83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1907 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1907  PAAR repeat-containing protein  100 
 
 		 93 aa  166  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0142709  hitchhiker  0.000734481 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5383  PAAR repeat-containing protein  75.27 
 
 		 93 aa  112  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0925  PAAR repeat-containing protein  70.21 
 
 		 94 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1043  hypothetical protein  58.7 
 
 		 92 aa  91.7  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3608  PAAR  55.43 
 
 		 92 aa  88.2  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000736395 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5249  PAAR repeat-containing protein  50.49 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000530651 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2946  PAAR repeat-containing protein  48.31 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1664  PAAR repeat-containing protein  51.46 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121011 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2461  hypothetical protein  50.94 
 
 		 99 aa  68.2  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3928  PAAR repeat-containing protein  62.16 
 
 		 100 aa  66.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00719724  normal  0.0225395 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2816  PAAR repeat-containing protein  52.43 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1081  hypothetical protein  56.16 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.738335 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3156  PAAR repeat-containing protein  49 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4114  PAAR repeat-containing protein  48.54 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.916002  hitchhiker  0.00152888 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0675  PAAR repeat-containing protein  51.4 
 
 		 99 aa  62  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3827  PAAR repeat-containing protein  41.11 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0943  hypothetical protein  41.11 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00127142  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1878  hypothetical protein  41.11 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0199793  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3002  PAAR  45.79 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0985  hypothetical protein  50 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0761318  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3775  helix-turn-helix, AraC type  42.42 
 
 		 540 aa  58.2  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3584  PAAR repeat-containing protein  52.7 
 
 		 84 aa  57  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1168  putative type VI secretion protein VasV-1, PAAR domain protein  52.86 
 
 		 98 aa  57  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173375  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0130  Rhs family protein  45.05 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904339  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0144  PAAR motif-containing protein  45.05 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.352766  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3018  PAAR repeat-containing protein  40.22 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.820198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0167  Rhs family protein  45.05 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.688933  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0335  phosphomethylpyrimidine kinase  41.84 
 
 		 466 aa  55.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1614  Rhs family protein  45.05 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6683  PAAR repeat-containing protein  40.22 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0368  PAAR repeat-containing protein  47.66 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  43.06 
 
 		 1229 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1578  Rhs family protein  39.29 
 
 		 1556 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.883586  normal  0.184607 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2358  PAAR repeat-containing protein  47.22 
 
 		 96 aa  52.8  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2373  PAAR repeat-containing protein  43.69 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0352022 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0699  PAAR repeat-containing protein  44.68 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  41.89 
 
 		 855 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0240  PAAR repeat-containing protein  41.05 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3017  PAAR repeat-containing protein  40.54 
 
 		 444 aa  51.2  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.501568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  40.91 
 
 		 1386 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000030  hypothetical protein  45.21 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  42.47 
 
 		 1379 aa  50.4  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0768  hypothetical protein  41.05 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3426  hypothetical protein  40.79 
 
 		 386 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.967185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3806  PAAR  47.06 
 
 		 165 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159045 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53640  hypothetical protein  44.12 
 
 		 172 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0232155  hitchhiker  0.000303708 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0093  hypothetical protein  46.38 
 
 		 481 aa  47  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1680  PAAR repeat-containing protein  47 
 
 		 89 aa  47  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2551  PAAR repeat-containing protein  47 
 
 		 89 aa  47  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1375  hypothetical protein  38.04 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1762  S-type Pyocin domain protein  39.6 
 
 		 592 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.842268  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1933  hypothetical protein  38.04 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.437676  normal  0.622076 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1487  hypothetical protein  38.04 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2758  PAAR repeat-containing protein  40 
 
 		 406 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.011226  normal  0.594441 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4128  PAAR  45.59 
 
 		 164 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1157  PAAR repeat-containing protein  39.39 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.811725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2512  PAAR repeat-containing protein  39.6 
 
 		 461 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2253  PAAR repeat-containing protein  43.81 
 
 		 105 aa  45.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175584  hitchhiker  0.000480373 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  40.28 
 
 		 1140 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  32.61 
 
 		 1422 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  46.67 
 
 		 1411 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  35.96 
 
 		 1381 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1039  PAAR  40 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0895  hypothetical protein  40 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.457574 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5430  hypothetical protein  45.59 
 
 		 174 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5592  PAAR  37.89 
 
 		 469 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  51.28 
 
 		 1419 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  35.96 
 
 		 1541 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  32.22 
 
 		 1421 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  35.96 
 
 		 1541 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  35.96 
 
 		 1541 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  35.96 
 
 		 1541 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  35.96 
 
 		 1541 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  35.96 
 
 		 1541 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05511  paar motif family  36.05 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0211513  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2824  PAAR repeat-containing protein  39.6 
 
 		 456 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0483  PAAR repeat-containing protein  34.94 
 
 		 597 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0479  hypothetical protein  36.47 
 
 		 188 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000400722  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01943  hypothetical protein  38.55 
 
 		 89 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.309937 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3237  PAAR repeat-containing protein  38.61 
 
 		 456 aa  41.2  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  31.51 
 
 		 1446 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0051  YD repeat protein  43.18 
 
 		 1437 aa  40.4  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2190  PAAR  36.36 
 
 		 88 aa  40  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>