36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0390 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0390  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  606  9.999999999999999e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.644255 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4062  hypothetical protein  83.28 
 
 		 299 aa  525  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00820855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4127  hypothetical protein  84.75 
 
 		 295 aa  518  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3697  hypothetical protein  61.17 
 
 		 296 aa  383  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.409883  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0686  hypothetical protein  57.63 
 
 		 295 aa  360  2e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3710  hypothetical protein  51.19 
 
 		 293 aa  317  2e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3551  putative DNA-binding prophage protein  50.51 
 
 		 293 aa  305  5.0000000000000004e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.731152  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1364  putative DNA-binding prophage protein  48.46 
 
 		 295 aa  293  3e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.219092  hitchhiker  0.00163149 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1655  hypothetical protein  48.1 
 
 		 294 aa  289  3e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.313803  hitchhiker  0.00105289 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1668  hypothetical protein  48.1 
 
 		 294 aa  289  4e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.54325 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2096  DNA-binding prophage protein  48.11 
 
 		 290 aa  285  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2936  DNA-binding prophage protein  47.1 
 
 		 291 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000003808 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0908  hypothetical protein  42.76 
 
 		 166 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2225  putative branched chain amino acid transport protein  40.62 
 
 		 232 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.894087  normal  0.251816 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3746  hypothetical protein  27.24 
 
 		 365 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.864232  normal  0.363371 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0627  putative integrase  26.95 
 
 		 288 aa  69.7  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0684  hypothetical protein  31.53 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0361  Phage integrase  25.19 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4043  putative integrase  26.06 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2375  hypothetical protein  27.5 
 
 		 258 aa  57  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0312  DNA-binding prophage protein  48.21 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0632325  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3693  hypothetical protein  22.08 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.713079  normal  0.792602 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1415  integrase family protein  23.53 
 
 		 316 aa  53.1  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1176  phage integrase family protein  24.35 
 
 		 349 aa  53.1  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.204113  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1553  hypothetical protein  24.04 
 
 		 487 aa  47.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.774815 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0499  phage integrase family protein  24.39 
 
 		 285 aa  47.8  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0008  phage integrase family protein  23.28 
 
 		 325 aa  46.2  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174514  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1487  phage integrase family protein  22.71 
 
 		 372 aa  46.2  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4962  hypothetical protein  24.25 
 
 		 487 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160649 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2496  hypothetical protein  24.29 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2794  phage integrase family protein  22.49 
 
 		 320 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4851  integrase family protein  27.4 
 
 		 294 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6537  Fis family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 380 aa  43.1  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5579  Fis family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 376 aa  42.7  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1587  phage integrase family protein  25.67 
 
 		 321 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2945  phage integrase  23.42 
 
 		 316 aa  42.4  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  2.79215e-44  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>