26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0746 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0746  Phage integrase  100 
 
 		 326 aa  661    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4936  phage integrase  69.85 
 
 		 326 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0598447  hitchhiker  0.0000000940352 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0686  phage integrase  69.44 
 
 		 326 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00180883  unclonable  0.0000000000000101632 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4608  phage integrase family protein  68.92 
 
 		 326 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00168393 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0938  hypothetical protein  36.36 
 
 		 307 aa  175  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.404777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1587  phage integrase family protein  33.43 
 
 		 321 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0833  hypothetical protein  28.43 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1324  hypothetical protein  25.16 
 
 		 306 aa  93.2  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.12189  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01684  hypothetical protein  26.1 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3859  putative integrase  33.33 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0627  putative integrase  32.29 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2404  hypothetical protein  31.43 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1013  hypothetical protein  30.49 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1048  hypothetical protein  30.49 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2945  phage integrase  24.49 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  2.79215e-44  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5432  hypothetical protein  25.08 
 
 		 411 aa  56.6  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4962  hypothetical protein  28.21 
 
 		 487 aa  56.2  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160649 
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4043  putative integrase  36.57 
 
 		 287 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1553  hypothetical protein  28.21 
 
 		 487 aa  55.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.774815 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2496  hypothetical protein  27.34 
 
 		 298 aa  54.3  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52320  integrase  41.18 
 
 		 287 aa  50.4  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.554417  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4165  phage integrase, N-terminal SAM-like protein  32.86 
 
 		 386 aa  49.7  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.503266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4486  hypothetical protein  29.71 
 
 		 534 aa  48.1  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0361  Phage integrase  28.57 
 
 		 318 aa  43.9  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6273  helix-turn-helix, Fis-type  26.69 
 
 		 384 aa  43.5  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0110  integrase family protein  23.61 
 
 		 338 aa  42.7  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>