108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0353 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0353  integrase family protein  100 
 
 		 401 aa  825    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1644  integrase family protein  40.62 
 
 		 333 aa  247  3e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.104877 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1403  integrase family protein  39.69 
 
 		 335 aa  225  1e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2751  integrase family protein  37.54 
 
 		 368 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0110  integrase family protein  35.69 
 
 		 338 aa  190  4e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0155  integrase-like protein  35.88 
 
 		 349 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.650609 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0789  integrase domain protein SAM domain protein  33.14 
 
 		 351 aa  159  7e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0442  integrase family protein  33.33 
 
 		 340 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.966823 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0295  integrase domain protein SAM domain protein  32.54 
 
 		 347 aa  153  4e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.891563  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0467  integrase domain protein SAM domain protein  31.69 
 
 		 336 aa  150  5e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.486802 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1699  phage integrase/site-specific recombinase  30.97 
 
 		 345 aa  145  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.440946  normal  0.508848 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0965  integrase family protein  29.02 
 
 		 351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0782339 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  29.09 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2473  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.35 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3087  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.35 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  23.53 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  28.07 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3104  site-specific tyrosine recombinase XerC  25 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494742 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  22.73 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0497  tyrosine recombinase XerC  24.09 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.237269  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4306  integrase/recombinase XerC  25.24 
 
 		 299 aa  57  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  22.84 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3247  integrase/recombinase XerC  22.58 
 
 		 296 aa  56.2  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0392  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.12 
 
 		 310 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6437  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.01 
 
 		 306 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.798094 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.12 
 
 		 310 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  23.01 
 
 		 313 aa  55.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0170  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.28 
 
 		 306 aa  54.7  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3133  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.22 
 
 		 306 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  22.09 
 
 		 324 aa  54.7  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2996  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.22 
 
 		 306 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0374572 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3258  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.77 
 
 		 310 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.706598  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2920  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.77 
 
 		 310 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.510567  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2169  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.77 
 
 		 310 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.126979  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0195  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.77 
 
 		 310 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3428  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.77 
 
 		 310 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5304  site-specific recombinase, phage integrase family  21.79 
 
 		 322 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2509  integrase family protein  23.37 
 
 		 380 aa  52.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.593152  normal  0.73908 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0047  tyrosine recombinase XerC  25.93 
 
 		 298 aa  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  23.41 
 
 		 332 aa  51.6  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1239  phage integrase  27.8 
 
 		 419 aa  51.2  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.183742 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3505  phage integrase family protein  29.29 
 
 		 330 aa  51.6  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.431904  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0447  tyrosine recombinase XerC  22.33 
 
 		 299 aa  51.2  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  23.81 
 
 		 294 aa  50.8  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  21.93 
 
 		 297 aa  50.8  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  22.36 
 
 		 317 aa  50.8  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  21.15 
 
 		 293 aa  50.8  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3082  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.22 
 
 		 306 aa  50.4  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.633641  normal  0.120316 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0861  integrase/recombinase XerC  24.63 
 
 		 304 aa  50.1  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  21.86 
 
 		 306 aa  50.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  22.94 
 
 		 297 aa  50.4  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.32 
 
 		 299 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  25 
 
 		 304 aa  50.1  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5348  integrase family protein  23.66 
 
 		 330 aa  50.1  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464558 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2008  integrase family protein  23.66 
 
 		 330 aa  50.1  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2228  integrase family protein  23.66 
 
 		 330 aa  50.1  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.763924 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0394  tyrosine recombinase XerC  23.13 
 
 		 299 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3631  tyrosine recombinase XerC  23.13 
 
 		 299 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0393  tyrosine recombinase XerC  23.13 
 
 		 299 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0023  integrase family protein  21.43 
 
 		 291 aa  48.9  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0318  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.68 
 
 		 300 aa  48.9  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  21.05 
 
 		 293 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  23.14 
 
 		 343 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0626  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.92 
 
 		 315 aa  47.8  0.0003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  22.93 
 
 		 302 aa  48.1  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  22.9 
 
 		 311 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09860  tyrosine recombinase XerC subunit  26.45 
 
 		 329 aa  48.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2179  integrase family protein  23.45 
 
 		 288 aa  47.8  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.353401  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  26.04 
 
 		 298 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  20.8 
 
 		 310 aa  47.8  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0222  integrase/recombinase XerC  25 
 
 		 299 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0989  integrase family protein  23.33 
 
 		 292 aa  47  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  23.01 
 
 		 343 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2276  tyrosine recombinase XerD  23.87 
 
 		 301 aa  47  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235275  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  24 
 
 		 302 aa  46.6  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12908  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.31 
 
 		 298 aa  45.8  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000436053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4127  tyrosine recombinase XerC  23.57 
 
 		 301 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.442069 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0611  integrase family protein  20.95 
 
 		 337 aa  45.8  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  24.22 
 
 		 304 aa  46.2  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.26 
 
 		 318 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.26 
 
 		 318 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3558  phage integrase family protein  26.21 
 
 		 311 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2391  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.14 
 
 		 311 aa  45.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.55 
 
 		 298 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3835  tyrosine recombinase XerC  24.58 
 
 		 304 aa  45.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.955587  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  22.29 
 
 		 302 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5501  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.87 
 
 		 299 aa  44.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  22.75 
 
 		 294 aa  44.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.26 
 
 		 318 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3115  phage integrase  22.22 
 
 		 298 aa  44.3  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0264  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.37 
 
 		 315 aa  44.3  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3550  integrase family protein  21.27 
 
 		 324 aa  44.3  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0674  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.08 
 
 		 303 aa  43.9  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0347  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.28 
 
 		 307 aa  43.9  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  22.32 
 
 		 295 aa  43.5  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2207  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.43 
 
 		 319 aa  43.9  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787262  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5230  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.29 
 
 		 299 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  24.18 
 
 		 295 aa  43.5  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1457  integrase family protein  25.89 
 
 		 326 aa  43.5  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2210  integrase family protein  22.63 
 
 		 295 aa  43.5  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241024 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>