64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2175 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2175  phage integrase family protein  100 
 
 		 440 aa  912    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0088  Phage integrase  34.64 
 
 		 427 aa  242  1e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02971  integrase  70.06 
 
 		 186 aa  228  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4011  phage integrase family protein  32.47 
 
 		 433 aa  196  7e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.189192 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02977  integrase  68.97 
 
 		 147 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0515  integrase family protein  24.87 
 
 		 428 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0328  Phage integrase  27.99 
 
 		 394 aa  120  6e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.915662  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1126  phage integrase family protein  28.08 
 
 		 396 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2902  phage integrase family protein  26.58 
 
 		 400 aa  110  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1598  integrase family protein  25.51 
 
 		 396 aa  110  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.527181  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1697  integrase family protein  26.82 
 
 		 401 aa  105  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2951  integrase family protein  25.7 
 
 		 407 aa  99  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.165288  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0317  phage integrase  26.45 
 
 		 398 aa  98.2  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.749428 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4063  integrase family protein  23.69 
 
 		 441 aa  92  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2289  integrase family protein  27.54 
 
 		 412 aa  88.6  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0067  integrase family protein  32.84 
 
 		 385 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.952097  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4603  site-specific recombinase, phage integrase family  23.34 
 
 		 421 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.218061  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0311  integrase family protein  24.29 
 
 		 408 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0588  integrase family protein  29.79 
 
 		 440 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0582  integrase family protein  29.79 
 
 		 440 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.790715  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0557  phage integrase family protein  29.79 
 
 		 440 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.584699  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0242  Tn554-related, transposase A  27.78 
 
 		 519 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3147  Tn554-related, transposase A  27.78 
 
 		 372 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.85236  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3234  integrase family protein  28.43 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0986  Tn554-related, transposase A  29.66 
 
 		 384 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.061254  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4540  transposase A  22.62 
 
 		 361 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2310  phage integrase family protein  23.8 
 
 		 428 aa  65.1  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1466  Tn554-related, transposase A  26.32 
 
 		 370 aa  64.7  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000354684  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1224  Tn554, transposase A  30.83 
 
 		 361 aa  63.5  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0995985  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0043  phage integrase family protein  30.83 
 
 		 361 aa  63.5  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1717  phage integrase family protein  30.83 
 
 		 361 aa  63.5  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1347  Tn554, transposase A  30.83 
 
 		 361 aa  63.5  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.444384  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0043  phage integrase family protein  30.83 
 
 		 361 aa  63.5  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1751  phage integrase family protein  30.83 
 
 		 361 aa  63.5  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.252007  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2506  transposase A  30.83 
 
 		 361 aa  63.5  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5577  phage integrase  30.66 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1704  phage integrase family protein  30.66 
 
 		 364 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5980  phage integrase family protein  30.66 
 
 		 364 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.409193 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3108  integrase family protein  23.91 
 
 		 292 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512092  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1369  phage integrase  26.55 
 
 		 462 aa  54.7  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.502069 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06590  site-specific recombinase, integrase family  27.82 
 
 		 312 aa  53.9  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0527476  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20700  site-specific recombinase, integrase family  27.82 
 
 		 395 aa  53.5  0.000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0218  integrase family protein  27.4 
 
 		 191 aa  52.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0399465 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3734  phage integrase-like SAM-like  20 
 
 		 323 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.654981 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0350  phage integrase family protein  26.95 
 
 		 341 aa  49.3  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000105216  hitchhiker  0.0000498769 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4150  integrase family protein  25.37 
 
 		 373 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.333103 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2147  phage integrase family protein  18.31 
 
 		 367 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1118  tyrosine recombinase XerD  24.36 
 
 		 304 aa  47.4  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0994  site-specific tyrosine recombinase XerS  27.98 
 
 		 359 aa  47  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000205377  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3453  integrase family protein  29.17 
 
 		 189 aa  47  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.590005  normal  0.791222 
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  26.06 
 
 		 308 aa  47  0.0007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  26.29 
 
 		 295 aa  47  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3450  tyrosine recombinase XerD  24.81 
 
 		 322 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1565  integrase family protein  32.47 
 
 		 376 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0206581  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0189  phage integrase family protein  26.29 
 
 		 372 aa  46.2  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0476  tyrosine recombinase XerD  26.22 
 
 		 302 aa  45.8  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0418  integrase family protein  29.6 
 
 		 328 aa  45.1  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0307048  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0222  integrase/recombinase XerC  25.93 
 
 		 299 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4306  integrase/recombinase XerC  24.24 
 
 		 299 aa  45.1  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0358  integrase family protein  26.12 
 
 		 287 aa  44.7  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  26.28 
 
 		 293 aa  43.9  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0727  tyrosine recombinase XerD  27.71 
 
 		 304 aa  43.5  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1189  integrase family protein  23.02 
 
 		 297 aa  43.5  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203109  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.19 
 
 		 299 aa  43.1  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>