31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4486 on replicon NC_007901
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007901  Rfer_4486  hypothetical protein  100 
 
 		 534 aa  1112    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4770  hypothetical protein  28.11 
 
 		 488 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.189721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1553  hypothetical protein  30.29 
 
 		 487 aa  107  8e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.774815 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2531  Phage integrase, N-terminal SAM-like  27.49 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.335158 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4962  hypothetical protein  28.28 
 
 		 487 aa  102  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3693  hypothetical protein  28.97 
 
 		 299 aa  90.1  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.713079  normal  0.792602 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5221  transcriptional regulator, Fis family  30.6 
 
 		 395 aa  87.8  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.766336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1557  transcriptional regulator, Fis family  30.6 
 
 		 395 aa  87.8  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6273  helix-turn-helix, Fis-type  30.62 
 
 		 384 aa  84.3  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4165  phage integrase, N-terminal SAM-like protein  28.81 
 
 		 386 aa  84  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.503266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4349  phage integrase family protein  28.27 
 
 		 429 aa  83.6  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5579  Fis family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2218  hypothetical protein  27.27 
 
 		 403 aa  78.6  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6537  Fis family transcriptional regulator  30 
 
 		 380 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1599  hypothetical protein  29.57 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.920348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5432  hypothetical protein  30.18 
 
 		 411 aa  71.2  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4043  putative integrase  26.33 
 
 		 287 aa  67  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1048  hypothetical protein  27.4 
 
 		 299 aa  57  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1013  hypothetical protein  27.4 
 
 		 299 aa  57  0.0000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52320  integrase  28.21 
 
 		 287 aa  57  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.554417  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3859  putative integrase  26.74 
 
 		 305 aa  56.6  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4608  phage integrase family protein  29.08 
 
 		 326 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00168393 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4936  phage integrase  29.28 
 
 		 326 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0598447  hitchhiker  0.0000000940352 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0361  Phage integrase  28.02 
 
 		 318 aa  49.3  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0746  Phage integrase  29.71 
 
 		 326 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2404  hypothetical protein  30.41 
 
 		 300 aa  45.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0627  putative integrase  23.88 
 
 		 288 aa  45.4  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0833  hypothetical protein  26.04 
 
 		 298 aa  45.1  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2794  phage integrase family protein  27.54 
 
 		 320 aa  44.7  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1587  phage integrase family protein  25 
 
 		 321 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0938  hypothetical protein  28.65 
 
 		 307 aa  44.3  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.404777  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>