37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5579 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6537  Fis family transcriptional regulator  84.84 
 
 
380 aa  639    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5579  Fis family transcriptional regulator  100 
 
 
376 aa  763    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6273  helix-turn-helix, Fis-type  50.39 
 
 
384 aa  338  9.999999999999999e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5221  transcriptional regulator, Fis family  50 
 
 
395 aa  325  1e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.766336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1557  transcriptional regulator, Fis family  50 
 
 
395 aa  325  1e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4770  hypothetical protein  31.91 
 
 
488 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.189721  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4165  phage integrase, N-terminal SAM-like protein  33.66 
 
 
386 aa  139  8.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.503266  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1553  hypothetical protein  32.12 
 
 
487 aa  137  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.774815 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4962  hypothetical protein  31.46 
 
 
487 aa  136  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.160649 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1599  hypothetical protein  33.03 
 
 
376 aa  134  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.920348  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2531  Phage integrase, N-terminal SAM-like  32.58 
 
 
399 aa  129  9.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.335158 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2218  hypothetical protein  31.73 
 
 
403 aa  123  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52320  integrase  33.33 
 
 
287 aa  115  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.554417  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3693  hypothetical protein  28.97 
 
 
299 aa  105  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.713079  normal  0.792602 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5432  hypothetical protein  30.89 
 
 
411 aa  105  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3859  putative integrase  30.72 
 
 
305 aa  100  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4349  phage integrase family protein  28.39 
 
 
429 aa  99.8  8e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4043  putative integrase  29.17 
 
 
287 aa  93.6  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0627  putative integrase  27.87 
 
 
288 aa  92.8  9e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2496  hypothetical protein  30.42 
 
 
298 aa  86.3  8e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4486  hypothetical protein  27.97 
 
 
534 aa  82  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2404  hypothetical protein  29.89 
 
 
300 aa  82  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1048  hypothetical protein  29.43 
 
 
299 aa  80.1  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1013  hypothetical protein  29.43 
 
 
299 aa  80.1  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1587  phage integrase family protein  31.48 
 
 
321 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01684  hypothetical protein  26.13 
 
 
337 aa  60.8  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2375  hypothetical protein  25.91 
 
 
258 aa  57.4  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3743  hypothetical protein  32.89 
 
 
162 aa  55.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.786232 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0833  hypothetical protein  28.33 
 
 
298 aa  54.3  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0938  hypothetical protein  31.51 
 
 
307 aa  50.4  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.404777  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2495  hypothetical protein  25 
 
 
269 aa  50.4  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2945  phage integrase  25.1 
 
 
316 aa  50.1  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  2.79215e-44  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0361  Phage integrase  24.49 
 
 
318 aa  50.1  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010858  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1324  hypothetical protein  27.1 
 
 
306 aa  46.6  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.12189  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2034  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  75 
 
 
449 aa  44.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0792682  normal  0.101595 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2379  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  73.33 
 
 
446 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.373235  normal  0.0399931 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0390  hypothetical protein  23.08 
 
 
295 aa  42.7  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.644255 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>