78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3017 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3017  PAAR repeat-containing protein  100 
 
 		 444 aa  894    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.501568  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3426  hypothetical protein  65.6 
 
 		 386 aa  219  8.999999999999998e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.967185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2762  hypothetical protein  44.78 
 
 		 495 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.517827  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1074  hypothetical protein  50.51 
 
 		 491 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2758  PAAR repeat-containing protein  47.98 
 
 		 406 aa  156  8e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.011226  normal  0.594441 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  41.89 
 
 		 1229 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  36.55 
 
 		 855 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  36.07 
 
 		 1409 aa  101  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  35.25 
 
 		 1385 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  35.25 
 
 		 1400 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  35.43 
 
 		 1411 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  35.32 
 
 		 1140 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  37.43 
 
 		 1410 aa  92.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  37.28 
 
 		 1359 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  41.41 
 
 		 1421 aa  87.8  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  40.51 
 
 		 1379 aa  86.7  8e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  37.65 
 
 		 1419 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  36.04 
 
 		 1386 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  36.36 
 
 		 1446 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3079  YD repeat-containing protein  40.62 
 
 		 1505 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  34.25 
 
 		 1390 aa  75.5  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  34.25 
 
 		 1418 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  34.25 
 
 		 1402 aa  75.5  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0647  RHS Repeat family protein  40.62 
 
 		 1616 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0585  YD repeat-containing protein  39.84 
 
 		 1600 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01140  hypothetical protein  37.74 
 
 		 439 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.337487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0167  PAAR motif-containing protein  36.92 
 
 		 434 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  32.56 
 
 		 1604 aa  67.8  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  28.37 
 
 		 1422 aa  67.8  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1609  YD repeat protein  31.43 
 
 		 1447 aa  65.9  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2694  YD repeat protein  30.59 
 
 		 1428 aa  65.9  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00194911  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2838  YD repeat-containing protein  31.14 
 
 		 1654 aa  65.5  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0573188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  35 
 
 		 1423 aa  65.1  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  35.48 
 
 		 1583 aa  64.3  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0483  PAAR repeat-containing protein  35.68 
 
 		 597 aa  63.9  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  33.06 
 
 		 1475 aa  61.6  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  33.06 
 
 		 1457 aa  61.6  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0051  YD repeat protein  28.74 
 
 		 1437 aa  60.8  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0882  hypothetical protein  30.19 
 
 		 251 aa  59.3  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  30.71 
 
 		 1494 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  30.71 
 
 		 1487 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  30.71 
 
 		 1494 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02067  hypothetical protein  28.83 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  31.17 
 
 		 1517 aa  56.2  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0018  type III effector HopO1-1  26.57 
 
 		 283 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0402217  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0881  hypothetical protein  33.33 
 
 		 258 aa  55.1  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4594  type III effector HopO1-2  24.75 
 
 		 298 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.976788  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  30 
 
 		 1495 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1081  hypothetical protein  40 
 
 		 102 aa  54.7  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.738335 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02068  hypothetical protein  26.34 
 
 		 259 aa  53.5  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02164  hypothetical protein  28.57 
 
 		 396 aa  52.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.122955  normal  0.138015 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1907  PAAR repeat-containing protein  40.54 
 
 		 93 aa  50.4  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0142709  hitchhiker  0.000734481 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3706  hypothetical protein  30.34 
 
 		 623 aa  49.7  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  41.89 
 
 		 1541 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  41.89 
 
 		 1541 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  41.89 
 
 		 1541 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  41.89 
 
 		 1541 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  41.89 
 
 		 1541 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  41.89 
 
 		 1541 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000030  hypothetical protein  39.36 
 
 		 96 aa  48.9  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  41.89 
 
 		 1381 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  41.89 
 
 		 1553 aa  48.5  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1762  S-type Pyocin domain protein  32.35 
 
 		 592 aa  48.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.842268  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1157  PAAR repeat-containing protein  37.66 
 
 		 100 aa  46.6  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.811725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3237  PAAR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 456 aa  46.6  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3584  PAAR repeat-containing protein  43.04 
 
 		 84 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3775  helix-turn-helix, AraC type  40.28 
 
 		 540 aa  45.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1647  hypothetical protein  29.45 
 
 		 291 aa  44.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.359391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0768  hypothetical protein  37.8 
 
 		 96 aa  43.9  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0167  Rhs family protein  39.19 
 
 		 91 aa  43.5  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.688933  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0130  Rhs family protein  39.19 
 
 		 89 aa  43.5  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904339  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0144  PAAR motif-containing protein  39.19 
 
 		 91 aa  43.5  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.352766  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1614  Rhs family protein  39.19 
 
 		 89 aa  43.5  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2824  PAAR repeat-containing protein  35.8 
 
 		 456 aa  43.1  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2512  PAAR repeat-containing protein  36 
 
 		 461 aa  43.1  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1487  hypothetical protein  40.54 
 
 		 86 aa  43.1  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1375  hypothetical protein  40.54 
 
 		 86 aa  43.1  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1933  hypothetical protein  40.54 
 
 		 86 aa  43.1  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.437676  normal  0.622076 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>