50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0768 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0768  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  190  5e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0985  hypothetical protein  62.89 
 
 		 98 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0761318  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1867  hypothetical protein  60.47 
 
 		 107 aa  98.2  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4114  PAAR repeat-containing protein  54.55 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.916002  hitchhiker  0.00152888 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0799  hypothetical protein  56.67 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.369925 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3156  PAAR repeat-containing protein  56.06 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1168  putative type VI secretion protein VasV-1, PAAR domain protein  52.17 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173375  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5249  PAAR repeat-containing protein  53.03 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000530651 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2358  PAAR repeat-containing protein  54.84 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2816  PAAR repeat-containing protein  51.52 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000030  hypothetical protein  49.18 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0675  PAAR repeat-containing protein  53.62 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3928  PAAR repeat-containing protein  50.72 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00719724  normal  0.0225395 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1664  PAAR repeat-containing protein  48.48 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121011 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0368  PAAR repeat-containing protein  49.3 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2373  PAAR repeat-containing protein  48.48 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0352022 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3002  PAAR  45.71 
 
 		 99 aa  53.5  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  40.91 
 
 		 1229 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5383  PAAR repeat-containing protein  41.05 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2461  hypothetical protein  46.38 
 
 		 99 aa  51.2  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1043  hypothetical protein  43.59 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0699  PAAR repeat-containing protein  41.24 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  41.33 
 
 		 855 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3608  PAAR  37.89 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000736395 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0335  phosphomethylpyrimidine kinase  40.59 
 
 		 466 aa  48.5  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1375  hypothetical protein  40.21 
 
 		 86 aa  47.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1933  hypothetical protein  40.21 
 
 		 86 aa  47.4  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.437676  normal  0.622076 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1487  hypothetical protein  40.21 
 
 		 86 aa  47.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  38.71 
 
 		 1379 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  38.67 
 
 		 1400 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  38.67 
 
 		 1385 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3584  PAAR repeat-containing protein  44.05 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1907  PAAR repeat-containing protein  41.05 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0142709  hitchhiker  0.000734481 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3017  PAAR repeat-containing protein  40.24 
 
 		 444 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.501568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3775  helix-turn-helix, AraC type  40 
 
 		 540 aa  45.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2758  PAAR repeat-containing protein  39.47 
 
 		 406 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.011226  normal  0.594441 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1081  hypothetical protein  43.06 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.738335 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  36 
 
 		 1409 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  39.71 
 
 		 1422 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1157  PAAR repeat-containing protein  38.46 
 
 		 100 aa  42  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.811725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  37.04 
 
 		 1446 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  36.46 
 
 		 1140 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0240  PAAR repeat-containing protein  36.73 
 
 		 113 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  33.73 
 
 		 1359 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0093  hypothetical protein  39.6 
 
 		 481 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3426  hypothetical protein  39.24 
 
 		 386 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.967185  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5430  hypothetical protein  40 
 
 		 174 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1832  hypothetical protein  41.89 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.643007 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0925  PAAR repeat-containing protein  37.33 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4775  PAAR repeat-containing protein  36.73 
 
 		 105 aa  40.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110358  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>