151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4969 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_4969  PAAR  100 
 
 
102 aa  209  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2190  PAAR  52.33 
 
 
88 aa  82  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03898  paar motif family  51.9 
 
 
137 aa  78.2  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.356089  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05511  paar motif family  46.91 
 
 
86 aa  74.7  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0211513  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0479  hypothetical protein  47.5 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000400722  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00394  hypothetical protein  51.85 
 
 
88 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.33074  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05224  hypothetical protein  49.38 
 
 
88 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03514  paar motif family  46.75 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0961  hypothetical protein  48.15 
 
 
88 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_003296  RS01943  hypothetical protein  41.67 
 
 
89 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.309937 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7616  hypothetical protein  43.21 
 
 
86 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2706  PAAR motif-containing protein  45.68 
 
 
88 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61171  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1375  PAAR motif-containing protein  45.68 
 
 
88 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.573546  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0500  hypothetical protein  45.68 
 
 
88 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.714041  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1577  PAAR motif-containing protein  45.68 
 
 
88 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.18435  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1603  PAAR motif-containing protein  45.68 
 
 
88 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0657  PAAR motif-containing protein  45.68 
 
 
88 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2255  hypothetical protein  42.17 
 
 
89 aa  65.1  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1513  PAAR repeat-containing protein  42.22 
 
 
94 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.806121 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3217  hypothetical protein  44.44 
 
 
90 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0242808 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2589  hypothetical protein  47.5 
 
 
87 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.254981  normal  0.133425 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1765  PAAR motif-containing protein  44.44 
 
 
88 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.847105  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0011  PAAR repeat-containing protein  39.51 
 
 
83 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0903  PAAR domain-containing protein  40.96 
 
 
101 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0098  PAAR motif-containing protein  45 
 
 
87 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.314734  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0092  PAAR motif-containing protein  45 
 
 
87 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3228  PAAR motif-containing protein  45 
 
 
87 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4801  hypothetical protein  39.76 
 
 
88 aa  61.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0636786  normal  0.750355 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0959  PAAR repeat-containing protein  41.25 
 
 
88 aa  60.8  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3874  PAAR domain-containing protein  41.25 
 
 
88 aa  60.8  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.626619  normal  0.0303464 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5509  hypothetical protein  43.75 
 
 
87 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0203  PAAR motif-containing protein  45 
 
 
87 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00559285  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1586  PAAR motif-containing protein  45 
 
 
87 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.160727  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0119  hypothetical protein  48.19 
 
 
175 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.435332  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0130  PAAR motif-containing protein  45 
 
 
87 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3671  hypothetical protein  48.72 
 
 
176 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0103  PAAR motif-containing protein  45 
 
 
87 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1612  PAAR motif-containing protein  45 
 
 
87 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0316  hypothetical protein  39.74 
 
 
453 aa  58.5  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1810  PAAR repeat-containing protein  45 
 
 
87 aa  58.2  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.316839  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3238  PAAR repeat-containing protein  39.76 
 
 
85 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.198697  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1693  PAAR motif-containing protein  43.75 
 
 
87 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3774  hypothetical protein  42.11 
 
 
194 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801042  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5205  PAAR repeat-containing protein  39.02 
 
 
85 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000429039  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2610  hypothetical protein  38.55 
 
 
85 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408788  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2332  PAAR  41.77 
 
 
87 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.311814 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0990  hypothetical protein  39.08 
 
 
93 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.880013 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1288  PAAR repeat-containing protein  39.51 
 
 
83 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0430607 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0211  PAAR repeat-containing protein  36.59 
 
 
93 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3115  PAAR repeat-containing protein  37.35 
 
 
85 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2301  PAAR repeat-containing protein  41.03 
 
 
87 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360683  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6434  PAAR repeat-containing protein  37.04 
 
 
83 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6436  PAAR repeat-containing protein  38.27 
 
 
83 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5071  PAAR repeat-containing protein  38.55 
 
 
136 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.104912 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4517  PAAR repeat-containing protein  37.8 
 
 
86 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2590  PAAR repeat-containing protein  39.51 
 
 
83 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0943  hypothetical protein  37.5 
 
 
87 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00127142  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1878  hypothetical protein  37.5 
 
 
87 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0199793  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3367  PAAR repeat-containing protein  37.8 
 
 
85 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3827  PAAR repeat-containing protein  37.5 
 
 
87 aa  54.7  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86819  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3252  PAAR repeat-containing protein  43.59 
 
 
86 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.447164  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0335  phosphomethylpyrimidine kinase  41.79 
 
 
466 aa  53.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3019  hypothetical protein  51.92 
 
 
84 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.746993 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0240  PAAR repeat-containing protein  45.61 
 
 
113 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0631  hypothetical protein  36.59 
 
 
84 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2227  PAAR repeat-containing protein  39.74 
 
 
83 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0798766  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5741  PAAR repeat-containing protein  36.36 
 
 
94 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0643815  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1677  PAAR repeat-containing protein  39.76 
 
 
91 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.954396  hitchhiker  0.00616072 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2330  PAAR motif-containing protein  39.76 
 
 
141 aa  51.6  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0004  PAAR repeat-containing protein  34.95 
 
 
134 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0248137  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3920  PAAR repeat-containing protein  37.35 
 
 
92 aa  51.6  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2000  hypothetical protein  42.31 
 
 
175 aa  50.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0577978  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0056  PAAR repeat-containing protein  36.49 
 
 
88 aa  50.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2996  hypothetical protein  37.18 
 
 
88 aa  50.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.401348 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2104  PAAR motif-containing protein  39.76 
 
 
141 aa  50.8  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3483  PAAR repeat-containing protein  36.14 
 
 
92 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.22158  normal  0.485236 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  37.31 
 
 
855 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5089  hypothetical protein  40.23 
 
 
152 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1728  PAAR motif-containing protein  37.65 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2496  PAAR motif-containing protein  38.55 
 
 
141 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.433555  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2854  hypothetical protein  39.24 
 
 
85 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.561027  normal  0.0963885 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1928  PAAR motif-containing protein  38.2 
 
 
141 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.252232  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7018  PAAR repeat-containing protein  32.18 
 
 
92 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.893923 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1531  PAAR motif-containing protein  38.55 
 
 
141 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1554  PAAR motif-containing protein  37.65 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2381  PAAR motif-containing protein  38.55 
 
 
141 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1112  PAAR repeat-containing protein  39.76 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0644  bacteriophage GP29 protein  39.19 
 
 
173 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0059  PAAR repeat-containing protein  37.93 
 
 
99 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1762  S-type Pyocin domain protein  34.21 
 
 
592 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.842268  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2340  PAAR motif-containing protein  37.65 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3249  PAAR repeat-containing protein  39.51 
 
 
87 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0505406  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1327  PAAR motif-containing protein  36.47 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.620595  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0546  hypothetical protein  36.47 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0609  PAAR motif-containing protein  36.47 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.364602  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4102  hypothetical protein  42.31 
 
 
107 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0213  bacteriophage GP29 protein  41.89 
 
 
178 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0016  PAAR  37.8 
 
 
86 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1081  hypothetical protein  39.13 
 
 
102 aa  47.8  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.738335 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2741  hypothetical protein  33.33 
 
 
89 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111106  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>