27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2253 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2253  PAAR repeat-containing protein  100 
 
 
105 aa  191  4e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175584  hitchhiker  0.000480373 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1664  PAAR repeat-containing protein  56.44 
 
 
96 aa  85.5  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.121011 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2816  PAAR repeat-containing protein  56.44 
 
 
96 aa  84.3  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5249  PAAR repeat-containing protein  50.5 
 
 
96 aa  76.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000530651 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3156  PAAR repeat-containing protein  51 
 
 
96 aa  75.1  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3928  PAAR repeat-containing protein  50.96 
 
 
100 aa  71.2  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00719724  normal  0.0225395 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4114  PAAR repeat-containing protein  50.5 
 
 
96 aa  70.9  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.916002  hitchhiker  0.00152888 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2373  PAAR repeat-containing protein  48.51 
 
 
96 aa  69.3  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0352022 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0368  PAAR repeat-containing protein  46.67 
 
 
100 aa  67.4  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0675  PAAR repeat-containing protein  48.08 
 
 
99 aa  63.2  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2461  hypothetical protein  45.19 
 
 
99 aa  62.8  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1168  putative type VI secretion protein VasV-1, PAAR domain protein  43.27 
 
 
98 aa  61.6  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173375  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0699  PAAR repeat-containing protein  45 
 
 
113 aa  60.8  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3002  PAAR  46.15 
 
 
99 aa  60.5  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2358  PAAR repeat-containing protein  44.55 
 
 
96 aa  59.3  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3584  PAAR repeat-containing protein  50 
 
 
84 aa  59.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000030  hypothetical protein  40.59 
 
 
96 aa  58.2  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0985  hypothetical protein  40.95 
 
 
98 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0761318  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3826  PAAR repeat-containing protein  38.78 
 
 
99 aa  50.8  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1081  hypothetical protein  38.1 
 
 
102 aa  46.2  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.738335 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1907  PAAR repeat-containing protein  43.81 
 
 
93 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0142709  hitchhiker  0.000734481 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5383  PAAR repeat-containing protein  44.23 
 
 
93 aa  43.5  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1578  Rhs family protein  36 
 
 
1556 aa  42  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.883586  normal  0.184607 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1039  PAAR  39.05 
 
 
89 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0895  hypothetical protein  39.05 
 
 
89 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.457574 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3608  PAAR  39.62 
 
 
92 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000736395 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1043  hypothetical protein  46.15 
 
 
92 aa  40.4  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>