47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1867 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1867  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  218  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0985  hypothetical protein  63.22 
 
 		 98 aa  101  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0761318  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0768  hypothetical protein  60.47 
 
 		 96 aa  82  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2512  PAAR repeat-containing protein  43.18 
 
 		 461 aa  56.6  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1762  S-type Pyocin domain protein  44.32 
 
 		 592 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.842268  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  38.55 
 
 		 1422 aa  52  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3257  phospholipase  40.91 
 
 		 101 aa  51.2  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1043  hypothetical protein  41.05 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  37.35 
 
 		 1475 aa  50.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  37.35 
 
 		 1457 aa  50.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2694  YD repeat protein  37.35 
 
 		 1428 aa  50.8  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00194911  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3237  PAAR repeat-containing protein  43.33 
 
 		 456 aa  50.8  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2816  PAAR repeat-containing protein  35.37 
 
 		 96 aa  50.1  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4114  PAAR repeat-containing protein  51.02 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.916002  hitchhiker  0.00152888 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2824  PAAR repeat-containing protein  42.05 
 
 		 456 aa  49.7  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2358  PAAR repeat-containing protein  49.02 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3608  PAAR  42.11 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000736395 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4775  PAAR repeat-containing protein  37.89 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0335  phosphomethylpyrimidine kinase  38.95 
 
 		 466 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1157  PAAR repeat-containing protein  40.62 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.811725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  45.59 
 
 		 1229 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  43.08 
 
 		 1423 aa  47.4  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000030  hypothetical protein  48 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5249  PAAR repeat-containing protein  36.59 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000530651 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  47.54 
 
 		 855 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3775  helix-turn-helix, AraC type  42.05 
 
 		 540 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1609  YD repeat protein  34.57 
 
 		 1447 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3156  PAAR repeat-containing protein  51.85 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2373  PAAR repeat-containing protein  44.09 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0352022 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0799  hypothetical protein  46.94 
 
 		 165 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.369925 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  42.65 
 
 		 1410 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0051  YD repeat protein  33.73 
 
 		 1437 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2758  PAAR repeat-containing protein  44.83 
 
 		 406 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.011226  normal  0.594441 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0699  PAAR repeat-containing protein  40.96 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3017  PAAR repeat-containing protein  46.77 
 
 		 444 aa  42.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.501568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1664  PAAR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121011 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  43.64 
 
 		 1583 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  43.86 
 
 		 1604 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1039  PAAR  40 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0895  hypothetical protein  40 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.457574 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  43.33 
 
 		 1140 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0483  PAAR repeat-containing protein  42.11 
 
 		 597 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1832  hypothetical protein  41.03 
 
 		 118 aa  41.2  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.643007 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2946  PAAR repeat-containing protein  34.52 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3426  hypothetical protein  42.62 
 
 		 386 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.967185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3002  PAAR  40 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1680  PAAR repeat-containing protein  35 
 
 		 89 aa  40.4  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>