55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0945 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0945  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  352  2e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00120455  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3606  PAAR repeat-containing protein  67.78 
 
 
96 aa  133  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0034  hypothetical protein  64.89 
 
 
94 aa  131  5e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.543283  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2662  PAAR repeat-containing protein  64.77 
 
 
323 aa  118  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2560  PAAR repeat-containing protein  44.38 
 
 
174 aa  118  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.801514  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4258  PAAR repeat-containing protein  48.98 
 
 
169 aa  117  9e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2373  hypothetical protein  60.64 
 
 
94 aa  101  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0059  PAAR repeat-containing protein  45.05 
 
 
99 aa  85.1  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1762  S-type Pyocin domain protein  49.5 
 
 
592 aa  80.1  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.842268  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3775  helix-turn-helix, AraC type  51.06 
 
 
540 aa  79  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2512  PAAR repeat-containing protein  46.73 
 
 
461 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2184  PAAR repeat-containing protein  53.09 
 
 
88 aa  73.6  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.062242  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0335  phosphomethylpyrimidine kinase  50.55 
 
 
466 aa  73.9  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0532  PAAR repeat-containing protein  52.13 
 
 
88 aa  71.2  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1157  PAAR repeat-containing protein  47.73 
 
 
100 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.811725  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2824  PAAR repeat-containing protein  44.34 
 
 
456 aa  69.7  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3237  PAAR repeat-containing protein  45.28 
 
 
456 aa  69.3  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3448  PAAR repeat-containing protein  51.32 
 
 
88 aa  68.6  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.86089  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3257  phospholipase  43.01 
 
 
101 aa  59.3  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4551  PAAR repeat-containing protein  38.64 
 
 
185 aa  57.8  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  41.89 
 
 
1381 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  41.89 
 
 
1541 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  41.89 
 
 
1541 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  41.89 
 
 
1541 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  41.89 
 
 
1541 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  41.89 
 
 
1541 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  41.89 
 
 
1541 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3189  PAAR  47.73 
 
 
179 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000563624  normal  0.0101045 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5592  PAAR  47.62 
 
 
469 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  40.54 
 
 
1553 aa  53.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4633  hypothetical protein  49.38 
 
 
177 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.53967  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53640  hypothetical protein  46.99 
 
 
172 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0232155  hitchhiker  0.000303708 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5430  hypothetical protein  48.19 
 
 
174 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  44 
 
 
855 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1081  hypothetical protein  40.7 
 
 
102 aa  47  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.738335 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  33.33 
 
 
1229 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3817  PAAR  46.43 
 
 
181 aa  47  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153298  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000030  hypothetical protein  50 
 
 
96 aa  45.8  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  39.76 
 
 
1446 aa  45.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  36.99 
 
 
1527 aa  45.1  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  35.9 
 
 
1422 aa  45.1  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05511  paar motif family  38.55 
 
 
86 aa  44.7  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0211513  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0093  hypothetical protein  39.22 
 
 
481 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1832  hypothetical protein  43.42 
 
 
118 aa  43.9  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.643007 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0240  PAAR repeat-containing protein  36.49 
 
 
113 aa  43.9  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3806  PAAR  37.4 
 
 
165 aa  43.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.159045 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0211  PAAR repeat-containing protein  33.33 
 
 
93 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  39.24 
 
 
1379 aa  42.4  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2358  PAAR repeat-containing protein  42.68 
 
 
96 aa  42.4  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0056  PAAR repeat-containing protein  38.36 
 
 
88 aa  42.4  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03898  paar motif family  40.98 
 
 
137 aa  41.6  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.356089  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7018  PAAR repeat-containing protein  38.89 
 
 
92 aa  41.6  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.893923 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  35.9 
 
 
1385 aa  40.8  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  35.9 
 
 
1400 aa  40.8  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5741  PAAR repeat-containing protein  33.67 
 
 
94 aa  40.8  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0643815  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>