21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0442 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0442  integrase family protein  100 
 
 		 340 aa  699    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.966823 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0789  integrase domain protein SAM domain protein  77.65 
 
 		 351 aa  554  1e-157  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0467  integrase domain protein SAM domain protein  62.02 
 
 		 336 aa  443  1e-123  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.486802 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1403  integrase family protein  45.88 
 
 		 335 aa  283  3.0000000000000004e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0110  integrase family protein  39.83 
 
 		 338 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0155  integrase-like protein  39.27 
 
 		 349 aa  231  2e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.650609 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1644  integrase family protein  39.34 
 
 		 333 aa  222  7e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.104877 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0965  integrase family protein  37.78 
 
 		 351 aa  207  3e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0782339 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1699  phage integrase/site-specific recombinase  38.96 
 
 		 345 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.440946  normal  0.508848 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2751  integrase family protein  33.14 
 
 		 368 aa  177  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0295  integrase domain protein SAM domain protein  34.87 
 
 		 347 aa  172  5.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.891563  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0353  integrase family protein  33.33 
 
 		 401 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  24.68 
 
 		 315 aa  49.3  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4048  hypothetical protein  24.14 
 
 		 133 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0666  Phage integrase, N-terminal SAM- like  20.66 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.555034  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1189  integrase family protein  19.79 
 
 		 297 aa  45.4  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203109  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  22.38 
 
 		 307 aa  45.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1431  phage integrase  23.57 
 
 		 309 aa  44.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.145363  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.24 
 
 		 318 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.24 
 
 		 318 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.24 
 
 		 318 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>