94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_53640 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_53640  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  344  3e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0232155  hitchhiker  0.000303708 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3806  PAAR  52.98 
 
 
165 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.159045 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5430  hypothetical protein  52.5 
 
 
174 aa  154  8e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3189  PAAR  54.19 
 
 
179 aa  147  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000563624  normal  0.0101045 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4633  hypothetical protein  55.97 
 
 
177 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.53967  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5592  PAAR  71.13 
 
 
469 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0093  hypothetical protein  63.81 
 
 
481 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13390  hypothetical protein  64.95 
 
 
131 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.694836  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3817  PAAR  68.18 
 
 
181 aa  124  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153298  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4128  PAAR  50 
 
 
164 aa  115  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4551  PAAR repeat-containing protein  52.34 
 
 
185 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3756  hypothetical protein  46.81 
 
 
386 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.136459  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0685  PAAR  46.34 
 
 
379 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4258  PAAR repeat-containing protein  36.05 
 
 
169 aa  65.9  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2662  PAAR repeat-containing protein  51.22 
 
 
323 aa  65.5  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000030  hypothetical protein  47.37 
 
 
96 aa  63.5  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0119  hypothetical protein  33.13 
 
 
175 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.435332  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0644  bacteriophage GP29 protein  32.32 
 
 
173 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2358  PAAR repeat-containing protein  47.37 
 
 
96 aa  61.2  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3827  PAAR repeat-containing protein  47.46 
 
 
87 aa  60.8  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86819  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0943  hypothetical protein  47.46 
 
 
87 aa  60.8  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00127142  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1878  hypothetical protein  47.46 
 
 
87 aa  60.8  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0199793  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3671  hypothetical protein  31.06 
 
 
176 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2000  hypothetical protein  33.54 
 
 
175 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0577978  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1358  hypothetical protein  30.86 
 
 
177 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1762  S-type Pyocin domain protein  46.91 
 
 
592 aa  58.2  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.842268  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2301  PAAR repeat-containing protein  49.09 
 
 
87 aa  57.4  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360683  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0699  PAAR repeat-containing protein  42.86 
 
 
113 aa  57  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3156  PAAR repeat-containing protein  46.32 
 
 
96 aa  57.4  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2512  PAAR repeat-containing protein  44.86 
 
 
461 aa  56.6  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3775  helix-turn-helix, AraC type  43.96 
 
 
540 aa  56.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4114  PAAR repeat-containing protein  47.31 
 
 
96 aa  56.6  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.916002  hitchhiker  0.00152888 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0213  bacteriophage GP29 protein  29.27 
 
 
178 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3928  PAAR repeat-containing protein  44.9 
 
 
100 aa  55.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00719724  normal  0.0225395 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2816  PAAR repeat-containing protein  45.16 
 
 
96 aa  55.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5509  hypothetical protein  42.11 
 
 
87 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04484  hypothetical protein  42.03 
 
 
149 aa  55.1  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2190  PAAR  49.15 
 
 
88 aa  54.3  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3002  PAAR  42.71 
 
 
99 aa  54.3  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4801  hypothetical protein  46.15 
 
 
88 aa  53.9  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0636786  normal  0.750355 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2461  hypothetical protein  41.67 
 
 
99 aa  53.9  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01943  hypothetical protein  48.28 
 
 
89 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.309937 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1081  hypothetical protein  45 
 
 
102 aa  53.9  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.738335 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2824  PAAR repeat-containing protein  37.88 
 
 
456 aa  52.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3237  PAAR repeat-containing protein  40.91 
 
 
456 aa  53.1  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05511  paar motif family  44.07 
 
 
86 aa  52  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0211513  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0675  PAAR repeat-containing protein  44.79 
 
 
99 aa  51.6  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0945  hypothetical protein  46.99 
 
 
176 aa  51.2  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00120455  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2373  PAAR repeat-containing protein  41.94 
 
