44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0985 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0985  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  190  6e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0761318  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1867  hypothetical protein  63.22 
 
 		 107 aa  101  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0768  hypothetical protein  60.82 
 
 		 96 aa  95.1  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2358  PAAR repeat-containing protein  55.88 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1043  hypothetical protein  51.02 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4114  PAAR repeat-containing protein  56.52 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.916002  hitchhiker  0.00152888 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3608  PAAR  50 
 
 		 92 aa  62  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000736395 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0799  hypothetical protein  57.81 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.369925 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000030  hypothetical protein  54.41 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0675  PAAR repeat-containing protein  52.11 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1907  PAAR repeat-containing protein  50 
 
 		 93 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0142709  hitchhiker  0.000734481 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5249  PAAR repeat-containing protein  50.47 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000530651 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3928  PAAR repeat-containing protein  54.17 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00719724  normal  0.0225395 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3156  PAAR repeat-containing protein  54.29 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1664  PAAR repeat-containing protein  55.88 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121011 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0368  PAAR repeat-containing protein  49.3 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3002  PAAR  48.57 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2816  PAAR repeat-containing protein  54.41 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0699  PAAR repeat-containing protein  47.47 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1168  putative type VI secretion protein VasV-1, PAAR domain protein  48.57 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173375  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2253  PAAR repeat-containing protein  40.95 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175584  hitchhiker  0.000480373 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1081  hypothetical protein  49.35 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.738335 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2461  hypothetical protein  47.89 
 
 		 99 aa  53.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5383  PAAR repeat-containing protein  46.94 
 
 		 93 aa  51.6  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0335  phosphomethylpyrimidine kinase  39.39 
 
 		 466 aa  48.9  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2373  PAAR repeat-containing protein  46.81 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0352022 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2512  PAAR repeat-containing protein  42.86 
 
 		 461 aa  47.4  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1157  PAAR repeat-containing protein  38.83 
 
 		 100 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.811725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3584  PAAR repeat-containing protein  48.72 
 
 		 84 aa  47.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0943  hypothetical protein  36.56 
 
 		 87 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00127142  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1878  hypothetical protein  36.56 
 
 		 87 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0199793  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3827  PAAR repeat-containing protein  36.56 
 
 		 87 aa  45.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0240  PAAR repeat-containing protein  39.58 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2824  PAAR repeat-containing protein  42.86 
 
 		 456 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3237  PAAR repeat-containing protein  43.4 
 
 		 456 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2946  PAAR repeat-containing protein  37.93 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1762  S-type Pyocin domain protein  41.86 
 
 		 592 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.842268  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3775  helix-turn-helix, AraC type  36.89 
 
 		 540 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2551  PAAR repeat-containing protein  39.58 
 
 		 89 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3826  PAAR repeat-containing protein  41.67 
 
 		 99 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1680  PAAR repeat-containing protein  40.62 
 
 		 89 aa  41.2  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3257  phospholipase  41.18 
 
 		 101 aa  40.8  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4775  PAAR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 105 aa  40  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1578  Rhs family protein  38.71 
 
 		 1556 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.883586  normal  0.184607 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>