51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0965 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0965  integrase family protein  100 
 
 		 351 aa  721    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0782339 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0155  integrase-like protein  58.09 
 
 		 349 aa  409  1e-113  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.650609 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1403  integrase family protein  45.24 
 
 		 335 aa  312  6.999999999999999e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0110  integrase family protein  42.98 
 
 		 338 aa  289  4e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0789  integrase domain protein SAM domain protein  42.61 
 
 		 351 aa  251  1e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0467  integrase domain protein SAM domain protein  40.97 
 
 		 336 aa  246  4e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.486802 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0295  integrase domain protein SAM domain protein  38.55 
 
 		 347 aa  219  7e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.891563  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0442  integrase family protein  37.78 
 
 		 340 aa  218  2e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.966823 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2751  integrase family protein  37.46 
 
 		 368 aa  211  2e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1644  integrase family protein  36.2 
 
 		 333 aa  207  2e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.104877 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1699  phage integrase/site-specific recombinase  37.2 
 
 		 345 aa  200  3.9999999999999996e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.440946  normal  0.508848 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0353  integrase family protein  30.17 
 
 		 401 aa  159  8e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  23.33 
 
 		 296 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0436  integrase family protein  25.81 
 
 		 323 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.788545  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  28.48 
 
 		 304 aa  50.4  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05531  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.58 
 
 		 347 aa  50.1  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2175  phage integrase family protein  26.86 
 
 		 440 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1227  integrase family protein  21.94 
 
 		 305 aa  49.3  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.842173  decreased coverage  0.000216705 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1360  integrase/recombinase  26.77 
 
 		 306 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6099899999999998e-31 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2421  integrase family protein  26.59 
 
 		 323 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0129159 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2194  integrase family protein  25.65 
 
 		 317 aa  47  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  21.18 
 
 		 324 aa  47  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0339  phage integrase  25 
 
 		 277 aa  47  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  23.66 
 
 		 305 aa  46.6  0.0006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0768  integrase family protein  32.38 
 
 		 337 aa  46.2  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000101801 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9020  integrase/recombinase  31.31 
 
 		 255 aa  46.2  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8262  integrase/recombinase  31.31 
 
 		 325 aa  45.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19921  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1316  integrase/recombinase  21.62 
 
 		 306 aa  45.8  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.718184  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1450  integrase family protein  22.17 
 
 		 299 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00858396  normal  0.734684 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  26.19 
 
 		 296 aa  45.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2825  integrase domain protein SAM domain protein  26.06 
 
 		 269 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  21.91 
 
 		 295 aa  45.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7620  integrase family protein  23.17 
 
 		 343 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2241  integrase family protein  27.39 
 
 		 345 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.640527  hitchhiker  0.000757999 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  25.28 
 
 		 307 aa  44.7  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3694  integrase family protein  22.47 
 
 		 348 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0738  integrase/recombinase  26.05 
 
 		 340 aa  44.3  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1434  integrase family protein  32.99 
 
 		 342 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1431  phage integrase  27.63 
 
 		 309 aa  44.3  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.145363  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4062  tyrosine recombinase XerD  26.11 
 
 		 353 aa  43.5  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.159612  normal  0.47475 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  21.05 
 
 		 299 aa  43.5  0.006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.09 
 
 		 322 aa  43.5  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  20.72 
 
 		 300 aa  43.5  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0067  integrase family protein  27.41 
 
 		 385 aa  43.1  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.952097  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0630  phage integrase family protein  24.19 
 
 		 347 aa  43.1  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.7962  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02971  integrase  27.66 
 
 		 186 aa  43.1  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2471  tyrosine recombinase XerC subunit  25.16 
 
 		 308 aa  43.1  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.9 
 
 		 300 aa  43.1  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6955  integrase family protein  24.86 
 
 		 343 aa  42.7  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011733  PCC7424_5613  hypothetical protein  22.97 
 
 		 273 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.28 
 
 		 299 aa  42.7  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>