80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3606 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3606  PAAR repeat-containing protein  100 
 
 
96 aa  184  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2662  PAAR repeat-containing protein  81.4 
 
 
323 aa  139  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0945  hypothetical protein  67.78 
 
 
176 aa  133  7.000000000000001e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00120455  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4258  PAAR repeat-containing protein  61.05 
 
 
169 aa  123  7e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0034  hypothetical protein  67.78 
 
 
94 aa  116  9e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.543283  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2560  PAAR repeat-containing protein  57.89 
 
 
174 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.801514  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2373  hypothetical protein  62.22 
 
 
94 aa  97.4  6e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2824  PAAR repeat-containing protein  58.06 
 
 
456 aa  88.6  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1762  S-type Pyocin domain protein  53.76 
 
 
592 aa  86.3  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.842268  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3237  PAAR repeat-containing protein  54.84 
 
 
456 aa  84.7  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0059  PAAR repeat-containing protein  48.28 
 
 
99 aa  84.3  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3775  helix-turn-helix, AraC type  49.44 
 
 
540 aa  80.9  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2512  PAAR repeat-containing protein  53.76 
 
 
461 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0335  phosphomethylpyrimidine kinase  48.94 
 
 
466 aa  78.6  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1157  PAAR repeat-containing protein  51.58 
 
 
100 aa  77.4  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.811725  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0532  PAAR repeat-containing protein  55.56 
 
 
88 aa  76.6  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3257  phospholipase  48.42 
 
 
101 aa  73.9  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2184  PAAR repeat-containing protein  54.32 
 
 
88 aa  67.8  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.062242  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3448  PAAR repeat-containing protein  54.17 
 
 
88 aa  65.1  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.86089  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  41.46 
 
 
1381 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  41.46 
 
 
1541 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  41.46 
 
 
1541 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  41.46 
 
 
1541 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05511  paar motif family  40.82 
 
 
86 aa  55.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0211513  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  41.46 
 
 
1541 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  41.46 
 
 
1541 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  41.46 
 
 
1541 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1081  hypothetical protein  46.51 
 
 
102 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.738335 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  40.24 
 
 
1553 aa  51.6  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  38.82 
 
 
1422 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  41.67 
 
 
855 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  39.73 
 
 
1527 aa  50.4  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  39.76 
 
 
1446 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5592  PAAR  45.24 
 
 
469 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  41.43 
 
 
1140 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0093  hypothetical protein  44.05 
 
 
481 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4551  PAAR repeat-containing protein  46.67 
 
 
185 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0056  PAAR repeat-containing protein  35.62 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3426  hypothetical protein  40.54 
 
 
386 aa  47.8  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.967185  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1513  PAAR repeat-containing protein  33.33 
 
 
94 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.806121 
 
 
-
 
NC_002978  WD0281  hypothetical protein  36.14 
 
 
84 aa  46.6  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1293  PAAR  37.63 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.455231 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  35.9 
 
 
1229 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000030  hypothetical protein  46.67 
 
 
96 aa  46.2  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2996  hypothetical protein  36.14 
 
 
88 aa  45.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.401348 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53640  hypothetical protein  44.74 
 
 
172 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0232155  hitchhiker  0.000303708 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  36.99 
 
 
1421 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2758  PAAR repeat-containing protein  39.19 
 
 
406 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.011226  normal  0.594441 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  37.18 
 
 
1385 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  37.18 
 
 
1400 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2789  PAAR  44.44 
 
 
105 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0285082  normal  0.643653 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  34.62 
 
 
1475 aa  44.7  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2190  PAAR  36.56 
 
 
88 aa  44.7  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01140  hypothetical protein  39.24 
 
 
439 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.337487  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0167  PAAR motif-containing protein  39.24 
 
 
434 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  36.84 
 
 
1457 aa  43.9  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3817  PAAR  44.87 
 
 
181 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153298  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1832  hypothetical protein  42.11 
 
 
118 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.643007 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  36.84 
 
 
1423 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2358  PAAR repeat-containing protein  44 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  35.71 
 
 
1386 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  39.13 
 
 
1410 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0051  YD repeat protein  34.62 
 
 
1437 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0240  PAAR repeat-containing protein  38.16 
 
 
113 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3189  PAAR  43.59 
 
 
179 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000563624  normal  0.0101045 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  35.9 
 
 
1409 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5430  hypothetical protein  42.31 
 
 
174 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3229  PAAR repeat-containing protein  44.44 
 
 
125 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.784559  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6683  PAAR repeat-containing protein  35.42 
 
 
88 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3156  PAAR repeat-containing protein  43.66 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03898  paar motif family  44.26 
 
 
137 aa  40.8  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.356089  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1043  hypothetical protein  47.22 
 
 
92 aa  40.8  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4969  PAAR  36.51 
 
 
102 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1677  PAAR repeat-containing protein  36.26 
 
 
91 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.954396  hitchhiker  0.00616072 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  38.24 
 
 
1494 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  38.24 
 
 
1487 aa  40  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0699  PAAR repeat-containing protein  41.33 
 
 
113 aa  40.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  38.24 
 
 
1494 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2255  hypothetical protein  39.33 
 
 
89 aa  40  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  40.85 
 
 
1379 aa  40  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>