39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0789 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0789  integrase domain protein SAM domain protein  100 
 
 		 351 aa  713    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0442  integrase family protein  77.65 
 
 		 340 aa  554  1e-157  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.966823 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0467  integrase domain protein SAM domain protein  64.99 
 
 		 336 aa  459  9.999999999999999e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.486802 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1403  integrase family protein  47.01 
 
 		 335 aa  294  2e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0110  integrase family protein  41.35 
 
 		 338 aa  257  2e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0965  integrase family protein  42.03 
 
 		 351 aa  240  2e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0782339 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0155  integrase-like protein  39.43 
 
 		 349 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.650609 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1644  integrase family protein  38.74 
 
 		 333 aa  230  2e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.104877 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1699  phage integrase/site-specific recombinase  39.51 
 
 		 345 aa  208  1e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.440946  normal  0.508848 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2751  integrase family protein  35.16 
 
 		 368 aa  192  9e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0295  integrase domain protein SAM domain protein  36.49 
 
 		 347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.891563  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0353  integrase family protein  33.14 
 
 		 401 aa  159  6e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1466  Tn554-related, transposase A  31.78 
 
 		 370 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000354684  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4048  hypothetical protein  24.83 
 
 		 133 aa  52.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  25.71 
 
 		 307 aa  50.4  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  25.71 
 
 		 307 aa  49.7  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  26.67 
 
 		 307 aa  49.3  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1366  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.04 
 
 		 450 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000415693  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1431  phage integrase  22.18 
 
 		 309 aa  47.8  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.145363  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1179  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.55 
 
 		 450 aa  47.4  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000142279  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  29.15 
 
 		 318 aa  47  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  22.26 
 
 		 305 aa  47  0.0005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3147  Tn554-related, transposase A  23.05 
 
 		 372 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.85236  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  21.3 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  24.76 
 
 		 307 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  21.45 
 
 		 315 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1337  tyrosine recombinase XerC  22 
 
 		 298 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0149085  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.59 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1312  tyrosine recombinase XerC  22 
 
 		 298 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.199373  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1316  integrase/recombinase  21.86 
 
 		 306 aa  45.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.718184  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  25 
 
 		 318 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0292  tyrosine recombinase XerD  23.55 
 
 		 305 aa  43.5  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  25 
 
 		 318 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  25 
 
 		 318 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0242  Tn554-related, transposase A  29.6 
 
 		 519 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3084  phage integrase  24.86 
 
 		 189 aa  43.5  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1457  integrase family protein  26.02 
 
 		 326 aa  43.1  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2391  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.18 
 
 		 311 aa  43.1  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0426  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.95 
 
 		 321 aa  42.7  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>