67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0167 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0167  PAAR motif-containing protein  100 
 
 		 434 aa  868    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01140  hypothetical protein  97.88 
 
 		 439 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.337487  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  38.67 
 
 		 1385 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  38.67 
 
 		 1400 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  39.56 
 
 		 1409 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  35.81 
 
 		 1411 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  33.64 
 
 		 1229 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1465  hypothetical protein  38.89 
 
 		 195 aa  89.7  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00118621  normal  0.0161918 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2758  PAAR repeat-containing protein  40.54 
 
 		 406 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.011226  normal  0.594441 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3426  hypothetical protein  46.25 
 
 		 386 aa  83.6  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.967185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  36.87 
 
 		 1410 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3017  PAAR repeat-containing protein  34.64 
 
 		 444 aa  80.5  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.501568  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  35.55 
 
 		 855 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  36.82 
 
 		 1140 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  35.9 
 
 		 1517 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  30.43 
 
 		 1419 aa  74.3  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  31.67 
 
 		 1379 aa  73.6  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2838  YD repeat-containing protein  37.24 
 
 		 1654 aa  73.6  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0573188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  33.12 
 
 		 1494 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  33.12 
 
 		 1494 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1487 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  37.72 
 
 		 1446 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1495 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4293  hypothetical protein  32.78 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000126471  hitchhiker  0.0023033 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  35.03 
 
 		 1386 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  35.62 
 
 		 1422 aa  67.4  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0051  YD repeat protein  31.76 
 
 		 1437 aa  65.9  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  33.33 
 
 		 1457 aa  64.7  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  33.33 
 
 		 1475 aa  64.7  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  34.01 
 
 		 1421 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  33.93 
 
 		 1359 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4297  hypothetical protein  31.55 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000812319  hitchhiker  0.000419627 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2694  YD repeat protein  33.81 
 
 		 1428 aa  58.2  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00194911  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  31.62 
 
 		 1423 aa  57.8  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  29.21 
 
 		 1604 aa  57.8  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1609  YD repeat protein  31.37 
 
 		 1447 aa  57.4  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3775  helix-turn-helix, AraC type  35.34 
 
 		 540 aa  57  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  27.47 
 
 		 1390 aa  56.6  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  27.47 
 
 		 1418 aa  56.2  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  27.47 
 
 		 1402 aa  56.2  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1762  S-type Pyocin domain protein  43.53 
 
 		 592 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.842268  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  29.41 
 
 		 1583 aa  51.2  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3079  YD repeat-containing protein  37.84 
 
 		 1505 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3257  phospholipase  40.51 
 
 		 101 aa  50.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0647  RHS Repeat family protein  35.65 
 
 		 1616 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0483  PAAR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 597 aa  49.7  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2512  PAAR repeat-containing protein  40.51 
 
 		 461 aa  49.7  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0585  YD repeat-containing protein  36.94 
 
 		 1600 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1832  hypothetical protein  35.87 
 
 		 118 aa  48.9  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.643007 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1081  hypothetical protein  37.08 
 
 		 102 aa  48.9  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.738335 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0335  phosphomethylpyrimidine kinase  42.35 
 
 		 466 aa  48.9  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2824  PAAR repeat-containing protein  40.51 
 
 		 456 aa  48.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1293  PAAR  35.62 
 
 		 96 aa  47  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.455231 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3237  PAAR repeat-containing protein  37.97 
 
 		 456 aa  45.8  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1375  hypothetical protein  35.8 
 
 		 86 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1487  hypothetical protein  35.8 
 
 		 86 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1933  hypothetical protein  35.8 
 
 		 86 aa  45.1  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.437676  normal  0.622076 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1381 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  30.27 
 
 		 1541 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  30.27 
 
 		 1541 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  30.27 
 
 		 1541 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  30.27 
 
 		 1541 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  30.27 
 
 		 1541 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  30.27 
 
 		 1541 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  30.77 
 
 		 1553 aa  44.7  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3606  PAAR repeat-containing protein  39.24 
 
 		 96 aa  43.9  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  40 
 
 		 1530 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>