 
96 aa  51.2  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0352022 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0056  PAAR repeat-containing protein  42.62 
 
 
88 aa  51.2  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1664  PAAR repeat-containing protein  43.01 
 
 
96 aa  50.8  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.121011 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1168  putative type VI secretion protein VasV-1, PAAR domain protein  40.62 
 
 
98 aa  50.8  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173375  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0368  PAAR repeat-containing protein  41 
 
 
100 aa  48.5  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2255  hypothetical protein  44.64 
 
 
89 aa  48.9  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0335  phosphomethylpyrimidine kinase  40.22 
 
 
466 aa  48.5  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0316  hypothetical protein  39.68 
 
 
453 aa  48.1  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5249  PAAR repeat-containing protein  41.49 
 
 
96 aa  47.8  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000530651 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3584  PAAR repeat-containing protein  44.44 
 
 
84 aa  47.4  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1907  PAAR repeat-containing protein  44.12 
 
 
93 aa  47.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0142709  hitchhiker  0.000734481 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2551  PAAR repeat-containing protein  43.18 
 
 
89 aa  46.6  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1680  PAAR repeat-containing protein  42.05 
 
 
89 aa  46.6  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1375  PAAR motif-containing protein  40.68 
 
 
88 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.573546  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1577  PAAR motif-containing protein  40.68 
 
 
88 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.18435  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2706  PAAR motif-containing protein  40.68 
 
 
88 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61171  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3606  PAAR repeat-containing protein  44.74 
 
 
96 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0500  hypothetical protein  40.68 
 
 
88 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.714041  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1603  PAAR motif-containing protein  40.68 
 
 
88 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0657  PAAR motif-containing protein  40.68 
 
 
88 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1765  PAAR motif-containing protein  40.68 
 
 
88 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.847105  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0961  hypothetical protein  34.48 
 
 
88 aa  45.4  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2560  PAAR repeat-containing protein  29.94 
 
 
174 aa  44.7  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.801514  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4969  PAAR  38.33 
 
 
102 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0203  PAAR motif-containing protein  37.04 
 
 
87 aa  44.7  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00559285  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1693  PAAR motif-containing protein  37.04 
 
 
87 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3252  PAAR repeat-containing protein  39.62 
 
 
86 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.447164  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0130  PAAR motif-containing protein  37.04 
 
 
87 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0103  PAAR motif-containing protein  37.04 
 
 
87 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1612  PAAR motif-containing protein  37.04 
 
 
87 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0479  hypothetical protein  25.58 
 
 
188 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000400722  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1832  hypothetical protein  44.12 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.643007 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1586  PAAR motif-containing protein  37.04 
 
 
87 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.160727  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3217  hypothetical protein  39.62 
 
 
90 aa  42.4  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0242808 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3019  hypothetical protein  32.5 
 
 
84 aa  42.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.746993 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0098  PAAR motif-containing protein  37.04 
 
 
87 aa  41.6  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.314734  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0092  PAAR motif-containing protein  37.04 
 
 
87 aa  41.2  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7616  hypothetical protein  35.59 
 
 
86 aa  41.6  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3228  PAAR motif-containing protein  37.04 
 
 
87 aa  41.2  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3238  PAAR repeat-containing protein  32.56 
 
 
85 aa  41.6  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.198697  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3115  PAAR repeat-containing protein  32.56 
 
 
85 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1513  PAAR repeat-containing protein  35.38 
 
 
94 aa  41.2  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.806121 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2854  hypothetical protein  31.76 
 
 
85 aa  40.8  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.561027  normal  0.0963885 
 
 
-
 
NC_003296  RS05224  hypothetical protein  32.76 
 
 
88 aa  41.2  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0211  PAAR repeat-containing protein  32.31 
 
 
93 aa  40.8  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5205  PAAR repeat-containing protein  37.04 
 
 
85 aa  40.8  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000429039  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>