69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1614 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A0144  PAAR motif-containing protein  100 
 
 		 91 aa  167  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.352766  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1614  Rhs family protein  100 
 
 		 89 aa  167  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0167  Rhs family protein  100 
 
 		 91 aa  167  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.688933  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0130  Rhs family protein  100 
 
 		 89 aa  167  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904339  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6683  PAAR repeat-containing protein  73.86 
 
 		 88 aa  114  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3018  PAAR repeat-containing protein  70.45 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.820198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  43.18 
 
 		 1229 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1487  hypothetical protein  49.41 
 
 		 86 aa  66.2  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1933  hypothetical protein  49.41 
 
 		 86 aa  66.2  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.437676  normal  0.622076 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1375  hypothetical protein  49.41 
 
 		 86 aa  66.2  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  43.18 
 
 		 855 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1907  PAAR repeat-containing protein  45.05 
 
 		 93 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0142709  hitchhiker  0.000734481 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3426  hypothetical protein  47.3 
 
 		 386 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.967185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  35.71 
 
 		 1379 aa  57.4  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  38.96 
 
 		 1446 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2758  PAAR repeat-containing protein  43.24 
 
 		 406 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.011226  normal  0.594441 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  37.65 
 
 		 1385 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  37.65 
 
 		 1400 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  44.78 
 
 		 1386 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  35.29 
 
 		 1423 aa  54.3  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  36.47 
 
 		 1409 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0943  hypothetical protein  38.55 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00127142  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1878  hypothetical protein  38.55 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0199793  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  36.49 
 
 		 1475 aa  53.9  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3827  PAAR repeat-containing protein  38.55 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  36.49 
 
 		 1457 aa  53.9  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  37.8 
 
 		 1410 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  37.36 
 
 		 1421 aa  52.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  36.47 
 
 		 1422 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3017  PAAR repeat-containing protein  43.24 
 
 		 444 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.501568  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  40 
 
 		 1140 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  39.24 
 
 		 1419 aa  51.2  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1043  hypothetical protein  43.33 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1609  YD repeat protein  35.29 
 
 		 1447 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  34.48 
 
 		 1359 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2512  PAAR repeat-containing protein  39 
 
 		 461 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0335  phosphomethylpyrimidine kinase  37.08 
 
 		 466 aa  48.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05511  paar motif family  35 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0211513  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5383  PAAR repeat-containing protein  41.76 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2824  PAAR repeat-containing protein  40 
 
 		 456 aa  47.4  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5592  PAAR  40.22 
 
 		 469 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0483  PAAR repeat-containing protein  41.33 
 
 		 597 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3237  PAAR repeat-containing protein  39 
 
 		 456 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2694  YD repeat protein  37.68 
 
 		 1428 aa  46.2  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00194911  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1081  hypothetical protein  39.19 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.738335 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0051  YD repeat protein  35.14 
 
 		 1437 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0768  hypothetical protein  40.86 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  41.33 
 
 		 1583 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0479  hypothetical protein  31.25 
 
 		 188 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000400722  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0316  hypothetical protein  39.47 
 
 		 453 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5509  hypothetical protein  43.42 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  38.36 
 
 		 1495 aa  43.5  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1762  S-type Pyocin domain protein  38.14 
 
 		 592 aa  43.5  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.842268  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  38.81 
 
 		 1411 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3079  YD repeat-containing protein  44.9 
 
 		 1505 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0585  YD repeat-containing protein  44.9 
 
 		 1600 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  38.46 
 
 		 1604 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0647  RHS Repeat family protein  44.9 
 
 		 1616 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44930  hypothetical protein  32.47 
 
 		 86 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00624733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3608  PAAR  45.05 
 
 		 92 aa  41.6  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000736395 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3775  helix-turn-helix, AraC type  35.16 
 
 		 540 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  36.99 
 
 		 1487 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000030  hypothetical protein  43.24 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  36.99 
 
 		 1494 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  36.99 
 
 		 1494 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2358  PAAR repeat-containing protein  39.19 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53640  hypothetical protein  38.04 
 
 		 172 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0232155  hitchhiker  0.000303708 
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  33.33 
 
 		 1517 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2560  PAAR repeat-containing protein  35.63 
 
 		 174 aa  40.4  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.801514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>