100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2824 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2824  PAAR repeat-containing protein  100 
 
 
456 aa  918    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3237  PAAR repeat-containing protein  77.14 
 
 
456 aa  720    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2512  PAAR repeat-containing protein  60.53 
 
 
461 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1762  S-type Pyocin domain protein  74.22 
 
 
592 aa  206  9e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.842268  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2437  hypothetical protein  28.12 
 
 
430 aa  100  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3257  phospholipase  57.84 
 
 
101 aa  99.4  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3775  helix-turn-helix, AraC type  51.96 
 
 
540 aa  97.4  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1157  PAAR repeat-containing protein  55 
 
 
100 aa  93.2  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.811725  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0335  phosphomethylpyrimidine kinase  51.58 
 
 
466 aa  91.3  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3606  PAAR repeat-containing protein  58.06 
 
 
96 aa  88.6  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4079  hypothetical protein  28.04 
 
 
368 aa  86.3  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2662  PAAR repeat-containing protein  51.89 
 
 
323 aa  84  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1213  hypothetical protein  28.3 
 
 
368 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1293  PAAR  45.45 
 
 
96 aa  77.4  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.455231 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3037  hypothetical protein  27.6 
 
 
368 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0034  hypothetical protein  54.65 
 
 
94 aa  73.6  0.000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.543283  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4258  PAAR repeat-containing protein  45.92 
 
 
169 aa  72  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2184  PAAR repeat-containing protein  48.24 
 
 
88 aa  71.2  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.062242  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3448  PAAR repeat-containing protein  51.85 
 
 
88 aa  70.1  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.86089  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0945  hypothetical protein  44.34 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00120455  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1123  lipase family protein  32.87 
 
 
320 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.81089  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7559  phospholipase A1  41.96 
 
 
460 aa  68.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3597  phospholipase A  43.86 
 
 
320 aa  68.2  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2560  PAAR repeat-containing protein  40.57 
 
 
174 aa  67.8  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.801514  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1175  phospholipase A(1)  43.86 
 
 
320 aa  68.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2373  hypothetical protein  45.78 
 
 
94 aa  67.4  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0532  PAAR repeat-containing protein  51.52 
 
 
88 aa  63.9  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5592  PAAR  36.81 
 
 
469 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  41.03 
 
 
1446 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3681  phospholipase A(1)  32.29 
 
 
320 aa  57.8  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0179206  normal  0.113724 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0059  PAAR repeat-containing protein  39.33 
 
 
99 aa  57.4  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1043  hypothetical protein  45.45 
 
 
92 aa  56.6  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2758  PAAR repeat-containing protein  41.67 
 
 
406 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.011226  normal  0.594441 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2358  PAAR repeat-containing protein  43.04 
 
 
96 aa  55.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2303  hypothetical protein  30.36 
 
 
432 aa  55.5  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6683  PAAR repeat-containing protein  41.84 
 
 
88 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3608  PAAR  43.56 
 
 
92 aa  55.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000736395 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2694  YD repeat protein  29.03 
 
 
1428 aa  53.9  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00194911  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3018  PAAR repeat-containing protein  41.84 
 
 
88 aa  53.9  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.820198  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000030  hypothetical protein  44.3 
 
 
96 aa  53.9  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  36.84 
 
 
855 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1609  YD repeat protein  32.41 
 
 
1447 aa  53.5  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1832  hypothetical protein  41.46 
 
 
118 aa  53.5  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.643007 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5430  hypothetical protein  42.86 
 
 
174 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4551  PAAR repeat-containing protein  40.18 
 
 
185 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53640  hypothetical protein  37.88 
 
 
172 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0232155  hitchhiker  0.000303708 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  32.43 
 
 
1475 aa  52.4  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3426  hypothetical protein  39.74 
 
 
386 aa  52.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.967185  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  38.16 
 
 
1421 aa  52.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  32.43 
 
 
1457 aa  52.4  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  41.89 
 
 
1386 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  33.63 
 
 
1422 aa  52.4  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  35.63 
 
 
1385 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0093  hypothetical protein  44 
 
 
481 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  35.63 
 
 
1400 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3827  PAAR repeat-containing protein  42.27 
 
 
87 aa  50.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86819  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1878  hypothetical protein  42.27 
 
 
87 aa  50.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0199793  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0943  hypothetical protein  42.27 
 
 
87 aa  50.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00127142  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0685  PAAR  37.04 
 
 
379 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  33.68 
 
 
1229 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0167  PAAR motif-containing protein  40.51 
 
 
434 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3121  hypothetical protein  30.91 
 
 
351 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.496795  normal  0.881933 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1867  hypothetical protein  42.05 
 
 
107 aa  49.7  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2301  PAAR repeat-containing protein  41.94 
 
 
87 aa  48.5  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360683  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  41.33 
 
 
1583 aa  48.9  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0051  YD repeat protein  33.9 
 
 
1437 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3189  PAAR  43.52 
 
 
179 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000563624  normal  0.0101045 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  35.44 
 
 
1423 aa  47.8  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  41.33 
 
 
1604 aa  47.8  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  34.48 
 
 
1409 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0240  PAAR repeat-containing protein  33.93 
 
 
113 aa  47.4  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2344  hypothetical protein  37.08 
 
 
352 aa  47.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163785  normal  0.669867 
 
 
-
 
NC_002978  WD0641  hypothetical protein  36.56 
 
 
84 aa  47.4  0.0006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.73895  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  40 
 
 
1379 aa  47  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3806  PAAR  39.81 
 
 
165 aa  47  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.159045 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  34.74 
 
 
1140 aa  47  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3756  hypothetical protein  36.11 
 
 
386 aa  47  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.136459  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0281  hypothetical protein  32.22 
 
 
84 aa  47  0.0007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  34.55 
 
 
1527 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05511  paar motif family  38.46 
 
 
86 aa  45.8  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0211513  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01140  hypothetical protein  39.24 
 
 
439 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.337487  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0699  PAAR repeat-containing protein  38.78 
 
 
113 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0483  PAAR repeat-containing protein  40 
 
 
597 aa  46.6  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1081  hypothetical protein  39.64 
 
 
102 aa  45.4  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.738335 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3817  PAAR  43.14 
 
 
181 aa  45.8  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153298  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3156  PAAR repeat-containing protein  41.33 
 
 
96 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  29.9 
 
 
1359 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3017  PAAR repeat-containing protein  35.8 
 
 
444 aa  44.7  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.501568  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13390  hypothetical protein  35.71 
 
 
131 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.694836  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4114  PAAR repeat-containing protein  38.32 
 
 
96 aa  43.9  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.916002  hitchhiker  0.00152888 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  32.98 
 
 
1419 aa  43.5  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4969  PAAR  35.44 
 
 
102 aa  43.5  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1375  hypothetical protein  35 
 
 
86 aa  43.5  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  36.67 
 
 
1410 aa  43.5  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1933  hypothetical protein  35 
 
 
86 aa  43.5  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.437676  normal  0.622076 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1487  hypothetical protein  35 
 
 
86 aa  43.5  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  34.74 
 
 
1411 aa  43.5  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0985  hypothetical protein  42.86 
 
 
98 aa  43.5  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0761318  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5383  PAAR repeat-containing protein  40.4 
 
 
93 aa  43.1  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  27.87 
 
 
1383 aa  43.1  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>