50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4045 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4045  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  177  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3238  PAAR repeat-containing protein  57.65 
 
 		 85 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.198697  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2610  hypothetical protein  55.29 
 
 		 85 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408788  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3115  PAAR repeat-containing protein  55.29 
 
 		 85 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2854  hypothetical protein  56.47 
 
 		 85 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.561027  normal  0.0963885 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3019  hypothetical protein  55.29 
 
 		 84 aa  87.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.746993 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6127  PAAR repeat-containing protein  52.94 
 
 		 84 aa  84.3  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0581987  normal  0.43186 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6138  PAAR repeat-containing protein  47.06 
 
 		 94 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617294 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3756  hypothetical protein  46.75 
 
 		 386 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.136459  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0685  PAAR  45.45 
 
 		 379 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3826  PAAR repeat-containing protein  39.18 
 
 		 99 aa  57  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3257  phospholipase  37.62 
 
 		 101 aa  50.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  58.33 
 
 		 1386 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1832  hypothetical protein  46.81 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.643007 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0034  hypothetical protein  44.12 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.543283  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4114  PAAR repeat-containing protein  35.79 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.916002  hitchhiker  0.00152888 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000030  hypothetical protein  38.89 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0335  phosphomethylpyrimidine kinase  40.45 
 
 		 466 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3189  PAAR  37.18 
 
 		 179 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000563624  normal  0.0101045 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1650  hypothetical protein  34.07 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05511  paar motif family  43.33 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0211513  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  52.78 
 
 		 1400 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  52.78 
 
 		 1385 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4969  PAAR  37.5 
 
 		 102 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  52.78 
 
 		 1409 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5249  PAAR repeat-containing protein  35.79 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000530651 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  51.35 
 
 		 1422 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1157  PAAR repeat-containing protein  46.3 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.811725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  57.14 
 
 		 1411 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3817  PAAR  37.18 
 
 		 181 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153298  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  51.22 
 
 		 1229 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  51.22 
 
 		 855 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0699  PAAR repeat-containing protein  35.37 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1081  hypothetical protein  30 
 
 		 102 aa  42  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.738335 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1664  PAAR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121011 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2358  PAAR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3156  PAAR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2694  YD repeat protein  46.67 
 
 		 1428 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00194911  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0675  PAAR repeat-containing protein  31.96 
 
 		 99 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13390  hypothetical protein  35.8 
 
 		 131 aa  41.2  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.694836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1609  YD repeat protein  46 
 
 		 1447 aa  41.2  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  42.86 
 
 		 1379 aa  41.2  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03898  paar motif family  39.44 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.356089  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  47.22 
 
 		 1140 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3928  PAAR repeat-containing protein  38.81 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00719724  normal  0.0225395 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1762  S-type Pyocin domain protein  33.73 
 
 		 592 aa  40.8  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.842268  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2512  PAAR repeat-containing protein  54.55 
 
 		 461 aa  40.4  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0585  YD repeat-containing protein  51.43 
 
 		 1600 aa  40.4  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3079  YD repeat-containing protein  51.43 
 
 		 1505 aa  40  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0647  RHS Repeat family protein  51.43 
 
 		 1616 aa  40  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>