20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2751 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_2751  integrase family protein  100 
 
 		 368 aa  757    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1403  integrase family protein  39.41 
 
 		 335 aa  243  3e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0110  integrase family protein  40.53 
 
 		 338 aa  242  7e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0965  integrase family protein  37.46 
 
 		 351 aa  194  2e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0782339 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0467  integrase domain protein SAM domain protein  35.76 
 
 		 336 aa  192  9e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.486802 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0789  integrase domain protein SAM domain protein  35.16 
 
 		 351 aa  192  1e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0353  integrase family protein  37.54 
 
 		 401 aa  190  2.9999999999999997e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0155  integrase-like protein  34.3 
 
 		 349 aa  181  1e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.650609 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0442  integrase family protein  33.14 
 
 		 340 aa  177  3e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.966823 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1644  integrase family protein  33.43 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.104877 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0295  integrase domain protein SAM domain protein  33.62 
 
 		 347 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.891563  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1699  phage integrase/site-specific recombinase  31.19 
 
 		 345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.440946  normal  0.508848 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4048  hypothetical protein  35.82 
 
 		 133 aa  47.4  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5304  site-specific recombinase, phage integrase family  24.89 
 
 		 322 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2210  integrase family protein  27.56 
 
 		 295 aa  43.9  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241024 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3115  phage integrase  23.49 
 
 		 298 aa  43.5  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0861  integrase/recombinase XerC  20.89 
 
 		 304 aa  43.5  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09860  tyrosine recombinase XerC subunit  31.01 
 
 		 329 aa  43.1  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  21.98 
 
 		 284 aa  43.1  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  31.58 
 
 		 310 aa  43.1  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>