100 
 
 		 96 aa  180  6e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1664  PAAR repeat-containing protein  96.88 
 
 		 96 aa  174  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121011 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4114  PAAR repeat-containing protein  72.92 
 
 		 96 aa  131  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.916002  hitchhiker  0.00152888 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5249  PAAR repeat-containing protein  72.92 
 
 		 96 aa  130  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000530651 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3156  PAAR repeat-containing protein  69.89 
 
 		 96 aa  122  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2461  hypothetical protein  69.7 
 
 		 99 aa  122  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3928  PAAR repeat-containing protein  70.1 
 
 		 100 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00719724  normal  0.0225395 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2373  PAAR repeat-containing protein  66.67 
 
 		 96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0352022 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0368  PAAR repeat-containing protein  66 
 
 		 100 aa  115  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0675  PAAR repeat-containing protein  65.66 
 
 		 99 aa  113  7.999999999999999e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3002  PAAR  63.64 
 
 		 99 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1168  putative type VI secretion protein VasV-1, PAAR domain protein  63.64 
 
 		 98 aa  109  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173375  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3584  PAAR repeat-containing protein  68.83 
 
 		 84 aa  98.6  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2358  PAAR repeat-containing protein  61.7 
 
 		 96 aa  92.4  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000030  hypothetical protein  54.26 
 
 		 96 aa  89.7  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1081  hypothetical protein  54.9 
 
 		 102 aa  85.5  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.738335 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2253  PAAR repeat-containing protein  56.44 
 
 		 105 aa  84.3  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175584  hitchhiker  0.000480373 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0699  PAAR repeat-containing protein  56.38 
 
 		 113 aa  84  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3826  PAAR repeat-containing protein  54.32 
 
 		 99 aa  79.3  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1680  PAAR repeat-containing protein  54.65 
 
 		 89 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2551  PAAR repeat-containing protein  55.81 
 
 		 89 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5383  PAAR repeat-containing protein  51.46 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1907  PAAR repeat-containing protein  52.43 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0142709  hitchhiker  0.000734481 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3608  PAAR  47.06 
 
 		 92 aa  62.8  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000736395 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4551  PAAR repeat-containing protein  46.32 
 
 		 185 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1650  hypothetical protein  38.82 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1043  hypothetical protein  48.04 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53640  hypothetical protein  45.16 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0232155  hitchhiker  0.000303708 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0985  hypothetical protein  54.41 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0761318  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1039  PAAR  43.43 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0895  hypothetical protein  43.43 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.457574 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  43.48 
 
 		 1379 aa  51.2  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1578  Rhs family protein  50 
 
 		 1556 aa  50.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.883586  normal  0.184607 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1867  hypothetical protein  35.37 
 
 		 107 aa  50.1  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0240  PAAR repeat-containing protein  40.86 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4775  PAAR repeat-containing protein  38.53 
 
 		 105 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110358  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4633  hypothetical protein  37.63 
 
 		 177 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.53967  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3019  hypothetical protein  38.64 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.746993 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  43.28 
 
 		 1229 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3775  helix-turn-helix, AraC type  40.43 
 
 		 540 aa  47.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0335  phosphomethylpyrimidine kinase  40.86 
 
 		 466 aa  47.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5592  PAAR  39.78 
 
 		 469 aa  47  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  42.03 
 
 		 855 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2946  PAAR repeat-containing protein  41.41 
 
 		 103 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2610  hypothetical protein  34.09 
 
 		 85 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408788  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6243  hypothetical protein  39.05 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.574956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3189  PAAR  38.95 
 
 		 179 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000563624  normal  0.0101045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3238  PAAR repeat-containing protein  32.95 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.198697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3817  PAAR  36.84 
 
 		 181 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153298  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3806  PAAR  40 
 
 		 165 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159045 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3115  PAAR repeat-containing protein  32.95 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3426  hypothetical protein  38.37 
 
 		 386 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.967185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1762  S-type Pyocin domain protein  38.89 
 
 		 592 aa  43.5  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.842268  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  35.79 
 
 		 1422 aa  42.7  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  40.79 
 
 		 1386 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2854  hypothetical protein  35.23 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.561027  normal  0.0963885 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0585  YD repeat-containing protein  50 
 
 		 1600 aa  42  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  41.56 
 
 		 1140 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2758  PAAR repeat-containing protein  41.1 
 
 		 406 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.011226  normal  0.594441 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0925  PAAR repeat-containing protein  52.24 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0685  PAAR  34.78 
 
 		 379 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  35.96 
 
 		 1421 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3017  PAAR repeat-containing protein  38.37 
 
 		 444 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.501568  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5430  hypothetical protein  38.3 
 
 		 174 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  38.16 
 
 		 1604 aa  40.4  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0768  hypothetical protein  43.94 
 
 		 96 aa  40  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>