30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1644 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1644  integrase family protein  100 
 
 		 333 aa  694    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.104877 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1403  integrase family protein  43.73 
 
 		 335 aa  278  9e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0110  integrase family protein  43.28 
 
 		 338 aa  277  2e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0353  integrase family protein  40.92 
 
 		 401 aa  249  3e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0789  integrase domain protein SAM domain protein  38.74 
 
 		 351 aa  235  7e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0467  integrase domain protein SAM domain protein  40.06 
 
 		 336 aa  225  1e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.486802 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0442  integrase family protein  39.34 
 
 		 340 aa  225  1e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.966823 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0155  integrase-like protein  36.55 
 
 		 349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.650609 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1699  phage integrase/site-specific recombinase  37.19 
 
 		 345 aa  207  2e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.440946  normal  0.508848 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0965  integrase family protein  36.2 
 
 		 351 aa  207  3e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0782339 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2751  integrase family protein  33.73 
 
 		 368 aa  179  9e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0295  integrase domain protein SAM domain protein  34.68 
 
 		 347 aa  176  5e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.891563  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  24.26 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0989  integrase family protein  26.06 
 
 		 292 aa  52  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.19 
 
 		 322 aa  50.8  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1457  integrase family protein  23.21 
 
 		 326 aa  50.1  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2179  integrase family protein  25.51 
 
 		 288 aa  47.8  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.353401  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  20.8 
 
 		 296 aa  46.6  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1906  integrase family protein  21.03 
 
 		 295 aa  45.1  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.713326  normal  0.217947 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  20.07 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4243  phage integrase  22.41 
 
 		 309 aa  44.3  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000426285 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  22.26 
 
 		 306 aa  44.3  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2194  integrase family protein  21.43 
 
 		 317 aa  43.9  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  20.07 
 
 		 296 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  20.07 
 
 		 296 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  20.07 
 
 		 296 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  20.07 
 
 		 296 aa  43.1  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  20.07 
 
 		 296 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  20.07 
 
 		 296 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  20.07 
 
 		 296 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>