69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0110 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0110  integrase family protein  100 
 
 		 338 aa  697    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1403  integrase family protein  49.41 
 
 		 335 aa  342  5e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0467  integrase domain protein SAM domain protein  45.24 
 
 		 336 aa  287  2e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.486802 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0155  integrase-like protein  42.74 
 
 		 349 aa  285  5.999999999999999e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.650609 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0965  integrase family protein  42.98 
 
 		 351 aa  278  1e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0782339 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1644  integrase family protein  43.28 
 
 		 333 aa  268  8.999999999999999e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.104877 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0789  integrase domain protein SAM domain protein  41.35 
 
 		 351 aa  257  2e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2751  integrase family protein  40.53 
 
 		 368 aa  242  6e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0442  integrase family protein  39.83 
 
 		 340 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.966823 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1699  phage integrase/site-specific recombinase  39.43 
 
 		 345 aa  228  8e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.440946  normal  0.508848 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0295  integrase domain protein SAM domain protein  38.26 
 
 		 347 aa  218  2e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.891563  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0353  integrase family protein  35.69 
 
 		 401 aa  190  2.9999999999999997e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0747  tyrosine recombinase XerD  23.51 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000635712  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  23.38 
 
 		 296 aa  57  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0024  site-specific recombinase  29.44 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.974565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0096  site-specific recombinase  29.44 
 
 		 246 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000182797  decreased coverage  0.0000000000259535 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1317  phage integrase family protein  33.94 
 
 		 325 aa  53.5  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2194  integrase family protein  24.62 
 
 		 317 aa  53.5  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  26.5 
 
 		 300 aa  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3665  integrase family protein  23.84 
 
 		 313 aa  50.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211751 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1585  site-specific recombinase XerD-like  25.48 
 
 		 332 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.264485  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0989  integrase family protein  27.62 
 
 		 292 aa  50.8  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1084  integrase/recombinase XerD, putative  23.97 
 
 		 296 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.636718  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  21.36 
 
 		 295 aa  49.7  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.09 
 
 		 322 aa  49.7  0.00007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2210  integrase family protein  29.3 
 
 		 295 aa  49.3  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241024 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8253  phage integrase family protein  23.67 
 
 		 409 aa  48.9  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.564196  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  23.81 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  21.77 
 
 		 300 aa  48.5  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.53 
 
 		 317 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5115  phage integrase family protein  30.26 
 
 		 304 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.244336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4048  hypothetical protein  24.5 
 
 		 133 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.77 
 
 		 318 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.77 
 
 		 318 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1208  integrase family protein  32.11 
 
 		 363 aa  47  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2471  tyrosine recombinase XerC subunit  22.96 
 
 		 308 aa  47.4  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1316  integrase/recombinase  22.03 
 
 		 306 aa  47  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.718184  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  22.3 
 
 		 305 aa  47  0.0005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.36 
 
 		 318 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  25 
 
 		 310 aa  46.2  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.53 
 
 		 313 aa  46.2  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1227  integrase family protein  21.2 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.842173  decreased coverage  0.000216705 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1279  phage integrase family protein  26.84 
 
 		 323 aa  45.8  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0644752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3245  phage integrase family protein  26.32 
 
 		 312 aa  45.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676462  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0170  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.32 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5577  phage integrase  32.14 
 
 		 344 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0422  integrase family protein  27.4 
 
 		 316 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0110  integrase family protein  20.78 
 
 		 324 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126491  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5980  phage integrase family protein  32.14 
 
 		 364 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.409193 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1704  phage integrase family protein  32.14 
 
 		 364 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  19.86 
 
 		 295 aa  45.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  26.7 
 
 		 318 aa  44.3  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5368  integrase family protein  22.26 
 
 		 386 aa  44.3  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.196734  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  24.76 
 
 		 301 aa  44.3  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  24.55 
 
 		 295 aa  44.7  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  24.71 
 
 		 307 aa  44.7  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  35.06 
 
 		 306 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  23.81 
 
 		 292 aa  43.9  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  22.22 
 
 		 295 aa  43.9  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  20.73 
 
 		 296 aa  43.5  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  24.3 
 
 		 297 aa  43.1  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2825  integrase domain protein SAM domain protein  22.99 
 
 		 269 aa  43.1  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  27.66 
 
 		 304 aa  43.1  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3506  phage integrase family protein  32.23 
 
 		 313 aa  43.1  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524614  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4725  phage integrase family protein  33.9 
 
 		 375 aa  42.7  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5548  integrase family protein  24 
 
 		 289 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1383  integrase family protein  20 
 
 		 299 aa  42.7  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00162011  normal  0.640047 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  22.39 
 
 		 308 aa  42.4  0.01  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0746  Phage integrase  23.61 
 
 		 326 aa  42.7  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>