166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1718 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1718  hypothetical protein  100 
 
 		 912 aa  1776    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2275  protein of unknown function DUF214  28.79 
 
 		 931 aa  70.1  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000213352 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2535  hypothetical protein  27.31 
 
 		 931 aa  64.3  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0441997  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  29.6 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1555  protein of unknown function DUF214  29.82 
 
 		 415 aa  59.7  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.5 
 
 		 844 aa  59.7  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  32.8 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  35.34 
 
 		 443 aa  57.8  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4377  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.83 
 
 		 411 aa  57.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0399  ABC transporter related  27.01 
 
 		 1090 aa  57  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.961547 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  30.38 
 
 		 657 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  34.35 
 
 		 403 aa  55.5  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01070  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  31.13 
 
 		 1207 aa  55.5  0.000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  29.03 
 
 		 393 aa  55.5  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  29.17 
 
 		 404 aa  55.5  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  28.24 
 
 		 386 aa  55.5  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3659  protein of unknown function DUF214  28.7 
 
 		 462 aa  55.1  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.410687  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  35.44 
 
 		 838 aa  54.7  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0755  hypothetical protein  29.41 
 
 		 407 aa  54.7  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.951595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  35.29 
 
 		 413 aa  55.1  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  32.46 
 
 		 841 aa  54.3  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  28.95 
 
 		 417 aa  54.3  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5041  putative ABC transporter, permease protein  36.11 
 
 		 441 aa  53.5  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4653  protein of unknown function DUF214  30.63 
 
 		 413 aa  53.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 		 404 aa  53.5  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.4 
 
 		 882 aa  53.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  28.68 
 
 		 452 aa  53.5  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  29.2 
 
 		 391 aa  53.1  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2826  cell division protein FtsX  28.79 
 
 		 453 aa  52.8  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  29.57 
 
 		 413 aa  52.8  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2040  hypothetical protein  29.41 
 
 		 410 aa  52.8  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.11269  normal  0.213161 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6498  protein of unknown function DUF214  39.53 
 
 		 835 aa  52.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.850994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  29.21 
 
 		 654 aa  52.4  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  32.19 
 
 		 381 aa  52  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1460  hypothetical protein  26.55 
 
 		 415 aa  52  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0478  ABC transporter related  24.6 
 
 		 903 aa  51.6  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0114283  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  32.26 
 
 		 401 aa  51.2  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  28.06 
 
 		 397 aa  51.2  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1615  protein of unknown function DUF214  31.58 
 
 		 430 aa  51.2  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  31.58 
 
 		 873 aa  51.2  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0699  hypothetical protein  26.55 
 
 		 404 aa  51.2  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0151116  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4859  protein of unknown function DUF214  27.49 
 
 		 792 aa  50.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0508357 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3722  ABC transporter related  24.48 
 
 		 779 aa  50.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2493  protein of unknown function DUF214  35.45 
 
 		 401 aa  50.4  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  31.62 
 
 		 654 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  41.67 
 
 		 871 aa  49.7  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  27.73 
 
 		 402 aa  50.1  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4414  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.53 
 
 		 413 aa  49.7  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  28.21 
 
 		 413 aa  49.3  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1860  PglC  28.74 
 
 		 399 aa  49.7  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000429042  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1857  ABC transporter related  27.27 
 
 		 885 aa  49.3  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0462324  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  24.04 
 
 		 833 aa  49.7  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  32.63 
 
 		 836 aa  48.9  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  32.05 
 
 		 930 aa  48.9  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1252  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  35.44 
 
 		 434 aa  48.9  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.888586  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  27.4 
 
 		 386 aa  48.9  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  30.67 
 
 		 880 aa  48.9  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  35.11 
 
 		 403 aa  48.5  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  35.29 
 
 		 397 aa  48.5  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2787  putative ABC transport system permease protein  28.36 
 
 		 394 aa  48.1  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000544033  hitchhiker  0.000418311 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4186  hypothetical protein  37.97 
 
 		 828 aa  48.5  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.471594 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3974  protein of unknown function DUF214  28.21 
 
 		 952 aa  48.5  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.146468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  32.81 
 
 		 861 aa  48.5  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1519  protein of unknown function DUF214  27.21 
 
 		 379 aa  48.1  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0078  hypothetical protein  27.74 
 
 		 404 aa  48.1  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000923125  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  27.08 
 
 		 386 aa  48.1  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  31.01 
 
 		 412 aa  47.8  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2783  hypothetical protein  31.76 
 
 		 375 aa  47.4  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.753762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  38.98 
 
 		 859 aa  47.4  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5053  hypothetical protein  31.3 
 
 		 414 aa  47.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.662722  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0109  protein of unknown function DUF214  29.84 
 
 		 419 aa  47.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1684  ABC transporter related  29.91 
 
 		 656 aa  47.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3939  protein of unknown function DUF214  28.95 
 
 		 414 aa  47.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1083  protein of unknown function DUF214  34.62 
 
 		 407 aa  47.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0430  lipoprotein ABC transporter permease  28.57 
 
 		 430 aa  47.4  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0396093  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  40 
 
 		 825 aa  47  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  22.88 
 
 		 417 aa  47.4  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  28.32 
 
 		 406 aa  47  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1472  putative permease  34.57 
 
 		 716 aa  47  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  36.07 
 
 		 855 aa  46.6  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  30.25 
 
 		 400 aa  46.6  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0585  hypothetical protein  32.76 
 
 		 402 aa  46.2  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000219996  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0918  hypothetical protein  24.22 
 
 		 389 aa  46.2  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  30.53 
 
 		 402 aa  46.6  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2927  protein of unknown function DUF214  33.78 
 
 		 409 aa  47  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.58384  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3257  efflux ABC transporter, permease protein  34.57 
 
 		 475 aa  46.6  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.289143  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3143  efflux ABC transporter, permease protein  34.57 
 
 		 475 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183035  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2154  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.38 
 
 		 416 aa  47  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.97636  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1472  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  26.96 
 
 		 414 aa  46.6  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3748  hypothetical protein  28.67 
 
 		 416 aa  47  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.244082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  30.53 
 
 		 402 aa  46.6  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  25.81 
 
 		 663 aa  46.6  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  26.24 
 
 		 397 aa  46.6  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01532  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  27.96 
 
 		 407 aa  46.6  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  34.94 
 
 		 849 aa  46.6  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  35.96 
 
 		 848 aa  47  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  22.4 
 
 		 414 aa  46.2  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1855  permease  35.88 
 
 		 865 aa  46.6  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1886  permease  35.54 
 
 		 844 aa  47  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7079  protein of unknown function DUF214  25.34 
 
 		 452 aa  46.6  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>