45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1403 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1403  integrase family protein  100 
 
 		 335 aa  686    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0110  integrase family protein  49.41 
 
 		 338 aa  342  5e-93  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0155  integrase-like protein  46.13 
 
 		 349 aa  309  5e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.650609 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0965  integrase family protein  44.96 
 
 		 351 aa  300  3e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0782339 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0467  integrase domain protein SAM domain protein  46.99 
 
 		 336 aa  299  4e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.486802 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0789  integrase domain protein SAM domain protein  47.01 
 
 		 351 aa  294  2e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0442  integrase family protein  45.88 
 
 		 340 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.966823 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1644  integrase family protein  43.73 
 
 		 333 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.104877 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0295  integrase domain protein SAM domain protein  41.83 
 
 		 347 aa  261  1e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.891563  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2751  integrase family protein  39.41 
 
 		 368 aa  243  3e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1699  phage integrase/site-specific recombinase  40.25 
 
 		 345 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.440946  normal  0.508848 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0353  integrase family protein  39.69 
 
 		 401 aa  225  9e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  22.4 
 
 		 296 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2210  integrase family protein  25.75 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241024 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  22.01 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1227  integrase family protein  22.77 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.842173  decreased coverage  0.000216705 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  18.77 
 
 		 295 aa  54.3  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  22.01 
 
 		 295 aa  50.8  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4048  hypothetical protein  24.83 
 
 		 133 aa  50.4  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  20.7 
 
 		 297 aa  50.4  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  19.65 
 
 		 294 aa  50.4  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1084  integrase/recombinase XerD, putative  20.07 
 
 		 296 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.636718  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  23.37 
 
 		 305 aa  50.1  0.00006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  19.58 
 
 		 296 aa  49.3  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  22.29 
 
 		 296 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  27.22 
 
 		 307 aa  47  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  23.77 
 
 		 304 aa  47  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0562  integrase/recombinase  20.69 
 
 		 308 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0843058  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1316  integrase/recombinase  21.76 
 
 		 306 aa  46.6  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.718184  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  20.68 
 
 		 295 aa  46.2  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  23.9 
 
 		 313 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0078  phage integrase family protein  22.01 
 
 		 319 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2347  phage integrase family protein  22.33 
 
 		 332 aa  45.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.01871 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0139  tyrosine recombinase XerD  23.68 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0010  tyrosine recombinase XerC  17.25 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2471  tyrosine recombinase XerC subunit  22.73 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  21.93 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1360  integrase/recombinase  24.83 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6099899999999998e-31 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  23.76 
 
 		 314 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  18.95 
 
 		 322 aa  43.9  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1431  phage integrase  21.52 
 
 		 309 aa  43.1  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.145363  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  19.52 
 
 		 291 aa  43.1  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3643  tyrosine recombinase XerD  19.74 
 
 		 309 aa  42.7  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  23.63 
 
 		 305 aa  42.4  0.01  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  23.94 
 
 		 295 aa  42.4  0.01  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>